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One plasmid selection system for the rapid evolution of aminoacyl-tRNA synthetases

Melancon, C.E.; Schultz, P.G.; Bioorg. Med. Chem. Lett. 19, 3845-3847 (2009)

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Application
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biotechnology
a rapid, straightforward, one plasmid dual positive/negative selection system for the evolution of aminoacyl-tRNA synthetases with altered specifities in Escherichia coli is developed
Methanocaldococcus jannaschii
Natural Substrates/ Products (Substrates)
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Methanocaldococcus jannaschii
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Organism
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Commentary
Textmining
Methanocaldococcus jannaschii
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Products
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Methanocaldococcus jannaschii
AMP + diphosphate + L-tyrosyl-tRNATyr
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a variant of the Methanococcus jannaschii tyrosyl synthetase that selectively incorporates para-iodophenylalanine in response to an amber stop codon is identified
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Methanocaldococcus jannaschii
Application (protein specific)
Application
Commentary
Organism
biotechnology
a rapid, straightforward, one plasmid dual positive/negative selection system for the evolution of aminoacyl-tRNA synthetases with altered specifities in Escherichia coli is developed
Methanocaldococcus jannaschii
Cofactor (protein specific)
Cofactor
Commentary
Organism
Structure
ATP
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Methanocaldococcus jannaschii
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Natural Substrates
Organism
Commentary (Nat. Sub.)
Natural Products
Commentary (Nat. Pro.)
Organism (Nat. Pro.)
Reversibility
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Methanocaldococcus jannaschii
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AMP + diphosphate + L-tyrosyl-tRNATyr
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Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
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Organism
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a variant of the Methanococcus jannaschii tyrosyl synthetase that selectively incorporates para-iodophenylalanine in response to an amber stop codon is identified
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Organic Solvent Stability (protein specific)
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Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
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Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
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Structural plasticity of an am ...
Methanocaldococcus jannaschii
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6483-6488
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4805-4816
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Mimivirus TyrRS: preliminary s ...
Mimivirus
Acta Crystallogr. Sect. F
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Neurospora crassa
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Iwaki
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Expression, purification, and ...
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Yaremchuk
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Comparison of the catalytic ro ...
Geobacillus stearothermophilus, Homo sapiens
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28394-28399
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An engineered Escherichia coli ...
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Conserved amino acids near the ...
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Changing the amino acid specif ...
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Crystal structure of Staphyloc ...
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Stabilization of the transitio ...
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Chloride affects the interacti ...
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Brown
Molecular recognition of tyros ...
Geobacillus stearothermophilus, Staphylococcus aureus
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Park
Dimeric tyrosyl-tRNA synthetas ...
Geobacillus stearothermophilus
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Analysis of the role of the KM ...
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Thiobacillus ferrooxydans tyro ...
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Reaction of modified and unmod ...
Geobacillus stearothermophilus
Biochemistry
32
5312-5320
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First
Involvement of threonine 234 i ...
Geobacillus stearothermophilus
Biochemistry
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13644-13650
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15
First
Mutation of lysine 233 to alan ...
Geobacillus stearothermophilus
Biochemistry
32
13651-13657
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16
First
Mutational and kinetic analysi ...
Geobacillus stearothermophilus
Biochemistry
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13658-13663
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De Prat
Modification of amino acid spe ...
Geobacillus stearothermophilus
FEBS Lett.
318
167-171
1993
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Wells
Kinetic and thermodynamic prop ...
Geobacillus stearothermophilus
Biochemistry
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5151-5156
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Fothergill
Correlations between kinetics ...
Geobacillus stearothermophilus
Biochemistry
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5157-5164
1991
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Garcia
Metal ion dependence of phosph ...
Geobacillus stearothermophilus
Biochemistry
29
1643-1648
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6
Ward
Asymmetry of tyrosyl-tRNA synt ...
Geobacillus stearothermophilus
Biochemistry
27
1041-1049
1988
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Ward
Tyrosyl-tRNA synthetase acts a ...
Geobacillus stearothermophilus
Biochemistry
27
5525-5530
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Chousterman
Tyrosyl-tRNA synthetase of Esc ...
Escherichia coli
Eur. J. Biochem.
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46-50
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Brick
Structure of tyrosyl-tRNA synt ...
Saccharomyces cerevisiae
J. Mol. Biol.
208
83-98
1988
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Freist
Tyrosyl-tRNA synthetase from b ...
Saccharomyces cerevisiae
Eur. J. Biochem.
177
425-433
1988
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Quivy
Tyrosyl-tRNA synthetase from w ...
Triticum aestivum
J. Biol. Chem.
263
15277-15281
1988
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Jones
Reversible dissociation of dim ...
Geobacillus stearothermophilus
Biochemistry
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5852-5857
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5
Brown
-
Crystal structure of two facti ...
Geobacillus stearothermophilus
Biochem. Soc. Trans.
14
1228-1229
1985
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Bhat
Tyrosyl-tRNA synthetase forms ...
Geobacillus stearothermophilus
J. Mol. Biol.
158
699-709
1982
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Grosse
The binding of tyrosinyl-5'-AM ...
Escherichia coli
Nucleic Acids Res.
6
1631-1638
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Deak
Purification and some properti ...
Rattus norvegicus
Biochim. Biophys. Acta
526
626-634
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Locy
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Purification and characterizat ...
Glycine max
Phytochemistry
17
19-27
1978
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Monteilhet
Binding of tyrosine, adenosine ...
Geobacillus stearothermophilus
J. Mol. Biol.
122
407-417
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50
Faulhammer
Tyrosyl-tRNA synthetase from b ...
Saccharomyces cerevisiae
Eur. J. Biochem.
75
561-570
1977
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Prasada Rao
Purification and properies of ...
Rattus norvegicus
Nucleic Acids Res.
4
3887-3900
1977
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Warner
Mechanism of suppression in Dr ...
Drosophila melanogaster
Can. J. Biochem.
54
650-656
1976
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Irwin
The crystal structure of tyros ...
Geobacillus stearothermophilus
J. Mol. Biol.
105
577-586
1976
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469
Freist
Valyl-tRNA, isoleucyl-tRNA and ...
Saccharomyces cerevisiae
Eur. J. Biochem.
66
493-497
1976
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45
Jakes
Tyrosyl-tRNA synthetase from E ...
Escherichia coli
Biochemistry
14
3344-3350
1975
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46
Bruton
Gram-scale purification of met ...
Escherichia coli
Eur. J. Biochem.
59
327-333
1975
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9
Beikirch
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Tyrosyl-tRNA synthetase ...
Saccharomyces cerevisiae
Methods Enzymol.
34B
503-506
1974
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