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show all sequences of 1.18.6.1

The nitrogen-fixing system of Corynebacterium autotrophicum. Purification and properties of the nitrogenase components and two ferredoxins

Berndt, H.; Lowe, D.J.; Yates, M.G.; Eur. J. Biochem. 86, 133-142 (1978)

Data extracted from this reference:

Metals/Ions
Metals/Ions
Commentary
Organism
Structure
Iron
-
Xanthobacter autotrophicus
Molybdenum
-
Xanthobacter autotrophicus
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight Maximum [Da]
Commentary
Organism
additional information
-
-
Xanthobacter autotrophicus
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Natural Substrates
Organism
Commentary (Nat. Sub.)
Natural Products
Commentary (Nat. Pro.)
Organism (Nat. Pro.)
Reversibility
8 reduced ferredoxin + 8 H+ + N2 + 16 ATP + 16 H2O
Xanthobacter autotrophicus
-
8 oxidized ferredoxin + H2 + 2 NH3 + 16 ADP + 16 phosphate
-
-
?
Organism
Organism
Primary Accession No. (UniProt)
Commentary
Textmining
Xanthobacter autotrophicus
-
-
-
Purification (Commentary)
Commentary
Organism
both components
Xanthobacter autotrophicus
Reaction
Reaction
Commentary
Organism
8 reduced ferredoxin + 8 H+ + N2 + 16 ATP + 16 H2O = 8 oxidized ferredoxin + H2 + 2 NH3 + 16 ADP + 16 phosphate
enzyme is composed of 2 metalloproteins: component I MoFe protein and component II Fe protein
Xanthobacter autotrophicus
Specific Activity [micromol/min/mg]
Specific Activity Minimum [Ámol/min/mg]
Specific Activity Maximum [Ámol/min/mg]
Commentary
Organism
1.07
-
purified MoFe protein
Xanthobacter autotrophicus
1.26
-
purified Fe protein
Xanthobacter autotrophicus
Substrates and Products (Substrate)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
2 reduced ferredoxin + 2 H+ + acetylene + 2 ATP + 2 H2O
-
440168
Xanthobacter autotrophicus
2 oxidized ferredoxin + ethylene + 2 ADP + 2 phosphate
-
440168
Xanthobacter autotrophicus
?
8 reduced ferredoxin + 8 H+ + N2 + 16 ATP + 16 H2O
-
440168
Xanthobacter autotrophicus
8 oxidized ferredoxin + H2 + 2 NH3 + 16 ADP + 16 phosphate
-
-
-
?
8 reduced ferredoxin + 8 H+ + N2 + 16 ATP + 16 H2O
-
440168
Xanthobacter autotrophicus
8 oxidized ferredoxin + H2 + 2 NH3 + 16 ADP + 16 phosphate
-
440168
Xanthobacter autotrophicus
?
Subunits
Subunits
Commentary
Organism
More
-
Xanthobacter autotrophicus
pH Optimum
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
7.1
7.3
with substrates: N2, C2H2
Xanthobacter autotrophicus
pH Range
pH Minimum
pH Maximum
Commentary
Organism
6.5
8.3
pH 6.5: no activity below, pH 8.3: about 70% of activity maximum
Xanthobacter autotrophicus
Metals/Ions (protein specific)
Metals/Ions
Commentary
Organism
Structure
Iron
-
Xanthobacter autotrophicus
Molybdenum
-
Xanthobacter autotrophicus
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight Maximum [Da]
Commentary
Organism
additional information
-
-
Xanthobacter autotrophicus
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Natural Substrates
Organism
Commentary (Nat. Sub.)
Natural Products
Commentary (Nat. Pro.)
Organism (Nat. Pro.)
Reversibility
8 reduced ferredoxin + 8 H+ + N2 + 16 ATP + 16 H2O
Xanthobacter autotrophicus
-
8 oxidized ferredoxin + H2 + 2 NH3 + 16 ADP + 16 phosphate
-
-
?
Purification (Commentary) (protein specific)
Commentary
Organism
both components
Xanthobacter autotrophicus
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Specific Activity Minimum [Ámol/min/mg]
Specific Activity Maximum [Ámol/min/mg]
Commentary
Organism
1.07
-
purified MoFe protein
Xanthobacter autotrophicus
1.26
-
purified Fe protein
Xanthobacter autotrophicus
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
2 reduced ferredoxin + 2 H+ + acetylene + 2 ATP + 2 H2O
-
440168
Xanthobacter autotrophicus
2 oxidized ferredoxin + ethylene + 2 ADP + 2 phosphate
-
440168
Xanthobacter autotrophicus
?
8 reduced ferredoxin + 8 H+ + N2 + 16 ATP + 16 H2O
-
440168
Xanthobacter autotrophicus
8 oxidized ferredoxin + H2 + 2 NH3 + 16 ADP + 16 phosphate
-
-
-
?
8 reduced ferredoxin + 8 H+ + N2 + 16 ATP + 16 H2O
-
440168
Xanthobacter autotrophicus
8 oxidized ferredoxin + H2 + 2 NH3 + 16 ADP + 16 phosphate
-
440168
Xanthobacter autotrophicus
?
Subunits (protein specific)
Subunits
Commentary
Organism
More
-
Xanthobacter autotrophicus
pH Optimum (protein specific)
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
7.1
7.3
with substrates: N2, C2H2
Xanthobacter autotrophicus
pH Range (protein specific)
pH Minimum
pH Maximum
Commentary
Organism
6.5
8.3
pH 6.5: no activity below, pH 8.3: about 70% of activity maximum
Xanthobacter autotrophicus
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No.
1st author
Pub Med
title
organims
journal
volume
pages
year
Activating Compound
Application
Cloned(Commentary)
Crystallization (Commentary)
Engineering
General Stability
Inhibitors
KM Value [mM]
Localization
Metals/Ions
Molecular Weight [Da]
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Organic Solvent Stability
Organism
Oxidation Stability
Posttranslational Modification
Purification (Commentary)
Reaction
Renatured (Commentary)
Source Tissue
Specific Activity [micromol/min/mg]
Storage Stability
Substrates and Products (Substrate)
Subunits
Temperature Optimum [░C]
Temperature Range [░C]
Temperature Stability [░C]
Turnover Number [1/s]
pH Optimum
pH Range
pH Stability
Cofactor
Ki Value [mM]
pI Value
IC50 Value
Activating Compound (protein specific)
Application (protein specific)
Cloned(Commentary) (protein specific)
Cofactor (protein specific)
Crystallization (Commentary) (protein specific)
Engineering (protein specific)
General Stability (protein specific)
IC50 Value (protein specific)
Inhibitors (protein specific)
Ki Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM] (protein specific)
Localization (protein specific)
Metals/Ions (protein specific)
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Organic Solvent Stability (protein specific)
Oxidation Stability (protein specific)
Posttranslational Modification (protein specific)
Purification (Commentary) (protein specific)
Renatured (Commentary) (protein specific)
Source Tissue (protein specific)
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Storage Stability (protein specific)
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Subunits (protein specific)
Temperature Optimum [░C] (protein specific)
Temperature Range [░C] (protein specific)
Temperature Stability [░C] (protein specific)
Turnover Number [1/s] (protein specific)
pH Optimum (protein specific)
pH Range (protein specific)
pH Stability (protein specific)
pI Value (protein specific)
Expression
General Information
General Information (protein specific)
Expression (protein specific)
KCat/KM [mM/s]
KCat/KM [mM/s] (protein specific)
744940
Buren
State of the art in eukaryoti ...
Azotobacter vinelandii
FEMS Microbiol. Lett.
365
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2018
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745506
Keable
Structural characterization o ...
Azotobacter vinelandii, Azotobacter vinelandii DJ1264
J. Inorg. Biochem.
180
129-134
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744073
Xue
Characterization of co-cultiv ...
Anabaena cylindrica, Anabaena cylindrica B1611, Anabaena cylindrica F243, Nostoc sp., Nostoc sp. F280
Appl. Biochem. Biotechnol.
181
340-349
2017
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Sickerman
Activation of CO2 by vanadium ...
Azotobacter vinelandii
Chem. Asian J.
12
1985-1996
2017
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745173
Morrison
Reversible protonated resting ...
Azotobacter vinelandii, Clostridium pasteurianum
J. Am. Chem. Soc.
139
10856-10862
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745223
Vernon
Role of the nifB1 and nifB2 p ...
Trichormus variabilis
J. Bacteriol.
199
e00674
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745505
Dance
New insights into the reactio ...
Azotobacter vinelandii
J. Inorg. Biochem.
169
32-43
2017
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745841
Rebelein
Activation and reduction of c ...
Azotobacter vinelandii
Nat. Chem. Biol.
13
147-149
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746480
Stal
The effect of oxygen concentr ...
Fischerella sp.
Sci. Rep.
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5402
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745705
Li
Using synthetic biology to in ...
Paenibacillus polymyxa
Microb. Cell Fact.
15
43
2016
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Ivleva
Expression of active subunit ...
Azotobacter vinelandii
PLoS ONE
11
e0160951
2016
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744333
Morrison
Substrate pathways in the nit ...
Azotobacter vinelandii, Clostridium pasteurianum, Klebsiella pneumoniae
Biochemistry
54
2052-2060
2015
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744780
Spatzal
Catalysis-dependent selenium ...
Azotobacter vinelandii
eLife
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745127
McDonald
Nitrogenase diversity and act ...
Clostridium aerotolerans, Dysgonomonas capnocytophagoides, Klebsiella oxytoca, Stenotrophomonas sp. gx-44
ISME J.
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Lukoyanov
Identification of a key catal ...
Azotobacter vinelandii, Azotobacter vinelandii DJ995
J. Am. Chem. Soc.
137
3610-3615
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Fay
Identification and characteri ...
Azotobacter vinelandii
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
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2015
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742740
Shaw
Nitrite and hydroxylamine as ...
Azotobacter vinelandii
J. Am. Chem. Soc.
136
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2014
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Yang
Turnover-dependent inactivati ...
Azotobacter vinelandii
Biochemistry
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Scott
Structural characterization o ...
Azotobacter vinelandii
J. Am. Chem. Soc.
136
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2014
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745384
Hu
A journey into the active cen ...
Azotobacter vinelandii, Clostridium pasteurianum
J. Biol. Inorg. Chem.
19
731-736
2014
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Dos Santos
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101
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673039
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2807-2809
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Biochim. Biophys. Acta
1750
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Oxygen concentration affects n ...
Alnus maritima
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Tejera
Influence of carbon and nitrog ...
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Rubio
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Cui
Binding sites of nitrogenase: ...
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Karr
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The Fe-only nitrogenase and th ...
Rhodobacter capsulatus, Rhodobacter capsulatus B10S
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Christiansen
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Enhanced efficiency of ATP hyd ...
Azotobacter vinelandii, Azotobacter vinelandii OP, Clostridium pasteurianum
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Duyvis
Nitrogenase of Azotobacter vin ...
Azotobacter vinelandii
Biochemistry
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Christiansen
Catalytic and biophysical prop ...
Azotobacter vinelandii
Biochemistry
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12611-12623
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Bursey
Characterization of a variant ...
Azotobacter vinelandii
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1998
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Dilworth
Effects on substrate reduction ...
Azotobacter vinelandii
Biochemistry
37
17495-17505
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440176
Schneider
Comparative biochemical charac ...
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789-800
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Reduction of thiocyanate, cyan ...
Azotobacter vinelandii
Biochemistry
36
8574-8585
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Johnson
Steady-state kinetic studies o ...
Azotobacter vinelandii
Biochemistry
35
11336-11342
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Blanchard
Isolation of two forms of the ...
Azotobacter vinelandii
Biochemistry
35
472-478
1996
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2798-2808
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33
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1994
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440166
Oelze
-
Mechanismen zum Schutz der Sau ...
Anabaena sp., Azospirillum brasilense, Azotobacter chroococcum, Azotobacter sp., Azotobacter vinelandii, Frankia sp., Gloeothece sp., Klebsiella pneumoniae, Oscillatoria sp., Rhizobium sp., Rhodospirillum rubrum, Trichormus variabilis
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4
116-126
1988
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440134
Haaker
-
The bioenergetics of electron ...
Anabaena cylindrica, Anabaena sp., Azospirillum sp., Azotobacter sp., Azotobacter vinelandii, Chlorobium sp., Chromatium sp., Clostridium pasteurianum, Desulfovibrio sp., Frankia sp., Gloeothece sp., Klebsiella pneumoniae, Leptolyngbya boryana, Paenibacillus polymyxa, Rhizobium leguminosarum, Rhizobium sp., Rhizobium sp. ORS 571, Rhodobacter sphaeroides, Rhodopseudomonas sp., Rhodospirillum rubrum
FEMS Microbiol. Rev.
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57-71
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Characterization of the metal ...
Azotobacter vinelandii
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Shah
Isolation and characterization ...
Klebsiella pneumoniae
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Vignais
Hydrogenase, nitrogenase, and ...
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Hirschberg
-
Cloning and characterization o ...
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440161
Song
Purification and properties of ...
Nitrospirillum amazonense, Nitrospirillum amazonense Y1
J. Bacteriol.
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1271-1277
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Kush
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Nitrogenase of Sesbania Rhizob ...
Rhizobium sp.
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131
1765-1777
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Shah
Molybdenum in nitrogenase ...
Azotobacter vinelandii, Clostridium pasteurianum, Klebsiella pneumoniae, Paenibacillus polymyxa
Annu. Rev. Biochem.
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231-257
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440148
Houchins
-
The physiology and biochemistr ...
Cyanobacterium sp., Trichormus variabilis
Biochim. Biophys. Acta
768
227-255
1984
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-
440151
Fuhrmann
-
Coding properties of cloned ni ...
Bradyrhizobium japonicum
Mol. Gen. Genet.
187
419-425
1982
-
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440143
Eady
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Isolation and characterization ...
Allochromatium vinosum, Azotobacter chroococcum, Azotobacter vinelandii, Bradyrhizobium japonicum, Bradyrhizobium lupini, Clostridium pasteurianum, Klebsiella pneumoniae, Paenibacillus polymyxa, Rhodospirillum rubrum
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1980
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Large-scale purification of hi ...
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Biochim. Biophys. Acta
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440146
Mortenson
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Purification and properties of ...
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Eur. J. Biochem.
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The nitrogen-fixing system of ...
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Paenibacillus polymyxa
Biochim. Biophys. Acta
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1978
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440144
Winter
Nitrogenase ...
Allochromatium vinosum, Anabaena cylindrica, Azotobacter chroococcum, Azotobacter vinelandii, Bradyrhizobium japonicum, Bradyrhizobium lupini, Clostridium pasteurianum, Corynebacterium flavescens, Klebsiella pneumoniae, Paenibacillus polymyxa, Rhodospirillum rubrum
Annu. Rev. Biochem.
45
409-426
1976
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Palmer
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Iron-sulfur proteins ...
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1975
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440167
Yates
Nitrogenase from Azotobacter c ...
Azotobacter chroococcum
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60
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1975
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440174
Zumft
The nitrogen-fixing complex of ...
Azotobacter vinelandii, Chromatium sp., Clostridium pasteurianum, Klebsiella pneumoniae, Rhizobium sp.
Biochim. Biophys. Acta
416
1-52
1975
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440145
Eady
Nitrogenase ...
Allochromatium vinosum, Anabaena cylindrica, Azotobacter chroococcum, Azotobacter vinelandii, Bradyrhizobium japonicum, Bradyrhizobium lupini, Clostridium pasteurianum, Corynebacterium flavescens 301, Corynebacterium flavescens, Desulfovibrio desulfuricans, Escherichia coli, Escherichia coli C-M 74, Gloeocapsa sp., Klebsiella pneumoniae, Leptolyngbya boryana, Ornithopus sativus, Paenibacillus polymyxa, Rhizobium sp., Rhodospirillum rubrum
Nature
249
805-810
1974
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440164
Tso
Some properties of the nitroge ...
Clostridium pasteurianum
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1974
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440165
Whitting
Legume root nodule nitrogenase ...
Bradyrhizobium lupini
Biochim. Biophys. Acta
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337-351
1974
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Burns
Purification of nitrogenase an ...
Azotobacter vinelandii
Methods Enzymol.
24
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440158
Bulen
Nitrogenase complex and its co ...
Azotobacter vinelandii
Methods Enzymol.
24B
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Mortenson
Purification aof nitrogenase f ...
Clostridium pasteurianum
Methods Enzymol.
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