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Pre-steady-state kinetics of Bacillus licheniformis 1,3-1,4-beta-glucanase: evidence for a regulatory binding site

Abel, M.; Iversen, K.; Planas, A.; Christensen, U.; Biochem. J. 371, 997-1003 (2003) View publication on PubMedView publication on EuropePMC

Data extracted from this reference:

Inhibitors
Inhibitors
Commentary
Organism
Structure
2,4-dinitrophenyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
-
Bacillus licheniformis
3,4-dinitrophenyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
-
Bacillus licheniformis
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
-
Bacillus licheniformis
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
-
Bacillus licheniformis
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
-
Bacillus licheniformis
KM Value [mM]
KM Value [mM]
KM Value Maximum [mM]
Substrate
Commentary
Organism
Structure
0.5
-
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
pH 7.2, 30°C
Bacillus licheniformis
0.6
-
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
pH 7.2, 30°C
Bacillus licheniformis
0.7
-
3,4-dinitrophenyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
pH 7.2, 30°C
Bacillus licheniformis
0.7
-
2,4-dinitrophenyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
pH 7.2, 30°C
Bacillus licheniformis
1
-
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
pH 7.2, 30°C
Bacillus licheniformis
Organism
Organism
UniProt
Commentary
Textmining
Bacillus licheniformis
-
-
-
Reaction
Reaction
Commentary
Organism
Reaction ID
Hydrolysis of (1->4)-beta-D-glucosidic linkages in beta-D-glucans containing (1->3)- and (1->4)-bonds
allosteric activation mechanism, feedback inhibition
Bacillus licheniformis
Substrates and Products (Substrate)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
Substrate Product ID
2,4-dinitrophenyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc + H2O
-
654518
Bacillus licheniformis
2,4-dinitrophenol + beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
-
-
-
?
3,4-dinitrophenyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc + H2O
-
654518
Bacillus licheniformis
3,4-dinitrophenol + beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
-
-
-
?
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc + H2O
-
654518
Bacillus licheniformis
4-methylumbelliferone + beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
-
-
-
?
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc + H2O
-
654518
Bacillus licheniformis
4-methylumbelliferone + beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
-
-
-
?
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc + H2O
-
654518
Bacillus licheniformis
4-methylumbelliferone + beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
-
-
-
?
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc + H2O
-
654518
Bacillus licheniformis
4-methylumbelliferone + beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
-
-
-
?
Ki Value [mM]
Ki Value [mM]
Ki Value maximum [mM]
Inhibitor
Commentary
Organism
Structure
0.9
-
3,4-dinitrophenyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
pH 7.2, 30°C
Bacillus licheniformis
1.4
-
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
pH 7.2, 30°C
Bacillus licheniformis
2.5
-
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
pH 7.2, 30°C
Bacillus licheniformis
3.5
-
2,4-dinitrophenyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
pH 7.2, 30°C
Bacillus licheniformis
6
-
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
pH 7.2, 30°C
Bacillus licheniformis
Inhibitors (protein specific)
Inhibitors
Commentary
Organism
Structure
2,4-dinitrophenyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
-
Bacillus licheniformis
3,4-dinitrophenyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
-
Bacillus licheniformis
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
-
Bacillus licheniformis
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
-
Bacillus licheniformis
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
-
Bacillus licheniformis
Ki Value [mM] (protein specific)
Ki Value [mM]
Ki Value maximum [mM]
Inhibitor
Commentary
Organism
Structure
0.9
-
3,4-dinitrophenyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
pH 7.2, 30°C
Bacillus licheniformis
1.4
-
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
pH 7.2, 30°C
Bacillus licheniformis
2.5
-
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
pH 7.2, 30°C
Bacillus licheniformis
3.5
-
2,4-dinitrophenyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
pH 7.2, 30°C
Bacillus licheniformis
6
-
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
pH 7.2, 30°C
Bacillus licheniformis
KM Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM]
KM Value Maximum [mM]
Substrate
Commentary
Organism
Structure
0.5
-
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
pH 7.2, 30°C
Bacillus licheniformis
0.6
-
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
pH 7.2, 30°C
Bacillus licheniformis
0.7
-
3,4-dinitrophenyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
pH 7.2, 30°C
Bacillus licheniformis
0.7
-
2,4-dinitrophenyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
pH 7.2, 30°C
Bacillus licheniformis
1
-
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
pH 7.2, 30°C
Bacillus licheniformis
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
ID
2,4-dinitrophenyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc + H2O
-
654518
Bacillus licheniformis
2,4-dinitrophenol + beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
-
-
-
?
3,4-dinitrophenyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc + H2O
-
654518
Bacillus licheniformis
3,4-dinitrophenol + beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
-
-
-
?
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc + H2O
-
654518
Bacillus licheniformis
4-methylumbelliferone + beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
-
-
-
?
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc + H2O
-
654518
Bacillus licheniformis
4-methylumbelliferone + beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
-
-
-
?
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc + H2O
-
654518
Bacillus licheniformis
4-methylumbelliferone + beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
-
-
-
?
4-methylumbelliferyl-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc + H2O
-
654518
Bacillus licheniformis
4-methylumbelliferone + beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-4)-beta-D-Glc-(1-3)-beta-D-Glc
-
-
-
?
Other publictions for EC 3.2.1.73
No.
1st author
Pub Med
title
organims
journal
volume
pages
year
Activating Compound
Application
Cloned(Commentary)
Crystallization (Commentary)
Protein Variants
General Stability
Inhibitors
KM Value [mM]
Localization
Metals/Ions
Molecular Weight [Da]
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Organic Solvent Stability
Organism
Oxidation Stability
Posttranslational Modification
Purification (Commentary)
Reaction
Renatured (Commentary)
Source Tissue
Specific Activity [micromol/min/mg]
Storage Stability
Substrates and Products (Substrate)
Subunits
Synonyms
Temperature Optimum [°C]
Temperature Range [°C]
Temperature Stability [°C]
Turnover Number [1/s]
pH Optimum
pH Range
pH Stability
Cofactor
Ki Value [mM]
pI Value
IC50 Value
Activating Compound (protein specific)
Application (protein specific)
Cloned(Commentary) (protein specific)
Cofactor (protein specific)
Crystallization (Commentary) (protein specific)
Engineering (protein specific)
General Stability (protein specific)
IC50 Value (protein specific)
Inhibitors (protein specific)
Ki Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM] (protein specific)
Localization (protein specific)
Metals/Ions (protein specific)
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Organic Solvent Stability (protein specific)
Oxidation Stability (protein specific)
Posttranslational Modification (protein specific)
Purification (Commentary) (protein specific)
Renatured (Commentary) (protein specific)
Source Tissue (protein specific)
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Storage Stability (protein specific)
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Subunits (protein specific)
Temperature Optimum [°C] (protein specific)
Temperature Range [°C] (protein specific)
Temperature Stability [°C] (protein specific)
Turnover Number [1/s] (protein specific)
pH Optimum (protein specific)
pH Range (protein specific)
pH Stability (protein specific)
pI Value (protein specific)
Expression
General Information
General Information (protein specific)
Expression (protein specific)
kcat/KM [mM/s]
kcat/KM [mM/s] (protein specific)
750809
Ali
Characterization of a fungal ...
uncultured Paecilomyces
Int. J. Biol. Macromol.
121
183-190
2019
-
-
1
-
-
-
10
-
1
1
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5
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1
1
-
-
-
751414
Chaari
Fungal beta-1,3-1,4-glucanase ...
Aspergillus niger, Aspergillus terreus, Laetiporus sulphureus var. miniatus, Malbranchea cinnamomea, Rhizomucor miehei, Rasamsonia emersonii, Trichoderma reesei, Orpinomyces sp. PC-2, Penicillium sp. 'occitanis', Rhizopus microsporus var. microsporus, Paecilomyces sp. 'thermophila', Aspergillus niger US368, Rasamsonia emersonii CBS 841.70, Rhizomucor miehei CAU432, Trichoderma reesei GXC, Penicillium sp. 'occitanis' Pol6, Aspergillus terreus ASKU 10
J. Sci. Food. Agric.
99
2657-2664
2019
-
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9
-
-
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18
-
29
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11
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-
744803
Cho
Immobilization of beta-1,3-1, ...
Bacillus sp. SJ-10
Enzyme Microb. Technol.
110
30-37
2018
-
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1
-
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-
-
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-
745092
Niu
Production of a thermostable ...
Bacillus tequilensis
Int. J. Biol. Macromol.
107
28-34
2018
-
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-
745619
Zalila-Kolsi
-
Heterologous expression and p ...
Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus amyloliquefaciens BLB369
J. Phytopathol.
166
28-33
2018
-
1
2
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-
-
-
749702
Goldenkova-Pavlova
The features that distinguish ...
Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus altitudinis, Paenibacillus barcinonensis, Bacillus pumilus, Paenibacillus barengoltzii, Bacillus velezensis, Hungateiclostridium thermocellum, Bacillus subtilis, Paenibacillus polymyxa, Ruminococcus albus, Bacillus sp. SJ-10, Bacillus tequilensis, Fibrobacter succinogenes, Bacillus circulans, Bacillus licheniformis, Brevibacillus brevis, Rhodothermus marinus, Bacillus sp. N137, Bacillus sp. A3, Paenibacillus macerans, Bacillus subtilis MA139, Bacillus tequilensis CGX5-1, Bacillus circulans ATCC 21367, Bacillus subtilis 168, Ruminococcus albus 8, Hungateiclostridium thermocellum F7, Hungateiclostridium thermocellum NCIMB 10682, Brevibacillus brevis ALK36, Hungateiclostridium thermocellum NBRC 103400, Bacillus velezensis S2, Bacillus altitudinis YC-9, Hungateiclostridium thermocellum ATCC 27405, Bacillus subtilis NCIB 8565, Paenibacillus polymyxa CP7, Hungateiclostridium thermocellum VPI 7372, Rhodothermus marinus ITI378, Bacillus amyloliquefaciens ATCC 23350, Bacillus amyloliquefaciens ATCC 15841, Fibrobacter succinogenes S85, Bacillus pumilus US570, Bacillus subtilis SU40, Paenibacillus barcinonensis BP-23, Hungateiclostridium thermocellum NRRL B-4536, Hungateiclostridium thermocellum DSM 1237
Appl. Microbiol. Biotechnol.
102
3951-3965
2018
-
28
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5
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1
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-
750242
Yan
A novel thermostable beta-1,3 ...
Thermoascus aurantiacus, Thermoascus aurantiacus CAU830
Carbohydr. Res.
469
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2018
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-
-
752108
Bernardi
Functional characterization o ...
Aspergillus fumigatus, Aspergillus fumigatus CBS 101355, Aspergillus fumigatus ATCC MYA-4609, Aspergillus fumigatus Af293, Aspergillus fumigatus FGSC A1100
Protein Expr. Purif.
150
1-11
2018
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Schroeder
Characterization of a theme C ...
uncultured bacterium
Protein J.
37
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2018
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Lee
Improvement of thermostability ...
Bacillus sp. (in: Bacteria), Bacillus sp. (in: Bacteria) KCCM 90078
Int. J. Biol. Macromol.
94
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Bacillus tequilensis
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2820-2830
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Lin
Structural and catalytic roles ...
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Biochim. Biophys. Acta
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231-239
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Abdeev
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Hungateiclostridium thermocellum
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Hong
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Akiyama
Expression of an endo-(1,3;1,4 ...
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Biarnes
Substrate distortion in the Mi ...
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A cel44C-man26A gene of endoph ...
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Celestino
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Isolation and identification o ...
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Purification and characterizat ...
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Gargallo
Study of the influence of temp ...
Bacillus licheniformis
J. Mol. Model.
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835-845
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Yaish
Cold-active winter rye glucana ...
Secale cereale
Plant Physiol.
141
1459-1472
2006
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A truncated Fibrobacter succin ...
Fibrobacter succinogenes
Biochemistry
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How family 26 glycoside hydrol ...
Hungateiclostridium thermocellum
J. Biol. Chem.
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32761-32767
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669736
McCarthy
Comparison of wild-type and UV ...
Rasamsonia emersonii
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125-134
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Bacillus sp. (in: Bacteria)
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223-231
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371
997-1003
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42
13304-13318
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Enzymatic synthesis of 4-methy ...
Rhodothermus marinus
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338
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2003
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607-620
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8759-8766
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363-371
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Presteady-state kinetics of Ba ...
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Directed mutagenesis of specif ...
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Roulin
Reversible accumulation of (1- ...
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J. Exp. Bot.
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Mutant barley (1-3,1-4)-beta-g ...
Hordeum vulgare
Protein Eng.
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Purification, characterization ...
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Jensen
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3487-3491
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Crystal structure and site-dir ...
Paenibacillus macerans
J. Biol. Chem.
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3081-3088
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Crystal structure of Bacillus ...
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FEBS Lett.
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Crystal and molecular structur ...
Bacillus sp. (in: Bacteria)
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Lai
Purification and characterizat ...
Triticum aestivum
Plant Mol. Biol.
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Characterization, cloning and ...
Brevibacillus brevis
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Bacillus amyloliquefaciens
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171544
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Hybrid Bacillus (1-3,1-4)-beta ...
Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus subtilis, Paenibacillus macerans
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1991
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Properties of a thermoactive b ...
Hungateiclostridium thermocellum
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177
447-452
1991
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Hordeum vulgare
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1990
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Borriss
Hybrid Bacillus endo-(1-3,1-4) ...
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54
41-54
1989
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171531
Yamashita
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Hordeum vulgare
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49
1313-1320
1985
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-
171532
Woodward
Purification and chemical prop ...
Hordeum vulgare
Eur. J. Biochem.
121
663-669
1982
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171533
Borriss
Purification and characterizat ...
Bacillus sp. (in: Bacteria)
Z. Allg. Mikrobiol.
21
7-17
1981
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171535
Borriss
beta-1,3-1,4-Glucanase in spor ...
Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus circulans, Bacillus subtilis, Brevibacillus laterosporus, Paenibacillus macerans, Bacillus pumilus, Paenibacillus polymyxa
Zentralbl. Bakteriol. Parasitenkd. Infektionskr. Hyg. , Abt. II
136
63-69
1981
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171534
Borriss
beta-1,3-1,4-Glucanase in spor ...
Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus circulans, Brevibacillus laterosporus, Bacillus pumilus, Paenibacillus polymyxa
Zentralbl. Bakteriol. Parasitenkd. Infektionskr. Hyg. , Abt. II
135
696-703
1980
-
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171536
Suzuki
-
Degradation of barley glucan a ...
Bacillus pumilus
Agric. Biol. Chem.
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577-586
1976
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