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show all sequences of 4.3.1.24

The metabolism of aromatic compounds in higher plants. IV. Purification and properties of the phenylalanine deaminase of Hordeum vulgare

Koukol, J.; Conn, E.E.; J. Biol. Chem. 236, 2692-2698 (1961)

Data extracted from this reference:

Inhibitors
Inhibitors
Commentary
Organism
Structure
3,4-dihydroxyphenyl-DL-Ala
-
Hordeum vulgare
4-coumarate
trans-p-coumarate, competitive
Hordeum vulgare
4-coumarate
-
Medicago sativa
4-coumarate
-
Oryza sativa
beta-phenyl-DL-Ser
-
Hordeum vulgare
Ca2+
CaCl2, 1 mM, 57% inhibition
Hordeum vulgare
Cd2+
CdCl2, 1 mM, 100% inhibition
Hordeum vulgare
Cinnamic acid
trans-cinnamic acid
Hordeum vulgare
Cinnamic acid
-
Oryza sativa
Cinnamic acid
-
Medicago sativa
CN-
KCN, 1 mM, 85% inhibition
Hordeum vulgare
Cu2+
CuSO4, 1 mM, 18% inactivation
Hordeum vulgare
GSH
-
Hordeum vulgare
Hg2+
HgCl2, 0.01 mM, 100% inhibition
Hordeum vulgare
iodoacetamide
-
Hordeum vulgare
L-Cys
-
Hordeum vulgare
p-chloromercuriphenylsulfonic acid
-
Hordeum vulgare
Tyr
competitive; L-Tyr
Hordeum vulgare
Tyr
-
Medicago sativa
Zn2+
ZnSO4, 1 mM, 32% inhibition
Hordeum vulgare
KM Value [mM]
KM Value [mM]
KM Value Maximum [mM]
Substrate
Commentary
Organism
Structure
1.7
-
L-Phe
-
Hordeum vulgare
Organism
Organism
Primary Accession No. (UniProt)
Commentary
Textmining
Hordeum vulgare
-
L. var. Aravat
-
Lupinus sp.
-
-
-
Medicago sativa
-
-
-
Melilotus officinalis
-
-
-
Oryza sativa
-
-
-
Pisum sativum
-
-
-
Purification (Commentary)
Commentary
Organism
-
Hordeum vulgare
Storage Stability
Storage Stability
Organism
-10°C, 25% loss of activity after 3.5 months
Hordeum vulgare
Substrates and Products (Substrate)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
L-Phe
-
34330
Lupinus sp.
(E)-cinnamate + NH3
-
34330
Lupinus sp.
?
L-Phe
-
34330
Pisum sativum
(E)-cinnamate + NH3
-
34330
Pisum sativum
?
L-Phe
-
34330
Medicago sativa
(E)-cinnamate + NH3
-
34330
Medicago sativa
?
L-Phe
-
34330
Oryza sativa
(E)-cinnamate + NH3
-
34330
Oryza sativa
?
L-Phe
-
34330
Melilotus officinalis
(E)-cinnamate + NH3
-
34330
Melilotus officinalis
?
L-Phe
no activity with D-Phe
34330
Hordeum vulgare
(E)-cinnamate + NH3
-
34330
Hordeum vulgare
?
pH Optimum
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
8.8
9.2
-
Hordeum vulgare
8.8
9.2
-
Medicago sativa
pH Range
pH Minimum
pH Maximum
Commentary
Organism
7
10.5
pH 7: about 35% of maximal activity, pH 10.5: about 70% of maximal activity
Hordeum vulgare
Inhibitors (protein specific)
Inhibitors
Commentary
Organism
Structure
3,4-dihydroxyphenyl-DL-Ala
-
Hordeum vulgare
4-coumarate
trans-p-coumarate, competitive
Hordeum vulgare
4-coumarate
-
Medicago sativa
4-coumarate
-
Oryza sativa
beta-phenyl-DL-Ser
-
Hordeum vulgare
Ca2+
CaCl2, 1 mM, 57% inhibition
Hordeum vulgare
Cd2+
CdCl2, 1 mM, 100% inhibition
Hordeum vulgare
Cinnamic acid
trans-cinnamic acid
Hordeum vulgare
Cinnamic acid
-
Oryza sativa
Cinnamic acid
-
Medicago sativa
CN-
KCN, 1 mM, 85% inhibition
Hordeum vulgare
Cu2+
CuSO4, 1 mM, 18% inactivation
Hordeum vulgare
GSH
-
Hordeum vulgare
Hg2+
HgCl2, 0.01 mM, 100% inhibition
Hordeum vulgare
iodoacetamide
-
Hordeum vulgare
L-Cys
-
Hordeum vulgare
p-chloromercuriphenylsulfonic acid
-
Hordeum vulgare
Tyr
competitive; L-Tyr
Hordeum vulgare
Tyr
-
Medicago sativa
Zn2+
ZnSO4, 1 mM, 32% inhibition
Hordeum vulgare
KM Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM]
KM Value Maximum [mM]
Substrate
Commentary
Organism
Structure
1.7
-
L-Phe
-
Hordeum vulgare
Purification (Commentary) (protein specific)
Commentary
Organism
-
Hordeum vulgare
Storage Stability (protein specific)
Storage Stability
Organism
-10°C, 25% loss of activity after 3.5 months
Hordeum vulgare
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
L-Phe
-
34330
Lupinus sp.
(E)-cinnamate + NH3
-
34330
Lupinus sp.
?
L-Phe
-
34330
Pisum sativum
(E)-cinnamate + NH3
-
34330
Pisum sativum
?
L-Phe
-
34330
Medicago sativa
(E)-cinnamate + NH3
-
34330
Medicago sativa
?
L-Phe
-
34330
Oryza sativa
(E)-cinnamate + NH3
-
34330
Oryza sativa
?
L-Phe
-
34330
Melilotus officinalis
(E)-cinnamate + NH3
-
34330
Melilotus officinalis
?
L-Phe
no activity with D-Phe
34330
Hordeum vulgare
(E)-cinnamate + NH3
-
34330
Hordeum vulgare
?
pH Optimum (protein specific)
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
8.8
9.2
-
Hordeum vulgare
8.8
9.2
-
Medicago sativa
pH Range (protein specific)
pH Minimum
pH Maximum
Commentary
Organism
7
10.5
pH 7: about 35% of maximal activity, pH 10.5: about 70% of maximal activity
Hordeum vulgare
Other publictions for EC 4.3.1.24
No.
1st author
Pub Med
title
organims
journal
volume
pages
year
Activating Compound
Application
Cloned(Commentary)
Crystallization (Commentary)
Engineering
General Stability
Inhibitors
KM Value [mM]
Localization
Metals/Ions
Molecular Weight [Da]
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Organic Solvent Stability
Organism
Oxidation Stability
Posttranslational Modification
Purification (Commentary)
Reaction
Renatured (Commentary)
Source Tissue
Specific Activity [micromol/min/mg]
Storage Stability
Substrates and Products (Substrate)
Subunits
Temperature Optimum [°C]
Temperature Range [°C]
Temperature Stability [°C]
Turnover Number [1/s]
pH Optimum
pH Range
pH Stability
Cofactor
Ki Value [mM]
pI Value
IC50 Value
Activating Compound (protein specific)
Application (protein specific)
Cloned(Commentary) (protein specific)
Cofactor (protein specific)
Crystallization (Commentary) (protein specific)
Engineering (protein specific)
General Stability (protein specific)
IC50 Value (protein specific)
Inhibitors (protein specific)
Ki Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM] (protein specific)
Localization (protein specific)
Metals/Ions (protein specific)
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Organic Solvent Stability (protein specific)
Oxidation Stability (protein specific)
Posttranslational Modification (protein specific)
Purification (Commentary) (protein specific)
Renatured (Commentary) (protein specific)
Source Tissue (protein specific)
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Storage Stability (protein specific)
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Subunits (protein specific)
Temperature Optimum [°C] (protein specific)
Temperature Range [°C] (protein specific)
Temperature Stability [°C] (protein specific)
Turnover Number [1/s] (protein specific)
pH Optimum (protein specific)
pH Range (protein specific)
pH Stability (protein specific)
pI Value (protein specific)
Expression
General Information
General Information (protein specific)
Expression (protein specific)
KCat/KM [mM/s]
KCat/KM [mM/s] (protein specific)
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Parmeggiani
; Weise, N.J.; Ahmed, S.T.; Tu ...
Taxus wallichiana var. chinensis
Chem. Rev.
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73-118
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Filip
Tailored mutants of phenylala ...
Petroselinum crispum
ChemCatChem
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Li
Functional characterization o ...
Lycoris radiata
Int. J. Biol. Macromol.
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Nag
In silico characterization an ...
Vanda coerulea, Vanda coerulea Griff. ex Lindl.
Phytochemistry
156
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Jun
Biochemical and structural an ...
Sorghum bicolor
Plant Physiol.
176
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Zhang
Modulating the pH activity pr ...
Trichormus variabilis, Trichormus variabilis FACHB-82
Appl. Biochem. Biotechnol.
183
699-711
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747493
Zon
1-Aminobenzocyclobutene-1-pho ...
Fagopyrum esculentum
Chem. Biodivers.
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e1600488
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747521
Li
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A Novel Phenylalanine Ammonia ...
Rhodotorula paludigena, Rhodotorula paludigena PT3
Chem. Nat. Compd.
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406-407
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Dressen
Phenylalanine ammonia lyase f ...
Arabidopsis thaliana, Petroselinum crispum
J. Biotechnol.
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748274
Dressen
Phenylalanine ammonia lyase f ...
Arabidopsis thaliana
J. Biotechnol.
258
158-166
2017
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Bencze
Expanding the substrate scope ...
Petroselinum crispum
Org. Biomol. Chem.
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12
749332
Weise
Zymophore identification enab ...
Brevibacillus laterosporus, Dictyostelium discoideum, Methylobacterium sp., Rubinisphaera brasiliensis, Rubinisphaera brasiliensis ATCC 49424, Streptomyces rimosus, Trichormus variabilis
Sci. Rep.
7
13691
2017
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747708
Ganapathy
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Correlation of phenylalanine ...
Zingiber officinale Rosc., Zingiber zerumbet, Zingiber zerumbet L. Smith
Eur. J. Plant Pathol.
145
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Sameshima
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Cloning of phenylalanine ammo ...
Vigna radiata
Food Sci. Technol. Res.
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Sirin
Biochemical evaluation of phe ...
Cyathobasis fruticulosa
Food Technol. Biotechnol.
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Babaoglu Aydas
Biochemical analysis of Centa ...
Centaurea depressa
Pharm. Biol.
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Tetrahedron
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Scutellaria baicalensis
OnLine J. Biol. Sci.
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Trichormus variabilis
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Fragaria x ananassa, Ribes nigrum, Ribes rubrum, Rubus plicatus
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Euphorbia pulcherrima, Euphorbia pulcherrima willd.
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Bazukyan
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Catalytic properties of Rhodot ...
Buckleyzyma aurantiaca, Buckleyzyma aurantiaca KM-1, Rhodotorula glutinis
Appl. Biochem. Microbiol.
45
17-21
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699800
Kovacik
Phenolic metabolism of Matrica ...
Matricaria chamomilla
J. Plant Physiol.
166
1460-1464
2009
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Reichert
Phenylalanine ammonia-lyase (P ...
Nicotiana tabacum
Biochem. J.
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233-242
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Kumari
Combined effects of Psoralens ...
Abelmoschus esculentus
Ecotoxicol. Environ. Saf.
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1129-1136
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Ortega-Garcia
Phenylalanine ammonia-lyase, p ...
Olea europaea
J. Agric. Food Chem.
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10331-10340
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Xiao
Spatial-temporal distribution ...
Taxus cuspidata
J. Biotechnol.
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Sircar
Accumulation of p-hydroxybenzo ...
Daucus carota
J. Plant Physiol.
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1370-1380
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Zheng
Nitric oxide mediates the fung ...
Inonotus obliquus
Microbiology
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3440-3448
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Guo
Characterization of the phenyl ...
Solanum lycopersicum
Mol. Biol. Rep.
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Osakabe
Characterization of the tissue ...
Pinus taeda
Plant Cell Rep.
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Kovacik
Salicylic acid-induced changes ...
Matricaria chamomilla
Plant Cell Rep.
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McInnis
The ornamental variety, Japane ...
Zea mays
Plant Cell Rep.
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680331
Wall
Manganese (Mn2+)-dependent sto ...
Rhodotorula glutinis, Rhodotorula glutinis RE4607095D
J. Agric. Food Chem.
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894-902
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Accumulation of phenylpropanoi ...
Cocos nucifera
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Molecular cloning, characteriz ...
Ginkgo biloba
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Enhancement of phenylalanine a ...
Cucumis sativus
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Kiselev
Phenylalanine ammonia-lyase an ...
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Appl. Microbiol. Biotechnol.
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Okada
Molecular characterization of ...
Ephedra sinica
Biol. Pharm. Bull.
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2194-2199
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Godinez-Vidal
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Phenylalanine ammonia lyase ac ...
Capsicum annuum
Eur. J. Plant Pathol.
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299-303
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Shah
Strategies to maximize the enc ...
Rhodotorula glutinis
Int. J. Pharm.
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Lam
Retention of phenylalanine amm ...
Triticum aestivum
J. Agric. Food Chem.
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11407-11412
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Chang
Tomato phenylalanine ammonia-l ...
Solanum lycopersicum
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Phenylalanine ammonia lyase fu ...
Astragalus mongholicus
J. Exp. Bot.
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Structural and biochemical cha ...
Trichormus variabilis
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187
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2005
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Colocalization of L-phenylalan ...
Nicotiana tabacum
Plant Cell
16
3098-3109
2004
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Crystal structure of phenylala ...
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Biochemistry
43
11403-11416
2004
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Isolation and characterization ...
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86
3601-3612
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51
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Zon
Inhibitors of phenylalanine am ...
Fagopyrum esculentum
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Properties of phenylalanine am ...
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Gossypium hirsutum
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Solanum tuberosum
Acta Biochim. Pol.
41
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Structural and catalytic prope ...
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1
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-
2
1
1
-
-
2
1
-
-
-
-
-
-
-
-
-
34358
Campbell
Fungal elicitor-mediated respo ...
Pinus banksiana, Sporidiobolus pararoseus
Plant Physiol.
98
62-70
1992
-
-
-
-
-
-
6
1
-
-
3
1
-
4
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-
1
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1
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1
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-
6
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3
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3
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-
-
1
-
-
-
-
-
-
-
-
-
34359
Whetten
Phenylalanine ammonia-lyase fr ...
Pinus taeda
Plant Physiol.
98
380-386
1992
-
-
1
-
-
-
-
1
-
-
2
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-
4
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1
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2
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1
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2
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1
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2
1
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1
1
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-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
34329
Bolwell
L-phenylalanine ammonia-lyase ...
Phaseolus vulgaris
Biochem. J.
279
231-236
1991
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
2
1
-
2
-
-
1
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-
2
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-
2
1
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-
2
1
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-
1
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2
-
-
2
1
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
660529
Crosby
-
Synthesis of optically active ...
Rhodococcus rubra, Rhodotorula mucilaginosa
Tetrahedron
47
4789-4846
1991
-
2
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
2
2
-
-
-
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2
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2
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2
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2
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2
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-
-
2
-
2
-
-
-
2
-
-
-
-
-
-
-
-
-
34356
Dubery
-
Effect of hydroxylated and met ...
Citrus sinensis
Phytochemistry
29
2107-2108
1990
3
-
-
-
-
-
2
-
-
-
-
-
-
1
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-
1
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1
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2
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-
1
-
-
1
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
34357
Jorrin
Stress responses in alfalfa (M ...
Medicago sativa
Plant Physiol.
92
447-455
1990
-
-
-
-
-
-
14
3
-
-
3
-
-
3
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3
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-
14
-
3
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3
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3
1
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1
1
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
34361
Minami
Structure and some characteriz ...
Oryza sativa
Eur. J. Biochem.
185
19-25
1989
-
-
1
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
3
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-
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-
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-
-
1
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
34336
Nagai
-
Effects of kinetin on L-phenyl ...
Nicotiana tabacum
Agric. Biol. Chem.
52
2617-2619
1988
-
-
-
-
-
-
-
2
-
-
2
-
-
1
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1
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1
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2
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2
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1
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1
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-
1
1
1
-
-
-
1
-
-
-
-
-
-
-
-
-
34337
Chen
-
Phenylalanine ammonia-lyase of ...
Bambusa oldhamii
Agric. Biol. Chem.
52
2137-2142
1988
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
2
-
-
1
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1
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2
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-
1
1
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
34338
Given
-
Purification and properties of ...
Fragaria x ananassa
J. Plant Physiol.
133
31-37
1988
-
-
-
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-
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-
-
-
-
2
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1
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1
1
-
1
1
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
34340
Havir
-
L-Phenylalanine ammonia-lyase ...
Glycine max
Methods Enzymol.
142
248-253
1987
-
1
-
-
-
-
-
2
-
-
2
-
-
1
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1
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1
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1
1
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
34351
Kehrel
Immunochemical localization of ...
Tulipa hybrid cultivar, Tulipa hybrid cultivar Appeldoorn
Planta
163
183-190
1985
-
-
-
-
-
-
-
-
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-
-
-
3
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1
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-
1
1
-
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-
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-
-
-
-
-
-
-
34334
Hanson
-
Phenylalanine ammonia-lyase ...
Avena sativa, Cucumis sativus, Dunaliella marina, Fagopyrum esculentum, Glycine max, Helianthus annuus, Hordeum vulgare, Ipomoea batatas, Nasturtium officinale, Petroselinum crispum, Petunia x hybrida, Quercus pedunculata, Rhizoctonia solani, Ricinus communis, Sinapis alba, Solanum tuberosum, Sorghum bicolor, Spinacia oleracea, Streptomyces verticillatus, Triticum aestivum, Tropaeolum majus, Zea mays
Biochem. Plants
7
577-625
1981
-
-
-
-
-
-
-
20
28
-
18
-
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22
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22
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20
28
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18
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22
7
-
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-
-
1
-
-
-
-
-
-
-
-
-
34342
Havir
Phenylalanine ammonia-lyase: p ...
Glycine max
Arch. Biochem. Biophys.
211
556-563
1981
-
-
-
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-
-
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-
-
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-
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-
-
-
34343
Gupta
Purification to homogeneity an ...
Sinapis alba
Biochim. Biophys. Acta
570
187-197
1979
-
-
-
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1
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-
1
-
-
-
-
-
-
-
-
-
34345
Kalghatgi
Microbial L-phenylalanine ammo ...
Rhizoctonia solani
Biochem. J.
149
65-72
1975
-
-
-
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-
13
-
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-
-
1
-
-
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-
-
-
-
-
-
34352
Vance
-
Further observations on phenyl ...
Armillaria mellea, Bovista sp., Clavaria cristata, Fomes subroseus, Phlebia tremellosa, Polyporus adustus, Ramaria secunda, Schizophyllum commune, Sporobolomyces roseus, Steccherinum adustum, Tricladium splendens
Phytochemistry
14
1513-1514
1975
-
-
-
-
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-
11
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-
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11
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11
-
-
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-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
34333
Pridham
-
Multimolecular forms of phenyl ...
Alternaria sp.
Biochem. Soc. Trans.
2
1070-1072
1974
-
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4
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-
2
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-
-
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-
-
34346
Jangaard
-
The characterization of phenyl ...
Amaranthus retroflexus, Cenchrus americanus, Cyperus esculentus, Digitaria sanguinalis, Gossypium hirsutum, Ipomoea purpurea, Pteridium sp., Setaria viridis, Triticum aestivum, Xanthium pennsylvanicum
Phytochemistry
13
1765-1768
1974
-
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-
-
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10
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10
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-
10
-
-
-
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-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
34347
Iredale
-
Properties of phenylalanine am ...
Cucumis sativus
Phytochemistry
13
575-583
1974
-
-
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-
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6
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-
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-
-
-
-
-
-
-
34331
Havir
L-Phenylalanine ammonia-lyase ...
Solanum tuberosum, Zea mays
Biochemistry
12
1583-1591
1973
-
-
-
-
-
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-
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-
-
2
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-
2
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3
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2
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3
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-
2
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-
-
-
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-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
34332
Camm
-
Phenylalanine ammonia lyase ...
Avena sativa, Hordeum vulgare, Ipomoea batatas, Nicotiana tabacum, Pisum sativum, Pteridium aquilinum, Quercus pedunculata, Rhodotorula glutinis, Rhodotorula texensis, Solanum tuberosum, Sporobolomyces roseus, Streptomyces verticillatus, Tulipa hybrid cultivar, Ustilago hordei
Phytochemistry
12
961-973
1973
-
-
-
-
-
-
27
9
-
-
2
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14
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27
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9
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1
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-
22
-
-
-
-
-
9
-
-
-
-
-
-
-
-
-
34349
Nari
-
Some physico-chemical properti ...
Triticum aestivum
FEBS Lett.
23
220-224
1972
-
-
-
-
-
-
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-
3
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-
1
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-
-
34330
Koukol
The metabolism of aromatic com ...
Hordeum vulgare, Lupinus sp., Medicago sativa, Melilotus officinalis, Oryza sativa, Pisum sativum
J. Biol. Chem.
236
2692-2698
1961
-
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-
-
20
1
-
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20
-
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