BRENDA - Enzyme Database
show all sequences of 2.4.1.1

Purification and characterization of a cytosolic starch phosphorylase from etiolated rice seedlings

Hsu, J.H.; Yang, C.C.; Su, J.C.; Lee, P.D.; Bot. Bull. Acad. Sin. 45, 187-196 (2004)
No PubMed abstract available

Data extracted from this reference:

Activating Compound
Activating Compound
Commentary
Organism
Structure
2-mercaptoethanol
slight activation
Oryza sativa
DTT
slight activation
Oryza sativa
glutathione
slight activation
Oryza sativa
L-cysteine
slight activation
Oryza sativa
Inhibitors
Inhibitors
Commentary
Organism
Structure
ADP-glucose
strong inhibition
Oryza sativa
AMP
slight inhibition
Oryza sativa
Cyclodextrins
-
Oryza sativa
D-fructose 6-phosphate
strong inhibition
Oryza sativa
D-mannose 1-phosphate
strong inhibition
Oryza sativa
IMP
slight inhibition
Oryza sativa
additional information
no or poor inhibition by ribose 5-phosphate, glucose 6-phosphate, fructose-1,6-bisphosphate, ADP and UDP
Oryza sativa
UDP-glucose
strong inhibition
Oryza sativa
KM Value [mM]
KM Value [mM]
KM Value Maximum [mM]
Substrate
Commentary
Organism
Structure
0.0046
-
amylopectin
pH 5.5, 37°C, synthesis reaction
Oryza sativa
0.0106
-
soluble starch
pH 5.5, 37°C, synthesis reaction
Oryza sativa
0.0138
-
glycogen
pH 5.5, 37°C, synthesis reaction
Oryza sativa
0.0261
-
soluble starch
pH 5.5, 37°C, synthesis reaction
Oryza sativa
0.0418
-
Dextrin
pH 5.5, 37°C, synthesis reaction
Oryza sativa
2.1
-
alpha-D-glucose 1-phosphate
pH 5.5, 37°C, synthesis reaction
Oryza sativa
Localization
Localization
Commentary
Organism
GeneOntology No.
Textmining
cytosol
-
Oryza sativa
5829
-
Metals/Ions
Metals/Ions
Commentary
Organism
Structure
additional information
not affected by Na+, K+, Mg2+, Ca2+
Oryza sativa
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Natural Substrates
Organism
Commentary (Nat. Sub.)
Natural Products
Commentary (Nat. Pro.)
Organism (Nat. Pro.)
Reversibility
(1,4-alpha-D-glucosyl)n + phosphate
Oryza sativa
polysaccharide substrate is starch, phosphorolysis is the physiologic reaction of the starch degrading enzyme
(1,4-alpha-D-glucosyl)n-1 + alpha-D-glucose 1-phosphate
-
-
r
Organism
Organism
Primary Accession No. (UniProt)
Commentary
Textmining
Oryza sativa
-
cv. Tainong 67, enzyme Pho1
-
Purification (Commentary)
Commentary
Organism
from seedlings, 299fold to homogeneity by protamine sulfate and ammonium sulfate fractionation, anion exchange chromatography, and dextrin affinity chromatography
Oryza sativa
Source Tissue
Source Tissue
Commentary
Organism
Textmining
seedling
etiolated, low enzyme content
Oryza sativa
-
Specific Activity [micromol/min/mg]
Specific Activity Minimum [µmol/min/mg]
Specific Activity Maximum [µmol/min/mg]
Commentary
Organism
additional information
-
substrate specificity
Oryza sativa
1.8
-
purified enzyme
Oryza sativa
Storage Stability
Storage Stability
Organism
purified enzyme in 50 mM imidazole, pH 7.0, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, at 4°C, at least 2 weeks stable
Oryza sativa
Substrates and Products (Substrate)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
(1,4-alpha-D-glucosyl)n + phosphate
polysaccharide substrate is starch, phosphorolysis is the physiologic reaction of the starch degrading enzyme
658355
Oryza sativa
(1,4-alpha-D-glucosyl)n-1 + alpha-D-glucose 1-phosphate
-
-
-
r
(1,4-alpha-D-glucosyl)n + phosphate
polysaccharide substrates are soluble starch and Zulkowsky soluble starch, amylopectin, glycogen, and dextrin, amyylopectin is the best substrate
658355
Oryza sativa
(1,4-alpha-D-glucosyl)n-1 + alpha-D-glucose 1-phosphate
-
-
-
r
dextrin + alpha-D-glucose 1-phosphate
-
658355
Oryza sativa
dextrin + phosphate
-
-
-
-
maltodecaose + alpha-D-glucose 1-phosphate
low activity
658355
Oryza sativa
? + phosphate
-
-
-
r
maltoheptaose + alpha-D-glucose 1-phosphate
low activity
658355
Oryza sativa
maltooctaose + phosphate
-
-
-
r
maltohexaose + alpha-D-glucose 1-phosphate
low activity
658355
Oryza sativa
maltoheptaose + phosphate
-
-
-
r
maltononaose + alpha-D-glucose 1-phosphate
low activity
658355
Oryza sativa
maltodecaose + phosphate
-
-
-
r
maltooctaose + alpha-D-glucose 1-phosphate
low activity
658355
Oryza sativa
maltononaose + phosphate
-
-
-
r
maltopentaose + alpha-D-glucose 1-phosphate
-
658355
Oryza sativa
maltohexaose + phosphate
-
-
-
r
maltotetraose + alpha-D-glucose 1-phosphate
-
658355
Oryza sativa
maltopentaose + phosphate
-
-
-
r
additional information
substrate specificity, no or nearly no activity with glucose, maltose, and maltotriose, overview
658355
Oryza sativa
?
-
-
-
-
Temperature Optimum [°C]
Temperature Optimum [°C]
Temperature Optimum Maximum [°C]
Commentary
Organism
45
50
-
Oryza sativa
pH Optimum
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
5
-
synthesis reaction
Oryza sativa
6
-
assay at, phosphorolysis reaction
Oryza sativa
pH Stability
pH Stability
pH Stability Maximum
Commentary
Organism
7
-
most stable at
Oryza sativa
Activating Compound (protein specific)
Activating Compound
Commentary
Organism
Structure
2-mercaptoethanol
slight activation
Oryza sativa
DTT
slight activation
Oryza sativa
glutathione
slight activation
Oryza sativa
L-cysteine
slight activation
Oryza sativa
Inhibitors (protein specific)
Inhibitors
Commentary
Organism
Structure
ADP-glucose
strong inhibition
Oryza sativa
AMP
slight inhibition
Oryza sativa
Cyclodextrins
-
Oryza sativa
D-fructose 6-phosphate
strong inhibition
Oryza sativa
D-mannose 1-phosphate
strong inhibition
Oryza sativa
IMP
slight inhibition
Oryza sativa
additional information
no or poor inhibition by ribose 5-phosphate, glucose 6-phosphate, fructose-1,6-bisphosphate, ADP and UDP
Oryza sativa
UDP-glucose
strong inhibition
Oryza sativa
KM Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM]
KM Value Maximum [mM]
Substrate
Commentary
Organism
Structure
0.0046
-
amylopectin
pH 5.5, 37°C, synthesis reaction
Oryza sativa
0.0106
-
soluble starch
pH 5.5, 37°C, synthesis reaction
Oryza sativa
0.0138
-
glycogen
pH 5.5, 37°C, synthesis reaction
Oryza sativa
0.0261
-
soluble starch
pH 5.5, 37°C, synthesis reaction
Oryza sativa
0.0418
-
Dextrin
pH 5.5, 37°C, synthesis reaction
Oryza sativa
2.1
-
alpha-D-glucose 1-phosphate
pH 5.5, 37°C, synthesis reaction
Oryza sativa
Localization (protein specific)
Localization
Commentary
Organism
GeneOntology No.
Textmining
cytosol
-
Oryza sativa
5829
-
Metals/Ions (protein specific)
Metals/Ions
Commentary
Organism
Structure
additional information
not affected by Na+, K+, Mg2+, Ca2+
Oryza sativa
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Natural Substrates
Organism
Commentary (Nat. Sub.)
Natural Products
Commentary (Nat. Pro.)
Organism (Nat. Pro.)
Reversibility
(1,4-alpha-D-glucosyl)n + phosphate
Oryza sativa
polysaccharide substrate is starch, phosphorolysis is the physiologic reaction of the starch degrading enzyme
(1,4-alpha-D-glucosyl)n-1 + alpha-D-glucose 1-phosphate
-
-
r
Purification (Commentary) (protein specific)
Commentary
Organism
from seedlings, 299fold to homogeneity by protamine sulfate and ammonium sulfate fractionation, anion exchange chromatography, and dextrin affinity chromatography
Oryza sativa
Source Tissue (protein specific)
Source Tissue
Commentary
Organism
Textmining
seedling
etiolated, low enzyme content
Oryza sativa
-
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Specific Activity Minimum [µmol/min/mg]
Specific Activity Maximum [µmol/min/mg]
Commentary
Organism
additional information
-
substrate specificity
Oryza sativa
1.8
-
purified enzyme
Oryza sativa
Storage Stability (protein specific)
Storage Stability
Organism
purified enzyme in 50 mM imidazole, pH 7.0, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, at 4°C, at least 2 weeks stable
Oryza sativa
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
(1,4-alpha-D-glucosyl)n + phosphate
polysaccharide substrate is starch, phosphorolysis is the physiologic reaction of the starch degrading enzyme
658355
Oryza sativa
(1,4-alpha-D-glucosyl)n-1 + alpha-D-glucose 1-phosphate
-
-
-
r
(1,4-alpha-D-glucosyl)n + phosphate
polysaccharide substrates are soluble starch and Zulkowsky soluble starch, amylopectin, glycogen, and dextrin, amyylopectin is the best substrate
658355
Oryza sativa
(1,4-alpha-D-glucosyl)n-1 + alpha-D-glucose 1-phosphate
-
-
-
r
dextrin + alpha-D-glucose 1-phosphate
-
658355
Oryza sativa
dextrin + phosphate
-
-
-
-
maltodecaose + alpha-D-glucose 1-phosphate
low activity
658355
Oryza sativa
? + phosphate
-
-
-
r
maltoheptaose + alpha-D-glucose 1-phosphate
low activity
658355
Oryza sativa
maltooctaose + phosphate
-
-
-
r
maltohexaose + alpha-D-glucose 1-phosphate
low activity
658355
Oryza sativa
maltoheptaose + phosphate
-
-
-
r
maltononaose + alpha-D-glucose 1-phosphate
low activity
658355
Oryza sativa
maltodecaose + phosphate
-
-
-
r
maltooctaose + alpha-D-glucose 1-phosphate
low activity
658355
Oryza sativa
maltononaose + phosphate
-
-
-
r
maltopentaose + alpha-D-glucose 1-phosphate
-
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Oryza sativa
maltohexaose + phosphate
-
-
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r
maltotetraose + alpha-D-glucose 1-phosphate
-
658355
Oryza sativa
maltopentaose + phosphate
-
-
-
r
additional information
substrate specificity, no or nearly no activity with glucose, maltose, and maltotriose, overview
658355
Oryza sativa
?
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Temperature Optimum [°C] (protein specific)
Temperature Optimum [°C]
Temperature Optimum Maximum [°C]
Commentary
Organism
45
50
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Oryza sativa
pH Optimum (protein specific)
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
5
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synthesis reaction
Oryza sativa
6
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assay at, phosphorolysis reaction
Oryza sativa
pH Stability (protein specific)
pH Stability
pH Stability Maximum
Commentary
Organism
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most stable at
Oryza sativa
Other publictions for EC 2.4.1.1
No.
1st author
Pub Med
title
organims
journal
volume
pages
year
Activating Compound
Application
Cloned(Commentary)
Crystallization (Commentary)
Engineering
General Stability
Inhibitors
KM Value [mM]
Localization
Metals/Ions
Molecular Weight [Da]
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Organic Solvent Stability
Organism
Oxidation Stability
Posttranslational Modification
Purification (Commentary)
Reaction
Renatured (Commentary)
Source Tissue
Specific Activity [micromol/min/mg]
Storage Stability
Substrates and Products (Substrate)
Subunits
Temperature Optimum [°C]
Temperature Range [°C]
Temperature Stability [°C]
Turnover Number [1/s]
pH Optimum
pH Range
pH Stability
Cofactor
Ki Value [mM]
pI Value
IC50 Value
Activating Compound (protein specific)
Application (protein specific)
Cloned(Commentary) (protein specific)
Cofactor (protein specific)
Crystallization (Commentary) (protein specific)
Engineering (protein specific)
General Stability (protein specific)
IC50 Value (protein specific)
Inhibitors (protein specific)
Ki Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM] (protein specific)
Localization (protein specific)
Metals/Ions (protein specific)
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Organic Solvent Stability (protein specific)
Oxidation Stability (protein specific)
Posttranslational Modification (protein specific)
Purification (Commentary) (protein specific)
Renatured (Commentary) (protein specific)
Source Tissue (protein specific)
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Storage Stability (protein specific)
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Subunits (protein specific)
Temperature Optimum [°C] (protein specific)
Temperature Range [°C] (protein specific)
Temperature Stability [°C] (protein specific)
Turnover Number [1/s] (protein specific)
pH Optimum (protein specific)
pH Range (protein specific)
pH Stability (protein specific)
pI Value (protein specific)
Expression
General Information
General Information (protein specific)
Expression (protein specific)
KCat/KM [mM/s]
KCat/KM [mM/s] (protein specific)
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Bokor
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Oryctolagus cuniculus
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Bokor
C-(2-Deoxy-d-arabino-hex-1-eno ...
Oryctolagus cuniculus
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Kyriakis
Natural flavonoids as antidiab ...
Oryctolagus cuniculus
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Properties and functions of th ...
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Structure based inhibitor desi ...
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Synthesis, enzyme kinetics and ...
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The binding of C5-alkynyl and ...
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721071
Tite
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Synthesis of N-aryl spiro-sulf ...
Oryctolagus cuniculus
Tetrahedron Lett.
53
959-961
2012
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Liang
Identification of pentacyclic ...
Oryctolagus cuniculus
Eur. J. Med. Chem.
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Vornanen
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Oryctolagus cuniculus
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Orthophosphate binding at the ...
Corynebacterium callunae
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Discovery of a series of indan ...
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Ye
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Sharov
Inactivation of rabbit muscle ...
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'Short-chain' alpha-1,4-glucan ...
Saccharolobus solfataricus
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Azospirillum brasilense
FEMS Microbiol. Lett.
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Sensitive assay of glycogen ph ...
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Probing multivalency for the i ...
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Enzymes as biomarkers of cyper ...
Clarias batrachus
Toxicol. Mech. Methods
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Campagnolo
X-ray studies on ternary compl ...
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Inhibition of the interaction ...
Rattus norvegicus
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Loughlin
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Oryctolagus cuniculus
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Amino acid anthranilamide deri ...
Homo sapiens
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Immunocytochemical analysis of ...
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Synthesis of 5-chloro-N-aryl-1 ...
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Structure and properties of Th ...
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488298
Oluoha
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Alpha-glucan phosphorylase fro ...
Xanthosoma sagittifolium
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9
37-48
1999
2
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488299
Watson
Phosphorylase recognition and ...
Escherichia coli
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18
4619-4632
1999
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1996
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Affinity purification and kine ...
Pisum sativum
Phytochemistry
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Van Marrewijk
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Isolation and partial characte ...
Locusta migratoria
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Yeast glycogen phosphorylase: ...
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Inhibiton of alpha-amylase and ...
Oryctolagus cuniculus, Saccharomyces cerevisiae, Solanum tuberosum
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Purification and properties of ...
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-
488272
Pan
Starch phosphorylase inhibitor ...
Ipomoea batatas
Plant Physiol.
88
1154-1156
1988
-
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-
488231
Hata
-
Purification and properties of ...
Mizuhopecten yessoensis
Comp. Biochem. Physiol. B
87
747-753
1987
1
-
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1
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-
-
488232
Vaandrager
-
Kinetic properties of glycogen ...
Locusta migratoria
Insect Biochem.
17
695-700
1987
-
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-
-
488243
Sambandam
Purification and properties of ...
Phymatotrichopsis omnivora, Phymatotrichopsis omnivora Shear Dugg
Arch. Biochem. Biophys.
254
579-585
1987
-
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17
1
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-
-
488248
Cloutier
Glycogen phosphorylase in Dict ...
Dictyostelium discoideum
J. Biol. Chem.
262
9486-9493
1987
1
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-
-
488253
Tanabe
-
Yeast glycogen phosphorylase: ...
Saccharomyces cerevisiae
Agric. Biol. Chem.
51
2465-2471
1987
2
-
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-
-
-
488273
Chang
-
Sweet potato starch phosphoryl ...
Ipomoea batatas
Agric. Biol. Chem.
51
187-195
1987
-
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-
488287
Vereb
Kinetic characterization of ra ...
Oryctolagus cuniculus
Biochim. Biophys. Acta
915
19-27
1987
4
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-
488267
Conrads
-
Non-chloroplast alpha-1,4-gluc ...
Pisum sativum
Biochim. Biophys. Acta
882
452-463
1986
-
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-
488271
Chang
Starch phosphorylase inhibitor ...
Ipomoea batatas
Plant Physiol.
80
534-538
1986
-
-
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488233
Kumar
-
Partial purification and chara ...
Elephantopus scaber
Indian J. Plant Physiol.
27
209-213
1984
-
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-
488234
Kumar
Starch phosphorylase from tapi ...
Manihot esculenta
Indian J. Biochem. Biophys.
21
241-247
1984
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-
488281
Berndt
Isolation and partial characte ...
Rattus norvegicus
Arch. Biochem. Biophys.
228
143-154
1984
3
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488235
Thomas
Purification & properties of g ...
Sepia pharaonis
Indian J. Biochem. Biophys.
20
198-202
1983
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488250
Becker
Purification and properties of ...
Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces pastorianus
Arch. Biochem. Biophys.
225
667-678
1983
2
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488255
Nakamura
-
Characteristics of alpha-gluca ...
Chlorella vulgaris
Phytochemistry
22
835-840
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488256
Nakamura
-
Characterization of Chlorella ...
Chlorella vulgaris
Phytochemistry
22
2395-2399
1983
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488266
Kruger
-
Properties of alpha-glucan pho ...
Pisum sativum
Phytochemistry
22
1891-1898
1983
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488259
Kumar
Purification and physicochemic ...
Musa x paradisiaca
Biochemistry
21
4152-4159
1982
3
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488275
Sivak
Studies on potato tuber phosph ...
Solanum tuberosum
Arch. Biochem. Biophys.
212
525-536
1981
1
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-
-
488276
Sivak
Studies on potato tuber phosph ...
Solanum tuberosum
Arch. Biochem. Biophys.
212
537-545
1981
-
-
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488262
Preiss
Characterization of the spinac ...
Spinacia oleracea
Plant Physiol.
66
864-869
1980
-
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488263
Steup
Purification of a non-chloropl ...
Spinacia oleracea
Planta
148
168-173
1980
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488242
Nader
1,4-alpha-Glucan phosphorylase ...
Physarum polycephalum, Physarum polycephalum M3c
Eur. J. Biochem.
102
345-355
1979
1
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488244
Cuppoletti
Glycogen phosphorylase from Ne ...
Neurospora crassa
J. Bacteriol.
139
411-417
1979
1
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488260
Umezurike
Some properties of starch phos ...
Voandzeia subterranea
Biochim. Biophys. Acta
567
331-338
1979
4
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488249
Foda
Properties and kinetics of glu ...
Papiliotrema laurentii
Z. Allg. Mikrobiol.
18
95-106
1978
-
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