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Absolute quantification of Medicago truncatula sucrose synthase isoforms and N-metabolism enzymes in symbiotic root nodules and the detection of novel nodule phosphoproteins by mass spectrometry

Wienkoop, S.; Larrainzar, E.; Glinski, M.; Gonzalez, E.M.; Arrese-Igor, C.; Weckwerth, W.; J. Exp. Bot. 59, 3307-3315 (2008)

Data extracted from this reference:

Organism
Organism
Primary Accession No. (UniProt)
Commentary
Textmining
Medicago truncatula
-
Jemalong A17
-
Posttranslational Modification
Posttranslational Modification
Commentary
Organism
phosphoprotein
nodule SuSy1 is hyperphosphorylated at Ser11
Medicago truncatula
Source Tissue
Source Tissue
Commentary
Organism
Textmining
root nodule
sucrose synthase is one of the central enzymes in sucrose cleavage in root nodules; sucrose synthase is one of the central enzymes in sucrose cleavage in root nodules. SuSy2 is the second most abundant isoform present in Medicago truncatula root nodules
Medicago truncatula
-
Posttranslational Modification (protein specific)
Posttranslational Modification
Commentary
Organism
phosphoprotein
nodule SuSy1 is hyperphosphorylated at Ser11
Medicago truncatula
Source Tissue (protein specific)
Source Tissue
Commentary
Organism
Textmining
root nodule
sucrose synthase is one of the central enzymes in sucrose cleavage in root nodules; sucrose synthase is one of the central enzymes in sucrose cleavage in root nodules. SuSy2 is the second most abundant isoform present in Medicago truncatula root nodules
Medicago truncatula
-
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organims
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Activating Compound
Application
Cloned(Commentary)
Crystallization (Commentary)
Engineering
General Stability
Inhibitors
KM Value [mM]
Localization
Metals/Ions
Molecular Weight [Da]
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Organic Solvent Stability
Organism
Oxidation Stability
Posttranslational Modification
Purification (Commentary)
Reaction
Renatured (Commentary)
Source Tissue
Specific Activity [micromol/min/mg]
Storage Stability
Substrates and Products (Substrate)
Subunits
Temperature Optimum [°C]
Temperature Range [°C]
Temperature Stability [°C]
Turnover Number [1/s]
pH Optimum
pH Range
pH Stability
Cofactor
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pI Value
IC50 Value
Activating Compound (protein specific)
Application (protein specific)
Cloned(Commentary) (protein specific)
Cofactor (protein specific)
Crystallization (Commentary) (protein specific)
Engineering (protein specific)
General Stability (protein specific)
IC50 Value (protein specific)
Inhibitors (protein specific)
Ki Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM] (protein specific)
Localization (protein specific)
Metals/Ions (protein specific)
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Organic Solvent Stability (protein specific)
Oxidation Stability (protein specific)
Posttranslational Modification (protein specific)
Purification (Commentary) (protein specific)
Renatured (Commentary) (protein specific)
Source Tissue (protein specific)
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Storage Stability (protein specific)
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Subunits (protein specific)
Temperature Optimum [°C] (protein specific)
Temperature Range [°C] (protein specific)
Temperature Stability [°C] (protein specific)
Turnover Number [1/s] (protein specific)
pH Optimum (protein specific)
pH Range (protein specific)
pH Stability (protein specific)
pI Value (protein specific)
Expression
General Information
General Information (protein specific)
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Nguyen
Pronounced phenotypic changes ...
Arabidopsis thaliana
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New insight into the catalytic ...
Oryza sativa
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Diricks
Identification of sucrose synt ...
Acidithiobacillus caldus, Acidithiobacillus caldus ATCC 51756, Denitrovibrio acetiphilus, Denitrovibrio acetiphilus DSM 12809, Melioribacter roseus, Melioribacter roseus JCM 17771, Nitrosomonas europaea, Nitrosomonas europaea ATCC 19718, Thermosipho melanesiensis, Thermosipho melanesiensis DSM 12029
Appl. Microbiol. Biotechnol.
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Overexpression of poplar xylem ...
Populus simonii x Populus nigra
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Activity of sucrose synthase i ...
Betula pendula
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Altered sucrose synthase and i ...
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A reassessment of the role of ...
Arabidopsis thaliana, Arabidopsis thaliana Col-0
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Antisense suppression of cucum ...
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The unique nucleotide specific ...
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Dai
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Activities of enzymes involved ...
Triticum aestivum
Russ. J. Plant Physiol.
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Angeles-Nunez
Arabidopsis sucrose synthase 2 ...
Arabidopsis thaliana
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Siddique
Myo-inositol oxygenase genes a ...
Arabidopsis thaliana
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Kumar
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Growth and sucrose synthase ac ...
Cicer arietinum
Aust. J. Crop Sci.
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Seed size is associated with s ...
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Abid
Role of myo-inositol phosphate ...
Arabidopsis thaliana, Citrus unshiu, Citrus x paradisi, Coffea arabica, Daucus carota, Eucalyptus grandis, Glycine max, Gossypium hirsutum, Oryza sativa, Pisum sativum, Solanum lycopersicum, Solanum tuberosum, Vicia faba, Zea mays
Gene
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Antioxidative enzymes and sucr ...
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Tang
The effect of sucrose and absc ...
Oryza sativa
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Yarnes
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Sucrose synthase levels do not ...
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Baroja-Fernandez
Enhancing sucrose synthase act ...
Solanum tuberosum
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Effects of low light on phloem ...
Prunus persica
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Effect of nitrate on pea sucro ...
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Changes in carbohydrate levels ...
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Absolute quantification of Med ...
Medicago truncatula
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Wounding, anoxia and cold indu ...
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Sucrose synthase is associated ...
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Sucrose synthase is involved i ...
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Sauerzapfe
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Broadening the biocatalytic pr ...
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Enzyme Microb. Technol.
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Sucrose synthase oligomerizati ...
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Baier
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1600-1618
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Zhou
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163
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Coleman
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Determination of structural re ...
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Römer
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Evidence that sucrose loaded i ...
Vigna radiata
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Sucrose synthase isoforms in c ...
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Sakalo
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Roemer
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Evidence for a tonoplast-assoc ...
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488570
MacGregor
Possible structure and active ...
Solanum lycopersicum
J. Protein Chem.
21
297-306
2002
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488571
Pavlinova
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Sucrose-phosphate synthase, su ...
Beta vulgaris
Russ. J. Plant Physiol.
49
68-73
2002
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488565
Barratt
Multiple, distinct isoforms of ...
Pisum sativum
Plant Physiol.
127
655-664
2001
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488568
Tanase
Purification and characterizat ...
Pyrus pyrifolia
Plant Cell Physiol.
41
408-414
2000
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488567
Porchia
Sucrose metabolism in cyanobac ...
Anabaena sp.
Planta
210
34-40
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488575
Anguenot
Purification of tomato sucrose ...
Solanum lycopersicum
Arch. Biochem. Biophys.
365
163-169
1999
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488576
Zhang
Soybean nodule sucrose synthas ...
Glycine max
Arch. Biochem. Biophys.
371
70-82
1999
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677238
Sturm
The sucrose-cleaving enzymes o ...
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1999
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488577
Huang
Purification and characterizat ...
Oryza sativa
Biochem. Mol. Biol. Int.
46
107-113
1998
2
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488569
Dejardin
Purification, characterization ...
Pisum sativum
Planta
201
128-137
1997
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488573
Nakai
Expression and characterizatio ...
Vigna radiata
Biosci. Biotechnol. Biochem.
61
1500-1503
1997
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488572
Weber
Sucrose metabolism during coty ...
Vicia faba
Plant J.
9
841-850
1996
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488566
Elling
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Characterization of sucrose sy ...
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17
929-934
1995
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488574
Sebkova
Biochemical, physiological, an ...
Daucus carota
Plant Physiol.
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1995
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488578
Yen
Purification and characterizat ...
Oryza sativa
Biochem. Mol. Biol. Int.
34
613-620
1994
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488547
Elling
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Purification of sucrose syntha ...
Oryza sativa
J. Biotechnol.
29
277-286
1993
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488560
Ross
Purification and characterizat ...
Vicia faba
Plant Physiol.
100
1008-1013
1992
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488538
Moriguchi
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Purification and characterizat ...
Prunus persica
Plant Cell Physiol.
29
1361-1366
1988
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262
14730-14736
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488540
Larsen
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Sucrose synthase from wheat le ...
Triticum aestivum
Physiol. Plant.
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Morell
Sucrose synthase of soybean no ...
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A comparison of two sucrose sy ...
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Cucumber fruit sucrose synthet ...
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Hisajima
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Purification and properties of ...
Ipomoea nil
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23
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Wöstemeyer
Translation of Zea mays endosp ...
Zea mays
Eur. J. Biochem.
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Yang
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Quarternary structure of sucro ...
Musa acuminata
J. Chin. Biochem. Soc.
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