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ATP synthase of chloroplast thylakoid membranes: A more in depth characterization of its ATPase activity

McCarty, R.E.; J. Bioenerg. Biomembr. 37, 289-299 (2005)

Data extracted from this reference:

Activating Compound
Activating Compound
Commentary
Organism
Structure
light
promotes ATP hydrolysis
Spinacia oleracea
sulfite
10 mM stimulates both proton uptake and ATP hydrolysis of Mg2+-ATPase activity of trypsin-treated thylakoids
Spinacia oleracea
Trypsin
elicits higher rates of ATPase activity, Mg2+-ATPase activity of trypsinized thylakoids is only partially inhibited by the uncouplers
Spinacia oleracea
Application
Application
Commentary
Organism
additional information
cleavage of the gamma subunit of the ATP synthase by trypsin prevents inhibition of ATPase activity by the sigma subunit, but only partially overcomes Mg2+-ADP inhibition during assay
Spinacia oleracea
Inhibitors
Inhibitors
Commentary
Organism
Structure
ADP
incubation prior to assay abolishes Mg2+-ATPase activity of reduced thylakoids, has no effect on Mg2+-ATPase activity of trypsinized thylakoids
Spinacia oleracea
Localization
Localization
Commentary
Organism
GeneOntology No.
Textmining
chloroplast
-
Spinacia oleracea
9507
-
thylakoid membrane
-
Spinacia oleracea
42651
-
Metals/Ions
Metals/Ions
Commentary
Organism
Structure
Ca2+
contributes to significant ATPase activity in trypsin-treated membranes, whereas Ca2+-ATPase activity of reduced thylakoids is very low
Spinacia oleracea
Mg2+
-
Spinacia oleracea
Organism
Organism
Primary Accession No. (UniProt)
Commentary
Textmining
Spinacia oleracea
-
-
-
Substrates and Products (Substrate)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
ADP + phosphate + H+
-
674396
Spinacia oleracea
ATP + H2O
-
-
-
r
ATP + H2O + H+/in
-
674396
Spinacia oleracea
ADP + phosphate + H+/out
-
-
-
r
Activating Compound (protein specific)
Activating Compound
Commentary
Organism
Structure
light
promotes ATP hydrolysis
Spinacia oleracea
sulfite
10 mM stimulates both proton uptake and ATP hydrolysis of Mg2+-ATPase activity of trypsin-treated thylakoids
Spinacia oleracea
Trypsin
elicits higher rates of ATPase activity, Mg2+-ATPase activity of trypsinized thylakoids is only partially inhibited by the uncouplers
Spinacia oleracea
Application (protein specific)
Application
Commentary
Organism
additional information
cleavage of the gamma subunit of the ATP synthase by trypsin prevents inhibition of ATPase activity by the sigma subunit, but only partially overcomes Mg2+-ADP inhibition during assay
Spinacia oleracea
Inhibitors (protein specific)
Inhibitors
Commentary
Organism
Structure
ADP
incubation prior to assay abolishes Mg2+-ATPase activity of reduced thylakoids, has no effect on Mg2+-ATPase activity of trypsinized thylakoids
Spinacia oleracea
Localization (protein specific)
Localization
Commentary
Organism
GeneOntology No.
Textmining
chloroplast
-
Spinacia oleracea
9507
-
thylakoid membrane
-
Spinacia oleracea
42651
-
Metals/Ions (protein specific)
Metals/Ions
Commentary
Organism
Structure
Ca2+
contributes to significant ATPase activity in trypsin-treated membranes, whereas Ca2+-ATPase activity of reduced thylakoids is very low
Spinacia oleracea
Mg2+
-
Spinacia oleracea
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
ADP + phosphate + H+
-
674396
Spinacia oleracea
ATP + H2O
-
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-
r
ATP + H2O + H+/in
-
674396
Spinacia oleracea
ADP + phosphate + H+/out
-
-
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r
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No.
1st author
Pub Med
title
organims
journal
volume
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year
Activating Compound
Application
Cloned(Commentary)
Crystallization (Commentary)
Engineering
General Stability
Inhibitors
KM Value [mM]
Localization
Metals/Ions
Molecular Weight [Da]
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Organic Solvent Stability
Organism
Oxidation Stability
Posttranslational Modification
Purification (Commentary)
Reaction
Renatured (Commentary)
Source Tissue
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Storage Stability
Substrates and Products (Substrate)
Subunits
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Temperature Range [°C]
Temperature Stability [°C]
Turnover Number [1/s]
pH Optimum
pH Range
pH Stability
Cofactor
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pI Value
IC50 Value
Activating Compound (protein specific)
Application (protein specific)
Cloned(Commentary) (protein specific)
Cofactor (protein specific)
Crystallization (Commentary) (protein specific)
Engineering (protein specific)
General Stability (protein specific)
IC50 Value (protein specific)
Inhibitors (protein specific)
Ki Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM] (protein specific)
Localization (protein specific)
Metals/Ions (protein specific)
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Organic Solvent Stability (protein specific)
Oxidation Stability (protein specific)
Posttranslational Modification (protein specific)
Purification (Commentary) (protein specific)
Renatured (Commentary) (protein specific)
Source Tissue (protein specific)
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Storage Stability (protein specific)
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Subunits (protein specific)
Temperature Optimum [°C] (protein specific)
Temperature Range [°C] (protein specific)
Temperature Stability [°C] (protein specific)
Turnover Number [1/s] (protein specific)
pH Optimum (protein specific)
pH Range (protein specific)
pH Stability (protein specific)
pI Value (protein specific)
Expression
General Information
General Information (protein specific)
Expression (protein specific)
KCat/KM [mM/s]
KCat/KM [mM/s] (protein specific)
747179
Sielaff
The regulatory subunit epsilo ...
Escherichia coli
Biochim. Biophys. Acta
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775-788
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748136
Mendoza-Hoffmann
Control of rotation of the F1 ...
Paracoccus denitrificans
J. Bioenerg. Biomembr.
50
403-424
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747175
Zharova
Functional heterogeneity of F ...
Paracoccus denitrificans 1222, Paracoccus denitrificans
Biochim. Biophys. Acta
1858
939-944
2017
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Esparza-Molto
Regulation of the H+-ATP synt ...
Saccharomyces cerevisiae
Cell. Mol. Life Sci.
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2151-2166
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Zhdanov
Low energy costs of F1Fo ATP ...
Homo sapiens
Free Radic. Biol. Med.
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184-195
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Wang
Selective ATP hydrolysis inhi ...
Homo sapiens
Oncotarget
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53602-53612
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Khomochkin
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Reversible pH-dependent activ ...
Spinacia oleracea
Ukr. Biochem. J.
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749178
Vahidi
Load-dependent destabilizatio ...
Escherichia coli
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
113
2412-2417
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729316
Gloger
The a subunit of the A1AO ATP ...
Methanosarcina mazei, Methanosarcina mazei DSM 3647
Biochim. Biophys. Acta
1847
505-513
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Ito
Mechanism of the alphabeta con ...
Bos taurus, Homo sapiens
Biophys. J.
108
85-97
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733843
Shirakihara
Structure of a thermophilic F1 ...
Escherichia coli
FEBS J.
282
2895-2913
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Martin
Fo-driven rotation in the ATP ...
Escherichia coli
J. Biol. Chem.
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2015
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734656
Skodova-Sverakova
Identification of the mitochon ...
Trypanosoma brucei, Trypanosoma brucei 29-13
Mol. Biochem. Parasitol.
201
135-138
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749153
Subrtova
ATPaseTb2, a unique membrane- ...
Trypanosoma brucei
PLoS Pathog.
11
e1004660
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733403
Salcedo
Isolated noncatalytic and cata ...
Bos taurus
Biochim. Biophys. Acta
1837
44-50
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734265
Watanabe
Robustness of the rotary catal ...
Bacillus sp. (in: Bacteria), Bacillus sp. (in: Bacteria) PS3
J. Biol. Chem.
289
19331-19340
2014
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Nam
Trapping the ATP binding state ...
Bos taurus
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
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735260
Watanabe
Characterization of the temper ...
Bacillus sp. (in: Bacteria), Bacillus sp. (in: Bacteria) PS3
Sci. Rep.
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733754
La
Mutations on the N-terminal ed ...
Kluyveromyces lactis, Kluyveromyces lactis PM6-7A
Eukaryot. Cell
12
1451-1461
2013
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734111
Terashima
Mutation in the a-subunit of F ...
Vibrio alginolyticus
J. Biochem.
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177-184
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Shah
F1-ATPase of Escherichia coli: ...
Escherichia coli
J. Biol. Chem.
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9383-9395
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Dong
MdVHA-A encodes an apple subu ...
Malus domestica
J. Plant Physiol.
170
601-609
2013
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Functional analysis of membran ...
Bacillus sp. (in: Bacteria), Bacillus sp. (in: Bacteria) PS3
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Komoriya
Principal role of the arginine ...
Bacillus sp. (in: Bacteria), Bacillus sp. (in: Bacteria) PS3
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15134-15142
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Accumulation of newly synthesi ...
Arabidopsis thaliana
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Mechanical modulation of catal ...
Bacillus sp. (in: Bacteria), Bacillus sp. (in: Bacteria) PS3
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Structural evidence of a new c ...
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F1Fo-ATPase, F-type proton-tra ...
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Balakrishna
The structure of subunit E of ...
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Kowalski-Chauvel
Identification of the F1-ATPas ...
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41458-41468
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Finnigan
Sorting of the yeast vacuolar ...
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How the N-terminal extremity o ...
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Post-transcriptional regulatio ...
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Efficient ATP synthesis by the ...
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Turnover of ATP synthase subun ...
Homo sapiens, Saccharomyces cerevisiae
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Hicks
F1F0-ATP synthases of alkaliph ...
Anoxybacillus flavithermus, Anoxybacillus flavithermus WK1, Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus amyloliquefaciens FZB42, Bacillus anthracis, Bacillus anthracis Ames, Bacillus clausii, Bacillus clausii DSM 23117, Bacillus halodurans, Bacillus halodurans C-125, Bacillus licheniformis, Bacillus licheniformis ATCC 14580, Bacillus mycoides, Bacillus mycoides KBAB4, Bacillus pseudofirmus, Bacillus pseudofirmus OF4, Bacillus pumilus, Bacillus pumilus SAFR-032, Bacillus sp. (in: Bacteria), Bacillus sp. (in: Bacteria) TA2.A1, Bacillus subtilis subsp. subtilis 168, Bacillus subtilis subsp. subtilis, Bacillus thuringiensis, Bacillus thuringiensis Al Hakam, Candidatus Desulforudis audaxviator, Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C, Carboxydothermus hydrogenoformans, Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901 / DSM 6008, Desulfotomaculum reducens, Desulfotomaculum reducens MI-1, Exiguobacterium sibiricum, Exiguobacterium sibiricum 255-15, Geobacillus kaustophilus, Geobacillus thermodenitrificans, Geobacillus thermodenitrificans NG80-2, Oceanobacillus iheyensis, Oceanobacillus iheyensis HTE83, Pelotomaculum thermopropionicum, Pelotomaculum thermopropionicum SI
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1362-1377
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Stimulation of F1-ATPase activ ...
Bacillus sp. PS3
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435-442
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Iron transport by proteoliposo ...
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The effects of copper (II) ion ...
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Cell Biochem. Biophys.
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Pigment epithelium-derived fac ...
Bos taurus, Saccharomyces cerevisiae
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Stepwise assembly of dimeric F ...
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Paracoccus denitrificans proto ...
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Overexpression of F0F1-ATP syn ...
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689637
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44
351-358
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Maegawa
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62
483-488
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44
2441-2448
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672320
Ishmukhametov
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110-116
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Wakai
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1884-1891
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674212
Feldkamp
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J. Am. Soc. Nephrol.
16
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McCarty
ATP synthase of chloroplast th ...
Spinacia oleracea
J. Bioenerg. Biomembr.
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Stocker
Purification, crystallization, ...
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Lokanath
Purification, crystallization ...
Pyrococcus horikoshii, Pyrococcus horikoshii OT-3
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Greie
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Penna
F0F1 ATP synthase activity is ...
More
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H2192-H2200
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Di Pancrazio
In vitro and in vivo studies o ...
Capra hircus
Biochim. Biophys. Acta
1659
52-62
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Kagawa
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EMBO J.
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2734-2744
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Chaban
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Motz
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Mueller
Ni-chelate-affinity purificati ...
Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces cerevisiae DK8
Protein Expr. Purif.
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Maegawa
Crystallization and preliminar ...
Pyrococcus horikoshii, Pyrococcus horikoshii OT-3
Acta Crystallogr. Sect. D
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1484-1486
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Fortier
Induction of Oenococcus oeni H ...
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222
165-169
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Crider
Characterization of the funct ...
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278
44281-44288
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Suzuki
F0 of ATP synthase is a rotary ...
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Effects of sequential deletion ...
Spinacia oleracea
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Jones
Introduction of a carboxyl gro ...
Escherichia coli
J. Bacteriol.
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Ii
Insertion of mitochondrial DNA ...
Rattus norvegicus
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276
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Kawasaki-Nishi
Arg-735 of the 100-kDa subuni ...
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Proc. Natl. Acad. Sci. USA
98
12397-12402
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Chen
Characterization of the metal ...
Chlamydomonas reinhardtii
Biochemistry
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9393-9400
2000
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Ratajczak
Structure, function and regul ...
Acer pseudoplatanus, Arabidopsis thaliana, Atriplex nummularia, Beta vulgaris, Daucus carota, Gossypium hirsutum, Helianthus annuus, Hordeum vulgare, Mesembryanthemum crystallinum, Nicotiana tabacum, Solanum lycopersicum, Sorghum bicolor, Sporobolus x townsendii, Vigna radiata
Biochim. Biophys. Acta
1465
17-36
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748147
Xu
Subunit D (Vma8p) of the yeas ...
Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces cerevisiae KHY105
J. Biol. Chem.
275
22075-22081
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Shirakihara
The crystal structure of the n ...
Bacillus sp. PS3
Structure
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Loebau
Nucleotide occupancy of F1-ATP ...
Escherichia coli
FEBS Lett.
404
15-18
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Steinert
Characterization and subunit s ...
Haloferax volcanii, Haloferax volcanii WR 340
J. Biol. Chem.
272
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Escherichia coli
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Characterization of mutation i ...
Saccharomyces cerevisiae
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Shin
Reconstitution of the F1-ATPas ...
Escherichia coli
Biochim. Biophys. Acta
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62-70
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Blair
Phylogenetic analyses of the h ...
Anabaena sp., Apis mellifera, Ascaris suum, Aspergillus nidulans, Bacillus firmus, Bacillus megaterium, Bacillus sp. PS3, Balaenoptera physalus, Beta vulgaris, Bipolaris maydis, Bos taurus, Brassica napus, Caenorhabditis elegans, Candida parapsilosis, Cricetulus griseus, Cricetulus sp., Cyprinus carpio, Drosophila melanogaster, Escherichia coli, Euglena gracilis, Homo sapiens, Locusta migratoria, Marchantia polymorpha, Mus musculus, Neurospora crassa, Nicotiana tabacum, Oenothera berteroana, Oryza sativa, Paracentrotus lividus, Phoca vitulina, Pisaster ochraceus, Pisum sativum, Podospora anserina, Propionigenium modestum, Rattus norvegicus, Rhodospirillum rubrum, Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe, Spinacia oleracea, Synechococcus sp., Trieres chinensis, Triticum aestivum, Trypanosoma brucei, Vibrio alginolyticus, Xenopus laevis, Zea mays
Microbiology
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17-32
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Weber
Location and properties of pyr ...
Escherichia coli
J. Biol. Chem.
270
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Collinson
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Biochemistry
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7971-7978
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Satoh
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Acetabularia acetabulum
Biosci. Biotechnol. Biochem.
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Crystallization of F1-ATPase f ...
Bos taurus
J. Mol. Biol.
229
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Uyemura
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Senior
Catalytic properties of Escher ...
Escherichia coli
Arch. Biochem. Biophys.
297
340-344
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Ward
Proton transport activity of ...
Avena sativa
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De Vicente
Mitochondrial F1-ATpase moiety ...
Phycomyces blakesleeanus
Biochem. Cell Biol.
69
454-459
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Gagliardi
Large-scale purification and c ...
Sus scrofa
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Mitochondrial ATP synthase. cD ...
Rattus norvegicus
J. Biol. Chem.
265
4664-4669
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210249
Penin
Interaction between delta and ...
Sus scrofa
Biochemistry
29
9358-9364
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677903
Hawthorne
Sequence of the genes for the ...
Bacillus megaterium, Bacillus megaterium QM B1551
Biochem. Biophys. Res. Commun.
151
926-931
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680590
Denda
Molecular cloning of the beta- ...
Sulfolobus acidocaldarius
J. Biol. Chem.
263
17251-17254
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680591
Denda
The membrane-associated ATPase ...
Sulfolobus acidocaldarius, Sulfurisphaera tokodaii
J. Biol. Chem.
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6012-6015
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Mayer
Immunoelectron microscopic dem ...
Methanosarcina mazei
J. Bacteriol.
169
2307-2309
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210242
Fillingame
Purification of F1F0 H+-ATPase ...
Escherichia coli
Methods Enzymol.
126
545-557
1986
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1
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210245
Gautheron
Preparation of a highly couple ...
Sus scrofa
Methods Enzymol.
126
417-427
1986
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2
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210247
Senior
-
The proton-ATPase of Escherich ...
Escherichia coli
Curr. Top. Membr. Transp.
23
35-151
1985
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1
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1
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210236
Hoppe
The proton conducting F0-part ...
Escherichia coli
Biochim. Biophys. Acta
768
1-27
1984
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210240
Nelson
-
Structure and synthesis of chl ...
Spinacia oleracea
Methods Enzymol.
97
510-523
1983
-
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1
1
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210248
Futai
Structure and function of prot ...
Bacillus sp. PS3, Bos taurus, Escherichia coli, Mus musculus, Saccharomyces cerevisiae, Spinacia oleracea, Zea mays
Microbiol. Rev.
47
285-312
1983
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4
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210231
Fillingame
-
Biochemistry and genetics of b ...
Allochromatium vinosum, Bacillus sp. PS3, Bacteria, Clostridium sp., Enterococcus faecalis, Escherichia coli, Micrococcus luteus, Mycolicibacterium phlei, Rhodospirillum rubrum
Curr. Top. Bioenerg.
11
35-106
1981
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12
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4
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210234
Criddle
-
Mitochondrial ATPases ...
Bos taurus, Escherichia coli, Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe
Curr. Top. Bioenerg.
9
89-145
1979
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22
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22
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4
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210251
Amzel
Crystallization of F1 ATPase f ...
Rattus norvegicus
Methods Enzymol.
55
333-337
1979
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1
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210254
Catterall
Purification of F1 ATPase from ...
Rattus norvegicus
Methods Enzymol.
55
320-328
1979
-
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-
210237
Sebald
Biogenesis of mitochondrial AT ...
Bos taurus, Neurospora crassa, Rattus norvegicus, Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe
Biochim. Biophys. Acta
463
1-27
1977
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-
210250
Spitsberg
The crystallization of beef he ...
Bos taurus
Biochim. Biophys. Acta
492
237-240
1977
-
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1
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210235
Nelson
Structure and function of chlo ...
Euglena gracilis, Spinacia oleracea
Biochim. Biophys. Acta
456
314-318
1976
1
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210233
Penefsky
-
Mitochondrial and chloroplast ...
Bos taurus, Euglena gracilis, Magnusiomyces magnusii, Rattus norvegicus, Saccharomyces cerevisiae, Spinacia oleracea
The Enzymes, 3rd Ed. (Boyer, P. D. , ed. )
10
375-429
1974
1
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210238
Abrams
-
Bacterial membrane ATPase ...
Alcaligenes faecalis, Bacillus megaterium, Bacillus megaterium NRLL B939, Enterococcus faecalis, Escherichia coli, Geobacillus stearothermophilus, Micrococcus luteus, Rhodobacter sphaeroides
The Enzymes, 3rd Ed. (Boyer, P. D. , ed. )
10
395-429
1974
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210232
Senior
The structure of mitochondrial ...
Bos taurus, Rattus norvegicus
Biochim. Biophys. Acta
301
249-277
1973
-
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