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show all sequences of 2.1.2.1

Purification and characterization of serine hydroxymethyltransferase from mitochondria of Euglena gracilis z

Sakamoto, M.; Masuda, T.; Yanagimoto, Y.; Nakano, Y.; Kitaoka, S.; Tanigawa, Y.; Biosci. Biotechnol. Biochem. 60, 1941-1944 (1996)
No PubMed abstract available

Data extracted from this reference:

Inhibitors
Inhibitors
Commentary
Organism
Structure
beta-Alanine
-
Euglena gracilis
glycine
-
Euglena gracilis
L-alanine
-
Euglena gracilis
L-alpha,beta-diaminopropionic acid
-
Euglena gracilis
L-amino acids
-
Euglena gracilis
L-cysteine
-
Euglena gracilis
L-methionine
not
Euglena gracilis
L-serine
-
Euglena gracilis
additional information
not: valine, leucine, glutamic acid, 3-hydroxybutyric acid
Euglena gracilis
KM Value [mM]
KM Value [mM]
KM Value Maximum [mM]
Substrate
Commentary
Organism
Structure
0.15
0.9
L-serine
-
Euglena gracilis
65.3
-
L-serine
-
Euglena gracilis
Localization
Localization
Commentary
Organism
GeneOntology No.
Textmining
chloroplast
-
Euglena gracilis
9507
-
cytoplasm
-
Euglena gracilis
5737
-
mitochondrion
-
Euglena gracilis
5739
-
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight Maximum [Da]
Commentary
Organism
44000
-
2 * 44000, SDS-PAGE
Euglena gracilis
88000
-
gel filtration
Euglena gracilis
Organism
Organism
Primary Accession No. (UniProt)
Commentary
Textmining
Euglena gracilis
-
-
-
Euglena gracilis Z
-
-
-
Purification (Commentary)
Commentary
Organism
-
Euglena gracilis
Specific Activity [micromol/min/mg]
Specific Activity Minimum [µmol/min/mg]
Specific Activity Maximum [µmol/min/mg]
Commentary
Organism
additional information
-
-
Euglena gracilis
0.048
-
reaction of L-serine
Euglena gracilis
0.15
-
reaction of L-threonine
Euglena gracilis
1.388
-
reaction of L-allothreonine
Euglena gracilis
Substrates and Products (Substrate)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
L-serine + tetrahydrofolate
-
441437
Euglena gracilis
glycine + 5,10-methylenetetrahydrofolate + H2O
-
441437
Euglena gracilis
-
L-serine + tetrahydrofolate
-
441437
Euglena gracilis Z
glycine + 5,10-methylenetetrahydrofolate + H2O
-
441437
Euglena gracilis Z
-
additional information
no: D-serine
441437
Euglena gracilis
?
-
-
-
-
additional information
no: D-allothreonine
441437
Euglena gracilis
?
-
-
-
-
additional information
no: D-threonine
441437
Euglena gracilis
?
-
-
-
-
additional information
no: D-serine
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Euglena gracilis Z
?
-
-
-
-
additional information
no: D-allothreonine
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Euglena gracilis Z
?
-
-
-
-
additional information
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Euglena gracilis Z
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-
-
-
-
Subunits
Subunits
Commentary
Organism
dimer
2 * 44000, SDS-PAGE
Euglena gracilis
pH Optimum
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
6.8
-
-
Euglena gracilis
Cofactor
Cofactor
Commentary
Organism
Structure
pyridoxal 5'-phosphate
2 mol per mol enzyme
Euglena gracilis
tetrahydrofolate
requirement with L-serine or L-2-methylserine as substrate
Euglena gracilis
Cofactor (protein specific)
Cofactor
Commentary
Organism
Structure
pyridoxal 5'-phosphate
2 mol per mol enzyme
Euglena gracilis
tetrahydrofolate
requirement with L-serine or L-2-methylserine as substrate
Euglena gracilis
Inhibitors (protein specific)
Inhibitors
Commentary
Organism
Structure
beta-Alanine
-
Euglena gracilis
glycine
-
Euglena gracilis
L-alanine
-
Euglena gracilis
L-alpha,beta-diaminopropionic acid
-
Euglena gracilis
L-amino acids
-
Euglena gracilis
L-cysteine
-
Euglena gracilis
L-methionine
not
Euglena gracilis
L-serine
-
Euglena gracilis
additional information
not: valine, leucine, glutamic acid, 3-hydroxybutyric acid
Euglena gracilis
KM Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM]
KM Value Maximum [mM]
Substrate
Commentary
Organism
Structure
0.15
0.9
L-serine
-
Euglena gracilis
65.3
-
L-serine
-
Euglena gracilis
Localization (protein specific)
Localization
Commentary
Organism
GeneOntology No.
Textmining
chloroplast
-
Euglena gracilis
9507
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cytoplasm
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Euglena gracilis
5737
-
mitochondrion
-
Euglena gracilis
5739
-
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight Maximum [Da]
Commentary
Organism
44000
-
2 * 44000, SDS-PAGE
Euglena gracilis
88000
-
gel filtration
Euglena gracilis
Purification (Commentary) (protein specific)
Commentary
Organism
-
Euglena gracilis
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Specific Activity Minimum [µmol/min/mg]
Specific Activity Maximum [µmol/min/mg]
Commentary
Organism
additional information
-
-
Euglena gracilis
0.048
-
reaction of L-serine
Euglena gracilis
0.15
-
reaction of L-threonine
Euglena gracilis
1.388
-
reaction of L-allothreonine
Euglena gracilis
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
L-serine + tetrahydrofolate
-
441437
Euglena gracilis
glycine + 5,10-methylenetetrahydrofolate + H2O
-
441437
Euglena gracilis
-
L-serine + tetrahydrofolate
-
441437
Euglena gracilis Z
glycine + 5,10-methylenetetrahydrofolate + H2O
-
441437
Euglena gracilis Z
-
additional information
no: D-serine
441437
Euglena gracilis
?
-
-
-
-
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441437
Euglena gracilis
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no: D-threonine
441437
Euglena gracilis
?
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-
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441437
Euglena gracilis Z
?
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441437
Euglena gracilis Z
?
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-
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additional information
no: D-threonine
441437
Euglena gracilis Z
?
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-
Subunits (protein specific)
Subunits
Commentary
Organism
dimer
2 * 44000, SDS-PAGE
Euglena gracilis
pH Optimum (protein specific)
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
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Organism
6.8
-
-
Euglena gracilis
Other publictions for EC 2.1.2.1
No.
1st author
Pub Med
title
organims
journal
volume
pages
year
Activating Compound
Application
Cloned(Commentary)
Crystallization (Commentary)
Engineering
General Stability
Inhibitors
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Localization
Metals/Ions
Molecular Weight [Da]
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Organic Solvent Stability
Organism
Oxidation Stability
Posttranslational Modification
Purification (Commentary)
Reaction
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Source Tissue
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Storage Stability
Substrates and Products (Substrate)
Subunits
Temperature Optimum [°C]
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Temperature Stability [°C]
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pH Optimum
pH Range
pH Stability
Cofactor
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pI Value
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Engineering (protein specific)
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IC50 Value (protein specific)
Inhibitors (protein specific)
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KM Value [mM] (protein specific)
Localization (protein specific)
Metals/Ions (protein specific)
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Organic Solvent Stability (protein specific)
Oxidation Stability (protein specific)
Posttranslational Modification (protein specific)
Purification (Commentary) (protein specific)
Renatured (Commentary) (protein specific)
Source Tissue (protein specific)
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Storage Stability (protein specific)
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Subunits (protein specific)
Temperature Optimum [°C] (protein specific)
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pH Range (protein specific)
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KCat/KM [mM/s] (protein specific)
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Huang
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Characterization of a novel se ...
Arthrobacter sp., Arthrobacter sp. MCCC 1A05493
Ann. Microbiol.
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Maenpuen
Kinetic mechanism and the rate ...
Plasmodium vivax
J. Biol. Chem.
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Positive correlation between e ...
Homo sapiens
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Angelucci
The crystal structure of archa ...
Methanocaldococcus jannaschii, Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661
Proteins
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Plasmodium vivax
Acta Crystallogr. Sect. D
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A novel serine hydroxymethyltr ...
Alcanivorax sp.
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Homo sapiens
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Mechanism for folate-independe ...
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215-220
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157
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Dynamic subcellular localizati ...
Plasmodium falciparum
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Structural stability of the co ...
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A UV-responsive internal ribos ...
Homo sapiens
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The serine hydroxymethyltransf ...
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Catalytic and ligand-binding c ...
Plasmodium falciparum
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Mus musculus
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Cloning, DNA shuffling and exp ...
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Vatsyayan
Molecular cloning and biochemi ...
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Protein Expr. Purif.
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Characterization of the AlkS/P ...
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Chang
Serine hydroxymethyltransferas ...
Danio rerio
Drug Metab. Dispos.
35
2127-2137
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673412
Mukherjee
Identification and biochemical ...
Trichomonas vaginalis
Eukaryot. Cell
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Gagnon
Stage specific gene expression ...
Leishmania infantum, Leishmania major
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Antisense reduction of serine ...
Solanum tuberosum
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Chang
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Chaturvedi
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Paiardini
Structural plasticity of therm ...
Aeropyrum pernix, Aquifex aeolicus, Archaeoglobus fulgidus, Methanocaldococcus jannaschii, Methanothermobacter marburgensis, Methanothermobacter thermautotrophicus, Pyrococcus abyssi, Pyrococcus horikoshii, Saccharolobus solfataricus, Thermotoga maritima
Proteins
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122-134
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Trivedi
Crystal structure of binary an ...
Geobacillus stearothermophilus
J. Biol. Chem.
277
17161-17169
2002
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-
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1
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-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
441432
Jala
Overexpression and characteriz ...
Geobacillus stearothermophilus
J. Biosci.
27
233-242
2002
-
-
1
-
-
-
-
3
-
-
2
1
-
4
-
-
1
1
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-
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4
-
2
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1
-
3
3
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
441424
Contestabile
L-Threonine aldolase, serine h ...
Escherichia coli
Eur. J. Biochem.
268
6508-6525
2001
-
-
1
-
-
-
1
-
-
-
-
-
-
3
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4
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-
-
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-
-
-
-
-
-
441427
Appaji Rao
Molecular organization, cataly ...
Escherichia coli, Homo sapiens, Oryctolagus cuniculus, Ovis aries, Pisum sativum, Saccharomyces cerevisiae
Int. J. Biochem. Cell Biol.
32
405-416
2000
-
6
4
1
-
-
36
-
11
-
-
6
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9
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24
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4
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-
24
11
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
441428
Talwar
-
Role of Pro-297 in the catalyt ...
Ovis aries
Biochem. J.
350
849-853
2000
-
-
1
-
1
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4
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1
2
-
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-
-
-
-
-
-
-
-
441429
Talwar
A change in reaction specifici ...
Ovis aries
Eur. J. Biochem.
267
929-934
2000
-
-
1
-
1
-
-
-
-
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3
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-
-
-
-
-
-
441430
Rao
The role of Glu74 and Tyr82 in ...
Ovis aries
Eur. J. Biochem.
267
5967-5976
2000
-
1
1
-
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-
-
3
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2
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1
1
3
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-
-
441434
Ogawa
Serine hydroxymethyltransferas ...
Cricetulus griseus, Escherichia coli, Homo sapiens, Neurospora crassa, Oryctolagus cuniculus, Ovis aries, Pisum sativum, Rattus norvegicus, Vigna radiata
Int. J. Biochem. Cell Biol.
32
289-301
2000
-
5
4
2
-
-
9
-
-
-
7
9
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5
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9
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-
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7
9
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-
-
-
7
-
34
8
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
441436
Liu
Human cytoplasmic serine hydro ...
Homo sapiens
Biochemistry
39
11523-11531
2000
-
-
1
-
-
-
-
-
2
-
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1
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-
3
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-
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-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
441438
Vatcher
Identification and characteriz ...
Caenorhabditis briggsae, Caenorhabditis elegans
Gene
230
137-144
1999
-
-
2
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
5
-
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2
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-
-
-
-
-
-
-
441423
Di Salvo
Purification and characterizat ...
Oryctolagus cuniculus
Protein Expr. Purif.
13
177-183
1998
-
-
1
-
-
-
-
2
3
-
-
2
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-
-
-
2
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
441433
Liu
Gene cloning, nucleotide seque ...
Escherichia coli
Appl. Environ. Microbiol.
64
549-554
1998
-
-
-
-
-
-
-
-
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-
-
1
-
1
-
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2
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-
-
-
727262
Lin
Investigation of serine hydrox ...
Methanolobus tindarius, Methanosarcina barkeri, Methanosarcina barkeri DSM 804, Methanospirillum hungatei, Methanospirillum hungatei GP1, Methanothrix soehngenii
Can. J. Microbiol.
44
652-656
1998
-
-
-
-
-
-
-
4
-
-
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-
-
-
441422
Fratte
Purification and properties of ...
Saccharolobus solfataricus, Saccharolobus solfataricus P2
J. Bacteriol.
179
7456-7461
1997
-
-
-
-
-
-
2
-
-
-
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-
-
-
441435
Chave
Isolation and characterization ...
Homo sapiens
Biochem. Soc. Trans.
25
53S
1997
-
-
1
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-
-
-
-
-
441426
Brahatheeswaran
Interaction of sheep liver apo ...
Ovis aries
Arch. Biochem. Biophys.
330
363-372
1996
-
-
-
-
-
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-
-
3
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-
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-
-
-
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-
-
-
-
-
-
-
441437
Sakamoto
-
Purification and characterizat ...
Euglena gracilis, Euglena gracilis Z
Biosci. Biotechnol. Biochem.
60
1941-1944
1996
-
-
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-
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9
2
3
-
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-
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-
1
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-
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-
-
-
-
-
441421
Kruschwitz
Expression, purification, and ...
Homo sapiens
Protein Expr. Purif.
6
411-416
1995
-
-
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2
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-
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-
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-
-
-
-
-
-
-
441425
Jagath-Reddy
cDNA cloning, overexpression i ...
Ovis aries
Eur. J. Biochem.
230
533-537
1995
-
-
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-
441390
Ide
Purification of serine hydroxy ...
Geobacillus stearothermophilus
J. Chromatogr.
596
203-209
1992
-
-
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-
-
441409
Sakamoto
-
Purification and characterizat ...
Euglena gracilis, Euglena gracilis Z
Agric. Biol. Chem.
55
2243-2249
1991
-
-
-
-
-
-
8
1
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-
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-
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-
1
-
-
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-
-
-
-
-
-
441417
Malthouse
A comparative study of the kin ...
Bos taurus
Biochem. J.
274
807-812
1991
-
-
-
-
-
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-
1
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-
-
-
441418
Stover
5-Formyltetrahydrofolate polyg ...
Escherichia coli, Oryctolagus cuniculus
J. Biol. Chem.
266
1543-1550
1991
-
-
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-
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-
8
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-
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-
-
-
441405
Strong
Purification and properties of ...
Mus musculus
J. Biol. Chem.
265
12149-12155
1990
-
-
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-
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-
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-
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-
-
-
391984
Bourguignon
Resolution and characterizatio ...
Pisum sativum
Biochem. J.
255
169-178
1988
-
-
-
-
-
-
-
-
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-
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-
-
-
441391
Henricson
-
Serine hydroxymethyltransferas ...
Spinacia oleracea
Physiol. Plant.
74
602-606
1988
-
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-
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-
1
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-
-
-
441398
Masuda
Affinity purification and char ...
Rattus norvegicus
J. Biochem.
101
643-652
1987
-
-
-
-
-
-
8
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-
-
-
-
-
441410
Miyazaki
Purification and characterizat ...
Hyphomicrobium methylovorum
Eur. J. Biochem.
162
533-540
1987
-
-
-
-
-
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