BRENDA - Enzyme Database
show all sequences of 3.1.3.26

Expression, gene cloning, and characterization of five novel phytases from four basidiomycete fungi: Peniophora lycii, Agrocybe pediades, a Ceriporia sp., and Trametes pubescens

Lassen, S.F.; Breinholt, J.; Ostergaard, P.R.; Brugger, R.; Bischoff, A.; Wyss, M.; Fuglsang, C.C.; Appl. Environ. Microbiol. 67, 4701-4707 (2001)

Data extracted from this reference:

Cloned(Commentary)
Commentary
Organism
expression in Aspergillus oryzae
Agrocybe pediades
expression in Aspergillus oryzae
Ceriporia sp.
expression in Aspergillus oryzae
Trametes pubescens
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight Maximum [Da]
Commentary
Organism
54000
-
x * 54000, SDS-PAGE
Ceriporia sp.
59000
-
x * 59000, SDS-PAGE
Agrocybe pediades
59000
-
x * 59000, SDS-PAGE
Ceriporia sp.
62000
-
x * 62000, SDS-PAGE
Trametes pubescens
72000
-
x * 72000, SDS-PAGE
Peniophora lycii
Organism
Organism
Primary Accession No. (UniProt)
Commentary
Textmining
Agrocybe pediades
Q96VT0
-
-
Ceriporia sp.
Q96VK8
-
-
Ceriporia sp.
Q96VK9
-
-
Peniophora lycii
Q96VH9
-
-
Trametes pubescens
Q96VF5
-
-
Posttranslational Modification
Posttranslational Modification
Commentary
Organism
glycoprotein
6 potential glycosylation sites
Agrocybe pediades
glycoprotein
7 potential glycosylation sites; 8 potential glycosylation sites
Ceriporia sp.
glycoprotein
10 potential glycosylation sites
Peniophora lycii
glycoprotein
9 potential glycosylation sites
Trametes pubescens
Purification (Commentary)
Commentary
Organism
recombinant enzyme
Agrocybe pediades
recombinant enzyme
Ceriporia sp.
recombinant enzyme
Trametes pubescens
Specific Activity [micromol/min/mg]
Specific Activity Minimum [µmol/min/mg]
Specific Activity Maximum [µmol/min/mg]
Commentary
Organism
400
-
-
Agrocybe pediades
700
-
-
Ceriporia sp.
1040
-
-
Ceriporia sp.
1080
-
-
Peniophora lycii
1210
-
-
Trametes pubescens
Substrates and Products (Substrate)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
myo-inositol hexakisphosphate + H2O
-
649367
Agrocybe pediades
? + phosphate
-
649367
Agrocybe pediades
?
myo-inositol hexakisphosphate + H2O
-
649367
Ceriporia sp.
? + phosphate
-
649367
Ceriporia sp.
?
myo-inositol hexakisphosphate + H2O
-
649367
Trametes pubescens
? + phosphate
-
649367
Trametes pubescens
?
myo-inositol hexakisphosphate + H2O
-
649367
Peniophora lycii
? + phosphate
-
649367
Peniophora lycii
?
Subunits
Subunits
Commentary
Organism
?
x * 59000, SDS-PAGE
Agrocybe pediades
?
x * 54000, SDS-PAGE; x * 59000, SDS-PAGE
Ceriporia sp.
?
x * 72000, SDS-PAGE
Peniophora lycii
?
x * 62000, SDS-PAGE
Trametes pubescens
Temperature Optimum [°C]
Temperature Optimum [°C]
Temperature Optimum Maximum [°C]
Commentary
Organism
40
45
-
Ceriporia sp.
40
45
-
Trametes pubescens
50
55
-
Peniophora lycii
50
-
-
Agrocybe pediades
55
60
-
Ceriporia sp.
Temperature Stability [°C]
Temperature Stability Minimum [°C]
Temperature Stability Maximum [°C]
Commentary
Organism
80
-
pH 5.5, 60 min,53% loss of activity
Agrocybe pediades
80
-
pH 5.5, 60 min, 62% loss of activity; pH 5.5, 60 min, 78% loss of activity
Ceriporia sp.
80
-
pH 5.5, 60 min, 38% loss of activity
Peniophora lycii
80
-
pH 5.5, 60 min, 85% loss of activity
Trametes pubescens
pH Optimum
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
4
4.5
-
Peniophora lycii
5
5.5
-
Trametes pubescens
5
6
-
Agrocybe pediades
5
6
-
Ceriporia sp.
5.5
6
-
Ceriporia sp.
pI Value
Organism
Commentary
pI Value Maximum
pI Value
Trametes pubescens
isoelectric focusing
-
3.58
Peniophora lycii
isoelectric focusing
-
3.61
Peniophora lycii
calculation from amino acid sequence
-
4.35
Trametes pubescens
calculation from amino acid sequence
-
4.4
Ceriporia sp.
calculation from amino acid sequence
-
4.64
Agrocybe pediades
calculation from amino acid sequence
-
5
Ceriporia sp.
calculation from amino acid sequence
-
6.4
Cloned(Commentary) (protein specific)
Commentary
Organism
expression in Aspergillus oryzae
Agrocybe pediades
expression in Aspergillus oryzae
Ceriporia sp.
expression in Aspergillus oryzae
Trametes pubescens
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight Maximum [Da]
Commentary
Organism
54000
-
x * 54000, SDS-PAGE
Ceriporia sp.
59000
-
x * 59000, SDS-PAGE
Agrocybe pediades
59000
-
x * 59000, SDS-PAGE
Ceriporia sp.
62000
-
x * 62000, SDS-PAGE
Trametes pubescens
72000
-
x * 72000, SDS-PAGE
Peniophora lycii
Posttranslational Modification (protein specific)
Posttranslational Modification
Commentary
Organism
glycoprotein
6 potential glycosylation sites
Agrocybe pediades
glycoprotein
7 potential glycosylation sites; 8 potential glycosylation sites
Ceriporia sp.
glycoprotein
10 potential glycosylation sites
Peniophora lycii
glycoprotein
9 potential glycosylation sites
Trametes pubescens
Purification (Commentary) (protein specific)
Commentary
Organism
recombinant enzyme
Agrocybe pediades
recombinant enzyme
Ceriporia sp.
recombinant enzyme
Trametes pubescens
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Specific Activity Minimum [µmol/min/mg]
Specific Activity Maximum [µmol/min/mg]
Commentary
Organism
400
-
-
Agrocybe pediades
700
-
-
Ceriporia sp.
1040
-
-
Ceriporia sp.
1080
-
-
Peniophora lycii
1210
-
-
Trametes pubescens
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
myo-inositol hexakisphosphate + H2O
-
649367
Agrocybe pediades
? + phosphate
-
649367
Agrocybe pediades
?
myo-inositol hexakisphosphate + H2O
-
649367
Ceriporia sp.
? + phosphate
-
649367
Ceriporia sp.
?
myo-inositol hexakisphosphate + H2O
-
649367
Trametes pubescens
? + phosphate
-
649367
Trametes pubescens
?
myo-inositol hexakisphosphate + H2O
-
649367
Peniophora lycii
? + phosphate
-
649367
Peniophora lycii
?
Subunits (protein specific)
Subunits
Commentary
Organism
?
x * 59000, SDS-PAGE
Agrocybe pediades
?
x * 54000, SDS-PAGE; x * 59000, SDS-PAGE
Ceriporia sp.
?
x * 72000, SDS-PAGE
Peniophora lycii
?
x * 62000, SDS-PAGE
Trametes pubescens
Temperature Optimum [°C] (protein specific)
Temperature Optimum [°C]
Temperature Optimum Maximum [°C]
Commentary
Organism
40
45
-
Ceriporia sp.
40
45
-
Trametes pubescens
50
55
-
Peniophora lycii
50
-
-
Agrocybe pediades
55
60
-
Ceriporia sp.
Temperature Stability [°C] (protein specific)
Temperature Stability Minimum [°C]
Temperature Stability Maximum [°C]
Commentary
Organism
80
-
pH 5.5, 60 min,53% loss of activity
Agrocybe pediades
80
-
pH 5.5, 60 min, 62% loss of activity; pH 5.5, 60 min, 78% loss of activity
Ceriporia sp.
80
-
pH 5.5, 60 min, 38% loss of activity
Peniophora lycii
80
-
pH 5.5, 60 min, 85% loss of activity
Trametes pubescens
pH Optimum (protein specific)
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
4
4.5
-
Peniophora lycii
5
5.5
-
Trametes pubescens
5
6
-
Agrocybe pediades
5
6
-
Ceriporia sp.
5.5
6
-
Ceriporia sp.
pI Value (protein specific)
Organism
Commentary
pI Value Maximum
pI Value
Trametes pubescens
isoelectric focusing
-
3.58
Peniophora lycii
isoelectric focusing
-
3.61
Peniophora lycii
calculation from amino acid sequence
-
4.35
Trametes pubescens
calculation from amino acid sequence
-
4.4
Ceriporia sp.
calculation from amino acid sequence
-
4.64
Agrocybe pediades
calculation from amino acid sequence
-
5
Ceriporia sp.
calculation from amino acid sequence
-
6.4
Other publictions for EC 3.1.3.26
No.
1st author
Pub Med
title
organims
journal
volume
pages
year
Activating Compound
Application
Cloned(Commentary)
Crystallization (Commentary)
Engineering
General Stability
Inhibitors
KM Value [mM]
Localization
Metals/Ions
Molecular Weight [Da]
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Organic Solvent Stability
Organism
Oxidation Stability
Posttranslational Modification
Purification (Commentary)
Reaction
Renatured (Commentary)
Source Tissue
Specific Activity [micromol/min/mg]
Storage Stability
Substrates and Products (Substrate)
Subunits
Temperature Optimum [°C]
Temperature Range [°C]
Temperature Stability [°C]
Turnover Number [1/s]
pH Optimum
pH Range
pH Stability
Cofactor
Ki Value [mM]
pI Value
IC50 Value
Activating Compound (protein specific)
Application (protein specific)
Cloned(Commentary) (protein specific)
Cofactor (protein specific)
Crystallization (Commentary) (protein specific)
Engineering (protein specific)
General Stability (protein specific)
IC50 Value (protein specific)
Inhibitors (protein specific)
Ki Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM] (protein specific)
Localization (protein specific)
Metals/Ions (protein specific)
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Organic Solvent Stability (protein specific)
Oxidation Stability (protein specific)
Posttranslational Modification (protein specific)
Purification (Commentary) (protein specific)
Renatured (Commentary) (protein specific)
Source Tissue (protein specific)
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Storage Stability (protein specific)
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Subunits (protein specific)
Temperature Optimum [°C] (protein specific)
Temperature Range [°C] (protein specific)
Temperature Stability [°C] (protein specific)
Turnover Number [1/s] (protein specific)
pH Optimum (protein specific)
pH Range (protein specific)
pH Stability (protein specific)
pI Value (protein specific)
Expression
General Information
General Information (protein specific)
Expression (protein specific)
KCat/KM [mM/s]
KCat/KM [mM/s] (protein specific)
751528
Fakhravar
Rational design-based enginee ...
Escherichia coli
Mol. Biol. Rep.
45
2053-2061
2018
-
-
1
-
1
-
-
1
1
-
-
1
-
3
-
-
-
-
-
-
-
-
2
-
1
1
-
-
2
-
-
-
-
-
-
-
-
1
-
-
1
-
-
-
-
1
1
-
-
1
-
-
-
-
-
-
-
-
2
-
1
1
-
-
2
-
-
-
-
-
-
-
-
-
751544
Demir
Purification and biochemical ...
Lactobacillus coryniformis, Lactobacillus coryniformis MH121153
Mol. Biotechnol.
60
783-790
2018
-
-
-
-
-
-
1
1
-
2
-
2
-
4
-
-
1
-
-
-
1
-
6
1
1
-
1
-
1
-
1
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
1
-
1
-
2
-
2
-
-
-
1
-
-
1
-
6
1
1
-
1
-
1
-
1
-
-
1
1
-
-
-
750168
Pal Roy
A novel extracellular low-tem ...
Bacillus aryabhattai, Bacillus aryabhattai RS1
Biotechnol. Prog.
33
633-641
2017
-
-
1
-
-
-
6
-
1
2
-
2
-
6
-
-
1
-
-
-
1
-
6
1
1
1
1
-
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1
-
-
-
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-
-
-
1
-
-
-
-
-
6
-
-
1
2
-
2
-
-
-
1
-
-
1
-
6
1
1
1
1
-
1
1
-
-
-
-
-
-
-
-
751837
Holme
-
Barley HvPAPhy_a as transgene ...
Hordeum vulgare
Plant Biotechnol. J.
15
415-422
2017
-
-
1
-
1
-
1
-
-
-
-
1
-
1
-
1
-
-
-
7
-
-
2
-
1
-
-
-
1
-
-
-
-
-
-
-
-
1
-
-
1
-
-
1
-
-
-
-
-
1
-
-
1
-
-
7
-
-
2
-
1
-
-
-
1
-
-
-
-
-
-
-
-
-
751972
Tsang
Candida albicans orf19.3727 e ...
Candida albicans, Candida albicans ATCC MYA-2876
PLoS ONE
12
e0189219
2017
-
-
1
-
1
-
-
-
1
-
-
-
-
5
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
1
-
-
1
-
-
-
-
-
1
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
2
2
-
-
-
752223
Niu
Engineering the residual side ...
Yersinia kristensenii, Yersinia rohdei
Sci. Rep.
7
42133
2017
-
-
2
-
17
-
2
-
-
-
-
2
-
7
-
-
2
-
-
-
-
-
4
-
2
-
-
-
2
-
-
-
-
-
-
-
-
2
-
-
17
-
-
2
-
-
-
-
-
2
-
-
-
2
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-
-
-
4
-
2
-
-
-
2
-
-
-
-
1
1
-
-
-
750074
Chanderman
Production, characteristics a ...
Enterobacter sp. ACSS
Bioprocess Biosyst. Eng.
39
1577-1587
2016
-
1
-
-
-
-
13
2
-
3
1
1
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-
-
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-
-
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-
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13
-
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1
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-
-
1
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-
1
1
750848
Garcia-Mantrana
Expression of bifidobacterial ...
Bifidobacterium longum subsp. infantis, Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697, Bifidobacterium longum subsp. infantis DSM 20088, Bifidobacterium longum subsp. infantis JCM 1222, Bifidobacterium longum subsp. infantis NCTC 11817, Bifidobacterium longum subsp. infantis S12, Bifidobacterium pseudocatenulatum, Bifidobacterium pseudocatenulatum ATCC 27919
Int. J. Food Microbiol.
216
18-24
2016
-
2
2
-
-
-
-
-
2
-
-
16
-
11
-
-
-
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-
24
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2
-
-
-
2
-
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-
2
2
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-
2
-
-
16
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-
-
-
-
-
-
-
24
1
2
-
-
-
2
-
-
-
-
-
-
-
-
-
751304
Tan
Enhancing the thermal resista ...
uncultured bacterium
J. Microbiol. Biotechnol.
26
1717-1722
2016
-
-
1
-
1
-
9
2
-
3
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3
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1
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9
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2
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1
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1
2
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-
4
-
1
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-
-
1
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-
-
-
751361
Mootapally
Mining of ruminant microbial ...
Prevotella ruminicola
J. Mol. Microbiol. Biotechnol.
26
252-260
2016
1
1
1
-
-
-
6
2
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-
1
1
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-
1
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-
-
-
751936
Pal Roy
Cloning and expression of phy ...
Shigella sp. CD2
PLoS ONE
11
e0145745
2016
-
-
1
-
-
-
5
2
1
3
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1
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1
1
-
-
-
-
-
-
2
2
750851
Cizeikiene
Phytase activity of lactic ac ...
Pediococcus pentosaceus
Int. J. Food Sci. Nutr.
66
736-742
2015
-
1
-
-
-
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-
-
1
-
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1
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-
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-
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-
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-
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-
-
-
750979
Yu
Purification and characteriza ...
Rhodotorula mucilaginosa, Rhodotorula mucilaginosa JMUY14
J. Basic Microbiol.
55
1029-1039
2015
2
2
1
-
-
-
8
2
1
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2
-
5
-
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1
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1
1
-
6
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2
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1
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Kim
Purification, sequencing and ...
Penicillium oxalicum, Penicillium oxalicum KCTC6440
J. Gen. Appl. Microbiol.
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Graminho
Purification, biochemical cha ...
Burkholderia sp. a13(2014), Burkholderia sp. a13(2014) JCM 30421
J. Gen. Appl. Microbiol.
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Tan
Cloning, overexpression, and ...
uncultured bacterium
J. Microbiol. Biotechnol.
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Ribeiro Correa
Cloning, recombinant expressi ...
Penicillium chrysogenum, Penicillium chrysogenum CCT 1273
Microbiol. Res.
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Lee
Characterization, gene clonin ...
Penicillium oxalicum, Penicillium oxalicum PJ3
Prep. Biochem. Biotechnol.
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Wang
Overexpression of phyA and app ...
Escherichia coli
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e60801
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730734
Ariza
Degradation of phytate by the ...
Hafnia alvei, Yersinia kristensenii
PLoS ONE
8
e65062
2013
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713900
Fu
Catalytic efficiency of HAP ph ...
Escherichia coli
Appl. Microbiol. Biotechnol.
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Dionisio
Cloning and characterization o ...
Oryza sativa Japonica Group, Oryza sativa Japonica Group Himalaya
Plant Physiol.
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1087-1100
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Huang
Gene diversity of beta-propell ...
Brevundimonas sp. Gc-2-c
Appl. Environ. Microbiol.
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Promdonkoy
Expression and characterizatio ...
Aspergillus japonicus, Aspergillus niger
FEMS Microbiol. Lett.
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Watanabe
Cloning and characterization o ...
Cyberlindnera fabianii, Cyberlindnera fabianii J640
J. Biosci. Bioeng.
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Ragon
Molecular gene cloning and ove ...
Debaryomyces castellii
Protein Expr. Purif.
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Phytase production by a marine ...
Kodamaea ohmeri
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Fu
Bacillus phytases: present sce ...
Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus licheniformis, Bacillus sp. (in: Bacteria), Bacillus sp. (in: Bacteria) KHU-10, Bacillus subtilis, Sporolactobacillus laevolacticus
Appl. Biochem. Biotechnol.
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Assembly of mutations for impr ...
Escherichia coli
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A novel phytase from Yersinia ...
Yersinia pestis, Yersinia rohdei
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High levels of stable phytase ...
Aspergillus niger
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Shedova
Phytase activity and its regul ...
Serratia plymuthica, Serratia plymuthica IC1270
Folia Microbiol. (Praha)
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Pavlova
Phytase from antarctic yeast s ...
Papiliotrema laurentii, Papiliotrema laurentii AL27
Folia Microbiol. (Praha)
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Phytic acid, phytase, minerals ...
Phaseolus vulgaris
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Salt effect on the pH profile ...
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Ullah
Unfolding and refolding of Asp ...
Aspergillus niger
J. Agric. Food Chem.
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Cloning and expression of Baci ...
Bacillus sp. (in: Bacteria)
J. Appl. Microbiol.
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Singh
Phytase production by Sporotri ...
Thermothelomyces heterothallicus
J. Appl. Microbiol.
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Correia
Vanadate substituted phytase: ...
Peniophora lycii
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693595
Shao
Cloning, expression, and chara ...
Pectobacterium wasabiae
J. Microbiol. Biotechnol.
18
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Identification and characteriz ...
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651559
Greiner
Purification and characterizat ...
Lupinus albus
J. Agric. Food Chem.
50
6858-6864
2002
-
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45
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649367
Lassen
Expression, gene cloning, and ...
Agrocybe pediades, Ceriporia sp., Peniophora lycii, Trametes pubescens
Appl. Environ. Microbiol.
67
4701-4707
2001
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-
650092
Oh
Calcium-dependent catalytic ac ...
Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus amyloliquefaciens S11
Biochemistry
40
9669-9676
2001
-
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1
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650687
Vohra
-
Phytase production by the yeas ...
Wickerhamomyces anomalus
Biotechnol. Lett.
23
551-554
2001
-
1
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652197
Padmanabhan
High affinity association of m ...
Vigna radiata
J. Biol. Chem.
276
43635-43644
2001
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652594
Jermutus
Structure-based chimeric enzym ...
Aspergillus niger, Aspergillus terreus, Aspergillus terreus 9A-1
J. Biotechnol.
85
15-24
2001
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653032
Choi
Purification and properties of ...
Bacillus sp. (in: Bacteria), Bacillus sp. (in: Bacteria) KHU-10
J. Protein Chem.
20
287-292
2001
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653480
Richardson
Extracellular secretion of Asp ...
Arabidopsis thaliana, Aspergillus niger
Plant J.
25
641-649
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653518
Hegeman
A novel phytase with sequence ...
Glycine max
Plant Physiol.
126
1598-1608
2001
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653933
Shin
Enzyme mechanism and catalytic ...
Bacillus subtilis
Structure
9
851-858
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114250
Rodriguez
Expression of the Aspergillus ...
Aspergillus fumigatus
Biochem. Biophys. Res. Commun.
268
373-378
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649552
Ullah
Biochemical characterization o ...
Aspergillus ficuum, Aspergillus fumigatus
Biochem. Biophys. Res. Commun.
275
279-285
2000
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650754
D'Silva
Localization of phytase in Sel ...
Mitsuokella multacida, Mitsuokella multacida 46/5(2), Selenomonas ruminantium, Selenomonas ruminantium JY35
Can. J. Microbiol.
46
391-395
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651266
Tomschy
Active site residue 297 of Asp ...
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FEBS Lett.
472
169-172
2000
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651384
Tseng
Isolation and characterization ...
Penicillium simplicissimum
FEMS Microbiol. Rev.
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653826
Tomschy
Optimization of the catalytic ...
Aspergillus fumigatus
Protein Sci.
9
1304-1311
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Purification and characterizat ...
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Greiner
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Purification and properties of ...
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Mahajan
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Nonchemical approach for reduc ...
Brassica rapa subsp. oleifera
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45
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Maize root phytase. Purificati ...
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Iqbal
Phytase activity in the human ...
Homo sapiens, Rattus norvegicus
Gut
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Greiner
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94803
Yang
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Rattus norvegicus
Biochim. Biophys. Acta
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75-82
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Houde
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Purification and characterizat ...
Brassica sp.
J. Food Biochem.
14
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Gibson
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Glycine max, Hordeum vulgare
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260
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Baldi
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Lilium longiflorum
Plant Sci.
56
137-147
1988
-
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The phytases. I. Lysolecithin- ...
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250
155-164
1971
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