BRENDA - Enzyme Database show
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Structural, biochemical, and biophysical characterization of idelalisib binding to phosphoinositide 3-kinase delta

Somoza, J.R.; Koditek, D.; Villasenor, A.G.; Novikov, N.; Wong, M.H.; Liclican, A.; Xing, W.; Lagpacan, L.; Wang, R.; Schultz, B.E.; Papalia, G.A.; Samuel, D.; Lad, L.; McGrath, M.E.; J. Biol. Chem. 290, 8439-8446 (2015)

Data extracted from this reference:

Cloned(Commentary)
Commentary
Organism
coexpression of N-terminally His6-tagged p110 and nontagged p85 subunits in Spodoptera frugiperda Sf21 cells via baculovirus transfection method, recombinant expression of DELTAABC mutant p110delta with the iSH2 domain of p85alpha
Homo sapiens
Crystallization (Commentary)
Crystallization
Organism
purified enzyme mutant, mixing of 25 nl 11 mg/ml protein with 0.9 mM inhibitor delalisib in 20 mM Tris, pH 7.2, 50 mM (NH4)2SO4, 1% v/v ethylene glycol, 1% w/v betaine, 300 mM CHAPS, and 5 mM TCEP, with 25 nl of reservoir solution containing 25% w/v PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, microseeding in 480 nl of 2.5% w/v n-dodecyl-beta-D-maltoside, 300 nl of 20 mM ligand, and 0.12 ml of 12 mg/ml DELTAABD-p110delta in storage buffer 20 mM Tris, pH 7.2, 50 mM (NH4)2SO4, 1% v/v ethylene glycol, 1% w/v betaine, 300 nM CHAPS, and 5mM TCEP, X-ray diffraction structure determination and analysis at 2.4-2.5 A resolution
Homo sapiens
Inhibitors
Inhibitors
Commentary
Organism
Structure
idelalisib
5-fluoro-3-phenyl-2-[(1S)-1-(9H-purin-6-ylamino)propyl]quinazolin-4(3H)-one, a PI3Kdelta inhibitor used to treat hematological malignancies. The inhibitior idelalisib is selective, noncovalent, reversible, and ATP-competitive, The compound binds reversibly and noncovalently to the p110delta subunit of the kinase, analysis of binding interactions that confer the potency and selectivity of idelalisib, overview. Idelalisib is a propeller-shaped inhibitor
Homo sapiens
Metals/Ions
Metals/Ions
Commentary
Organism
Structure
Mg2+
required
Homo sapiens
Organism
Organism
Primary Accession No. (UniProt)
Commentary
Textmining
Homo sapiens
O00329
isozyme PI3Kdelta
-
Purification (Commentary)
Commentary
Organism
recombinant N-terminally His6-tagged p110 and nontagged p85 subunits from Spodoptera frugiperda Sf21 cells by nickel affinity chromatography
Homo sapiens
Temperature Optimum [C]
Temperature Optimum [C]
Temperature Optimum Maximum [C]
Commentary
Organism
25
-
assay at
Homo sapiens
pH Optimum
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
7.4
-
assay at
Homo sapiens
Cofactor
Cofactor
Commentary
Organism
Structure
ATP
-
Homo sapiens
IC50 Value
IC50 Value
IC50 Value Maximum
Commentary
Organism
Inhibitor
Structure
0.000019
-
pH 7.4, 25C, recombinant enzyme
Homo sapiens
idelalisib
Cloned(Commentary) (protein specific)
Commentary
Organism
coexpression of N-terminally His6-tagged p110 and nontagged p85 subunits in Spodoptera frugiperda Sf21 cells via baculovirus transfection method, recombinant expression of DELTAABC mutant p110delta with the iSH2 domain of p85alpha
Homo sapiens
Cofactor (protein specific)
Cofactor
Commentary
Organism
Structure
ATP
-
Homo sapiens
Crystallization (Commentary) (protein specific)
Crystallization
Organism
purified enzyme mutant, mixing of 25 nl 11 mg/ml protein with 0.9 mM inhibitor delalisib in 20 mM Tris, pH 7.2, 50 mM (NH4)2SO4, 1% v/v ethylene glycol, 1% w/v betaine, 300 mM CHAPS, and 5 mM TCEP, with 25 nl of reservoir solution containing 25% w/v PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, microseeding in 480 nl of 2.5% w/v n-dodecyl-beta-D-maltoside, 300 nl of 20 mM ligand, and 0.12 ml of 12 mg/ml DELTAABD-p110delta in storage buffer 20 mM Tris, pH 7.2, 50 mM (NH4)2SO4, 1% v/v ethylene glycol, 1% w/v betaine, 300 nM CHAPS, and 5mM TCEP, X-ray diffraction structure determination and analysis at 2.4-2.5 A resolution
Homo sapiens
IC50 Value (protein specific)
IC50 Value
IC50 Value Maximum
Commentary
Organism
Inhibitor
Structure
0.000019
-
pH 7.4, 25C, recombinant enzyme
Homo sapiens
idelalisib
Inhibitors (protein specific)
Inhibitors
Commentary
Organism
Structure
idelalisib
5-fluoro-3-phenyl-2-[(1S)-1-(9H-purin-6-ylamino)propyl]quinazolin-4(3H)-one, a PI3Kdelta inhibitor used to treat hematological malignancies. The inhibitior idelalisib is selective, noncovalent, reversible, and ATP-competitive, The compound binds reversibly and noncovalently to the p110delta subunit of the kinase, analysis of binding interactions that confer the potency and selectivity of idelalisib, overview. Idelalisib is a propeller-shaped inhibitor
Homo sapiens
Metals/Ions (protein specific)
Metals/Ions
Commentary
Organism
Structure
Mg2+
required
Homo sapiens
Purification (Commentary) (protein specific)
Commentary
Organism
recombinant N-terminally His6-tagged p110 and nontagged p85 subunits from Spodoptera frugiperda Sf21 cells by nickel affinity chromatography
Homo sapiens
Temperature Optimum [C] (protein specific)
Temperature Optimum [C]
Temperature Optimum Maximum [C]
Commentary
Organism
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-
assay at
Homo sapiens
pH Optimum (protein specific)
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
7.4
-
assay at
Homo sapiens
Other publictions for EC 2.7.11.1
No.
1st author
Pub Med
title
organims
journal
volume
pages
year
Activating Compound
Application
Cloned(Commentary)
Crystallization (Commentary)
Engineering
General Stability
Inhibitors
KM Value [mM]
Localization
Metals/Ions
Molecular Weight [Da]
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Organic Solvent Stability
Organism
Oxidation Stability
Posttranslational Modification
Purification (Commentary)
Reaction
Renatured (Commentary)
Source Tissue
Specific Activity [micromol/min/mg]
Storage Stability
Substrates and Products (Substrate)
Subunits
Temperature Optimum [C]
Temperature Range [C]
Temperature Stability [C]
Turnover Number [1/s]
pH Optimum
pH Range
pH Stability
Cofactor
Ki Value [mM]
pI Value
IC50 Value
Activating Compound (protein specific)
Application (protein specific)
Cloned(Commentary) (protein specific)
Cofactor (protein specific)
Crystallization (Commentary) (protein specific)
Engineering (protein specific)
General Stability (protein specific)
IC50 Value (protein specific)
Inhibitors (protein specific)
Ki Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM] (protein specific)
Localization (protein specific)
Metals/Ions (protein specific)
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Organic Solvent Stability (protein specific)
Oxidation Stability (protein specific)
Posttranslational Modification (protein specific)
Purification (Commentary) (protein specific)
Renatured (Commentary) (protein specific)
Source Tissue (protein specific)
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Storage Stability (protein specific)
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Subunits (protein specific)
Temperature Optimum [C] (protein specific)
Temperature Range [C] (protein specific)
Temperature Stability [C] (protein specific)
Turnover Number [1/s] (protein specific)
pH Optimum (protein specific)
pH Range (protein specific)
pH Stability (protein specific)
pI Value (protein specific)
Expression
General Information
General Information (protein specific)
Expression (protein specific)
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KCat/KM [mM/s] (protein specific)
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Glycogen synthase kinase-3 inh ...
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Gopalaswamy
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Mycolicibacterium smegmatis
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Involvement of p90 ribosomal S ...
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From the characterization of t ...
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The Mycobacterium tuberculosis ...
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