BRENDA - Enzyme Database
show all sequences of 3.1.4.1

Two low Km hydrolytic activities on dinucleoside 5',5'''-P1,P4-tetraphosphates in rat liver. Characterization as the specific dinucleoside tetraphosphatase and a phosphodiesterase-I-like enzyme

Cameselle, J.C.; Costas, M.J.; Sillero, M.A.G.; Sillero, A.; J. Biol. Chem. 259, 2879-2885 (1984)

Data extracted from this reference:

Inhibitors
Inhibitors
Commentary
Organism
Structure
2-mercaptoethanol
-
Rattus norvegicus
EDTA
inactivation reversed by Zn2+
Rattus norvegicus
glutathione
-
Rattus norvegicus
guanosine 5'-tetraphosphate
competitive
Rattus norvegicus
L-cysteine
-
Rattus norvegicus
Mn2+
inhibition at higher concentration, 0.1-0.5 mM
Rattus norvegicus
KM Value [mM]
KM Value [mM]
KM Value Maximum [mM]
Substrate
Commentary
Organism
Structure
0.008
-
diadenosine 5',5'''-P1,P4-tetraphosphate
-
Rattus norvegicus
0.011
-
diadenosine 5',5'''-P1,P3-triphosphate
-
Rattus norvegicus
0.012
-
diguanosine 5',5'''-P1,P4-tetraphosphate
-
Rattus norvegicus
Localization
Localization
Commentary
Organism
GeneOntology No.
Textmining
cytoplasmic membrane
-
Rattus norvegicus
-
-
Metals/Ions
Metals/Ions
Commentary
Organism
Structure
Ca2+
-
Rattus norvegicus
divalent cations
required for activity
Rattus norvegicus
Mg2+
-
Rattus norvegicus
Mn2+
activation with low concentrations, 0.05 mM
Rattus norvegicus
Zn2+
required for activity
Rattus norvegicus
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight Maximum [Da]
Commentary
Organism
additional information
-
-
Rattus norvegicus
Organism
Organism
Primary Accession No. (UniProt)
Commentary
Textmining
Rattus norvegicus
-
-
-
Purification (Commentary)
Commentary
Organism
-
Rattus norvegicus
Source Tissue
Source Tissue
Commentary
Organism
Textmining
liver
-
Rattus norvegicus
-
Substrates and Products (Substrate)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
adenosine 5'-P1-tetraphospho-P4-5'''-adenosine + H2O
-
209901
Rattus norvegicus
AMP + ATP
-
-
-
?
diadenosine 5',5'''-P1,P3-triphosphate + H2O
-
209901
Rattus norvegicus
AMP + ADP
-
-
-
-
dinucleoside tetraphosphate + H2O
-
209901
Rattus norvegicus
?
-
-
-
?
additional information
no activity with cAMP
209901
Rattus norvegicus
?
-
-
-
-
additional information
no activity with p-nitrophenylthymidine 3'-phosphate
209901
Rattus norvegicus
?
-
-
-
-
additional information
broad substrate specificity
209901
Rattus norvegicus
?
-
-
-
-
p-nitrophenylthymidine 5'-phosphate + H2O
-
209901
Rattus norvegicus
5'-TMP + p-nitrophenol
-
-
-
?
pH Optimum
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
8.5
-
-
Rattus norvegicus
pH Range
pH Minimum
pH Maximum
Commentary
Organism
7
-
at pH 7.0 less than 10% activity of that at pH 8.5
Rattus norvegicus
Inhibitors (protein specific)
Inhibitors
Commentary
Organism
Structure
2-mercaptoethanol
-
Rattus norvegicus
EDTA
inactivation reversed by Zn2+
Rattus norvegicus
glutathione
-
Rattus norvegicus
guanosine 5'-tetraphosphate
competitive
Rattus norvegicus
L-cysteine
-
Rattus norvegicus
Mn2+
inhibition at higher concentration, 0.1-0.5 mM
Rattus norvegicus
KM Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM]
KM Value Maximum [mM]
Substrate
Commentary
Organism
Structure
0.008
-
diadenosine 5',5'''-P1,P4-tetraphosphate
-
Rattus norvegicus
0.011
-
diadenosine 5',5'''-P1,P3-triphosphate
-
Rattus norvegicus
0.012
-
diguanosine 5',5'''-P1,P4-tetraphosphate
-
Rattus norvegicus
Localization (protein specific)
Localization
Commentary
Organism
GeneOntology No.
Textmining
cytoplasmic membrane
-
Rattus norvegicus
-
-
Metals/Ions (protein specific)
Metals/Ions
Commentary
Organism
Structure
Ca2+
-
Rattus norvegicus
divalent cations
required for activity
Rattus norvegicus
Mg2+
-
Rattus norvegicus
Mn2+
activation with low concentrations, 0.05 mM
Rattus norvegicus
Zn2+
required for activity
Rattus norvegicus
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight Maximum [Da]
Commentary
Organism
additional information
-
-
Rattus norvegicus
Purification (Commentary) (protein specific)
Commentary
Organism
-
Rattus norvegicus
Source Tissue (protein specific)
Source Tissue
Commentary
Organism
Textmining
liver
-
Rattus norvegicus
-
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
adenosine 5'-P1-tetraphospho-P4-5'''-adenosine + H2O
-
209901
Rattus norvegicus
AMP + ATP
-
-
-
?
diadenosine 5',5'''-P1,P3-triphosphate + H2O
-
209901
Rattus norvegicus
AMP + ADP
-
-
-
-
dinucleoside tetraphosphate + H2O
-
209901
Rattus norvegicus
?
-
-
-
?
additional information
no activity with cAMP
209901
Rattus norvegicus
?
-
-
-
-
additional information
no activity with p-nitrophenylthymidine 3'-phosphate
209901
Rattus norvegicus
?
-
-
-
-
additional information
broad substrate specificity
209901
Rattus norvegicus
?
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p-nitrophenylthymidine 5'-phosphate + H2O
-
209901
Rattus norvegicus
5'-TMP + p-nitrophenol
-
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?
pH Optimum (protein specific)
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
8.5
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Rattus norvegicus
pH Range (protein specific)
pH Minimum
pH Maximum
Commentary
Organism
7
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at pH 7.0 less than 10% activity of that at pH 8.5
Rattus norvegicus
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organims
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Activating Compound
Application
Cloned(Commentary)
Crystallization (Commentary)
Engineering
General Stability
Inhibitors
KM Value [mM]
Localization
Metals/Ions
Molecular Weight [Da]
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Organic Solvent Stability
Organism
Oxidation Stability
Posttranslational Modification
Purification (Commentary)
Reaction
Renatured (Commentary)
Source Tissue
Specific Activity [micromol/min/mg]
Storage Stability
Substrates and Products (Substrate)
Subunits
Temperature Optimum [°C]
Temperature Range [°C]
Temperature Stability [°C]
Turnover Number [1/s]
pH Optimum
pH Range
pH Stability
Cofactor
Ki Value [mM]
pI Value
IC50 Value
Activating Compound (protein specific)
Application (protein specific)
Cloned(Commentary) (protein specific)
Cofactor (protein specific)
Crystallization (Commentary) (protein specific)
Engineering (protein specific)
General Stability (protein specific)
IC50 Value (protein specific)
Inhibitors (protein specific)
Ki Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM] (protein specific)
Localization (protein specific)
Metals/Ions (protein specific)
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Organic Solvent Stability (protein specific)
Oxidation Stability (protein specific)
Posttranslational Modification (protein specific)
Purification (Commentary) (protein specific)
Renatured (Commentary) (protein specific)
Source Tissue (protein specific)
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Storage Stability (protein specific)
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Subunits (protein specific)
Temperature Optimum [°C] (protein specific)
Temperature Range [°C] (protein specific)
Temperature Stability [°C] (protein specific)
Turnover Number [1/s] (protein specific)
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pH Range (protein specific)
pH Stability (protein specific)
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Expression
General Information
General Information (protein specific)
Expression (protein specific)
KCat/KM [mM/s]
KCat/KM [mM/s] (protein specific)
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Li-Zhulanov
A novel class of tyrosyl-DNA ...
Homo sapiens
Molecules
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E2468
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Khomenko
New inhibitors of tyrosyl-DNA ...
Homo sapiens
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5573-5581
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Cuya
Dysregulated human tyrosyl-DN ...
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Oncotarget
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Nale
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Synthesis of tyrosyl-DNA phos ...
Homo sapiens
Tetrahedron Lett.
57
2652-2654
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Zakharenko
Synthesis and biological eval ...
Homo sapiens
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Bautista Nino
Phosphodiesterase 1 regulatio ...
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Clin. Sci.
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Comeaux
Tyrosyl-DNA phosphodiesterase ...
Saccharomyces cerevisiae
J. Biol. Chem.
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Tyrosyl-DNA phosphodiesterase ...
Canis lupus familiaris, Drosophila melanogaster, Gallus gallus, Homo sapiens, Mus musculus, Rattus norvegicus, Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces cerevisiae ATCC 204508
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The mechanism of human tyrosyl ...
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Murai
Tyrosyl-DNA phosphodiesterase ...
Gallus gallus, Homo sapiens
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Crotalus adamanteus
Anal. Biochem.
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229-235
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Henz
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Rattus norvegicus
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916-923
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Metal requirements and phospho ...
Arabidopsis thaliana
Biochemistry
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Ruecker
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247-254
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Asensio
Biochemical analysis of ecto-n ...
Rattus norvegicus
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Keppetipola
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Hungateiclostridium thermocellum
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Structural and biochemical cha ...
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Ecto-nucleotide pyrophosphatas ...
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Aoyagi
Preparation of mixed alginate ...
Catharanthus roseus
Biotechnol. Lett.
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Dhule
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Purification and characterizat ...
Hordeum vulgare
Process Biochem.
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Singh
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Factors modulating alkaline ph ...
Anabaena oryzae
World J. Microbiol. Biotechnol.
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Enzyme genomics: Application o ...
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Takebayashi
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Metal ion induced allosteric t ...
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Chem. Commun. (Camb.)
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Chen
Structural and Functional Char ...
Methanocaldococcus jannaschii
J. Biol. Chem.
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5'-Phosphodiesterase (5'-PDE) ...
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Oligonucleotides incorporating ...
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1274-1285
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Garcia-Nieto
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Evaluation of phosphodiesteras ...
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Biochemical evidence for an ec ...
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Characterization of fetal seru ...
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Regulation of purified hepatic ...
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Characterization and control o ...
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Wang
Purification and characterizat ...
Hordeum vulgare
Biochem. Mol. Biol. Int.
29
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Purification and amino acid mi ...
Bos taurus
Biochem. Mol. Biol. Int.
29
579-586
1993
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208373
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Characterization of over-expre ...
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Cell Biochem. Funct.
11
271-277
1993
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208376
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Identification and characteriz ...
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1993
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1991
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53
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1989
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208356
Fukazawa
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Bos taurus, Homo sapiens, Mus musculus
Biochim. Biophys. Acta
966
99-106
1988
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Phosphodiesterase I in human u ...
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J. Biochem.
102
359-367
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208359
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Production of 5'-ribonucleotid ...
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136
517-522
1987
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208360
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Three diadenosine 5',5'''-P1,P ...
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248
502-515
1986
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130
1072-1077
1985
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1985
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208385
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260
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Yano
Purification and properties of ...
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98
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Hawley
A comparative kinetic analysis ...
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Enzyme
32
105-109
1984
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208393
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Purification and properties of ...
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209901
Cameselle
Two low Km hydrolytic activiti ...
Rattus norvegicus
J. Biol. Chem.
259
2879-2885
1984
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Jakubowski
Enzymes hydrolyzing ApppA and/ ...
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J. Biol. Chem.
258
9982-9989
1983
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208369
Hawley
The synthesis of 4-methylumbel ...
Bos taurus
Anal. Biochem.
129
522-528
1983
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208362
Fitt
Separation and purification of ...
Halobacterium salinarum
Biochem. J.
181
347-353
1979
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208363
Fujimoto
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Properties of 5'-phosphodieste ...
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Agric. Biol. Chem.
41
737-744
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208387
Kelly
Enzymic hydrolysis of phosphon ...
Bos taurus
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1102-1104
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Kelly
Hydrolysis of phosphonate este ...
Bos taurus
Biochemistry
14
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208392
Wilson
-
Plant nucleases ...
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Annu. Rev. Plant Physiol.
26
187-208
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208364
Felicioli
Characterization of the specif ...
Bacillus subtilis
Biochim. Biophys. Acta
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584-587
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Lerch
Isolation of phosphodiesterase ...
Beta vulgaris
Biochim. Biophys. Acta
258
206-218
1972
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208366
Harvey
Further purification and prope ...
Daucus carota
Biochemistry
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921-925
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208388
Udvardy
Purification and properties of ...
Avena sativa
Biochim. Biophys. Acta
206
392-403
1970
-
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