BRENDA - Enzyme Database show
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Nutrient-starved, non-replicating Mycobacterium tuberculosis requires respiration, ATP synthase and isocitrate lyase for maintenance of ATP homeostasis and viability

Gengenbacher, M.; Rao, S.P.; Pethe, K.; Dick, T.; Microbiology 156, 81-87 (2010)

Data extracted from this reference:

Cloned(Commentary)
Commentary
Organism
ICL loss-of-function mutant strain DELTAicl complemented with the functional ICL gene using the integrative vector pMV306
Mycobacterium tuberculosis
Organism
Organism
Primary Accession No. (UniProt)
Commentary
Textmining
Mycobacterium tuberculosis
P9WKK7
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Mycobacterium tuberculosis H37Rv
P9WKK7
-
-
Cloned(Commentary) (protein specific)
Commentary
Organism
ICL loss-of-function mutant strain DELTAicl complemented with the functional ICL gene using the integrative vector pMV306
Mycobacterium tuberculosis
General Information
General Information
Commentary
Organism
malfunction
nutrient-starved bacilli lacking the glyoxylate shunt enzyme isocitrate lyase fail to reduce their intracellular ATP level and die, thus establishing a link between ATP control and intermediary metabolism. ICL loss-of-function mutant dies in the Loebel model. Viability is fully restored when the mutant strain is complemented with a wild-type copy of ICL
Mycobacterium tuberculosis
physiological function
ICL gene is required for non-growing survival in the Loebel model (nutrient deprivation in oxygen-rich medium)
Mycobacterium tuberculosis
General Information (protein specific)
General Information
Commentary
Organism
malfunction
nutrient-starved bacilli lacking the glyoxylate shunt enzyme isocitrate lyase fail to reduce their intracellular ATP level and die, thus establishing a link between ATP control and intermediary metabolism. ICL loss-of-function mutant dies in the Loebel model. Viability is fully restored when the mutant strain is complemented with a wild-type copy of ICL
Mycobacterium tuberculosis
physiological function
ICL gene is required for non-growing survival in the Loebel model (nutrient deprivation in oxygen-rich medium)
Mycobacterium tuberculosis
Other publictions for EC 4.1.3.1
No.
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organims
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Activating Compound
Application
Cloned(Commentary)
Crystallization (Commentary)
Engineering
General Stability
Inhibitors
KM Value [mM]
Localization
Metals/Ions
Molecular Weight [Da]
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Organic Solvent Stability
Organism
Oxidation Stability
Posttranslational Modification
Purification (Commentary)
Reaction
Renatured (Commentary)
Source Tissue
Specific Activity [micromol/min/mg]
Storage Stability
Substrates and Products (Substrate)
Subunits
Temperature Optimum [°C]
Temperature Range [°C]
Temperature Stability [°C]
Turnover Number [1/s]
pH Optimum
pH Range
pH Stability
Cofactor
Ki Value [mM]
pI Value
IC50 Value
Activating Compound (protein specific)
Application (protein specific)
Cloned(Commentary) (protein specific)
Cofactor (protein specific)
Crystallization (Commentary) (protein specific)
Engineering (protein specific)
General Stability (protein specific)
IC50 Value (protein specific)
Inhibitors (protein specific)
Ki Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM] (protein specific)
Localization (protein specific)
Metals/Ions (protein specific)
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Organic Solvent Stability (protein specific)
Oxidation Stability (protein specific)
Posttranslational Modification (protein specific)
Purification (Commentary) (protein specific)
Renatured (Commentary) (protein specific)
Source Tissue (protein specific)
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Storage Stability (protein specific)
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Subunits (protein specific)
Temperature Optimum [°C] (protein specific)
Temperature Range [°C] (protein specific)
Temperature Stability [°C] (protein specific)
Turnover Number [1/s] (protein specific)
pH Optimum (protein specific)
pH Range (protein specific)
pH Stability (protein specific)
pI Value (protein specific)
Expression
General Information
General Information (protein specific)
Expression (protein specific)
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Indole alkaloids from tropica ...
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Active site flexibility of My ...
Mycobacterium tuberculosis
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Distant Phe345 mutation compr ...
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Insight into the structural f ...
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Potential inhibitors for isoc ...
Acinetobacter calcoaceticus, Candida albicans, Escherichia coli, Magnaporthe grisea, Mycobacterium tuberculosis, Neurospora crassa, Ricinus communis, Vogesella indigofera
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Characterization of a functio ...
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Isocitrate lyase mediates bro ...
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Synthesis and in vitro antimyc ...
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Major roles of isocitrate lyas ...
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Gene cloning of cold-adapted i ...
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Isocitrate lyase from Mycobact ...
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651215
Watanabe
Purification and characterizat ...
Colwellia maris
Extremophiles
6
397-405
2002
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651395
Rua
Specific and reversible inacti ...
Phycomyces blakesleeanus
Fungal Genet. Biol.
35
223-234
2002
-
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653163
Kelly
Isocitrate lyase of the facult ...
Rhodococcus hoagii
Microbiology
148
793-798
2002
-
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679815
Uhrigshardt
Evidence for an operative glyo ...
Sulfolobus acidocaldarius
FEBS Lett.
513
223-229
2002
-
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638504
Watanabe
Purification and characterizat ...
Colwellia maris
Biosci. Biotechnol. Biochem.
65
1095-1103
2001
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649253
Britton
The structure and domain organ ...
Escherichia coli
Acta Crystallogr. Sect. D
D57
1209-1218
2001
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650335
Soh
Cloning, heterologous expressi ...
Streptomyces clavuligerus, Streptomyces clavuligerus NRRL 3585
Biochim. Biophys. Acta
1522
112-117
2001
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649361
Klinke
Inactivation of isocitrate lya ...
Pseudomonas putida
Appl. Environ. Microbiol.
66
909-913
2000
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653514
Ranaldi
Multisite inhibition of Pinus ...
Pinus pinea
Plant Physiol.
124
1131-1138
2000
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653939
Britton
The crystal structure and acti ...
Aspergillus nidulans
Structure
8
349-362
2000
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651648
Honer Zu Bentrup
Characterization of activity a ...
Mycobacterium tuberculosis
J. Bacteriol.
181
7161-7167
1999
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653476
Runquist
Control of gluconeogenesis by ...
Ricinus communis
Plant J.
19
423-431
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727500
Serrano
Operation of glyoxylate cycle ...
Haloferax volcanii, Haloferax volcanii DSM 3757
FEBS Lett.
434
13-16
1998
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33141
DeLucas
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Purification and properties of ...
Aspergillus nidulans
Mycol. Res.
101
410-414
1997
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33142
Langridge
Isocitrate lyase from Aspergil ...
Aspergillus nidulans
Acta Crystallogr. Sect. D
53
488-490
1997
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33148
Tanaka
Characterization, gene cloning ...
Hyphomicrobium methylovorum
Eur. J. Biochem.
249
820-825
1997
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Popov
Purification and characterizat ...
Rattus norvegicus
Biokhimiya
61
1898-1903
1996
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33150
Reynolds
The isocitrate lyase gene of c ...
Cucumis sativus
Plant Mol. Biol.
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487-497
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33154
Mullen
-
Isocitrate lyase from germinat ...
Pinus taeda
Plant Physiol. Biochem.
33
87-95
1995
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Gainey
Characterization of the glyoxy ...
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Curr. Genet.
21
43-47
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33147
Khan
The purification and physicoch ...
Zea mays
Arch. Biochem. Biophys.
297
9-18
1992
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33140
Hoyt
Purification and characterizat ...
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J. Bacteriol.
173
6844-6848
1991
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33146
Zarembinski
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Properties of isocitrate lyase ...
Escherichia coli
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Hönes
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Characterization of isocitrate ...
Yarrowia lipolytica
J. Basic Microbiol.
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251-258
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33152
Polanowski
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Soybean isocitrate lyase: Puri ...
Glycine max
Plant Physiol. Biochem.
29
119-129
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33144
Atomi
Peroxisomal isocitrate lyase o ...
Candida tropicalis
J. Biochem.
107
262-266
1990
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33145
Turley
Characterization of a cDNA clo ...
Gossypium hirsutum
Biochim. Biophys. Acta
1049
223-226
1990
-
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33155
Tahama
-
Purification and characterizat ...
Rhodopseudomonas sp.
Agric. Biol. Chem.
54
3177-3183
1990
-
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21
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153-157
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Escherichia coli isocitrate ly ...
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Biochim. Biophys. Acta
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Robertson
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Purification and characterizat ...
Escherichia coli
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Giachetti
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Isocitrate lyase from higher p ...
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Mackintosh
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Purification and properties of ...
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Uchida
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Properties of isocitrate lyase ...
Candida tropicalis
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33121
Tsukamoto
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Purification and some properti ...
Pinus densiflora
Agric. Biol. Chem.
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409-416
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Pinzauti
An isocitrate lyase of higher ...
Pinus pinea
Arch. Biochem. Biophys.
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Takao
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Purification and some properti ...
Byssochlamys spectabilis
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Citrullus lanatus subsp. vulgaris
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Vanni
Studies on isocitrate lyase is ...
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Bacillus sp. (in: Bacteria)
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Khan
Purification and properties of ...
Linum usitatissimum
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Chell
Isolation and characterization ...
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Biochem. Soc. Trans.
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Isocitrate lyase from Neurospo ...
Neurospora crassa, Vogesella indigofera
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Griffiths
Isocitrate lyase from a thermo ...
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Shiio
Isocitrate lyase from Pseudomo ...
Vogesella indigofera
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McFadden
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Crystallization and some prope ...
Vogesella indigofera
J. Biol. Chem.
238
1737-1742
1963
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