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Purification and properties of NADP+-dependent glutamate dehydrogenase from Nitrobacter hamburgensis strain X14

Weining, S.; Nicholas, D.J.D.; Phytochemistry 26, 2151-2153 (1987)
No PubMed abstract available

Data extracted from this reference:

Inhibitors
Inhibitors
Commentary
Organism
Structure
fumarate
at 20 mM 30% inhibition
Nitrobacter hamburgensis
glyoxylate
at 20 mM, 30% inhibition
Nitrobacter hamburgensis
malate
at 20 mM, 30% inhibition
Nitrobacter hamburgensis
oxaloacetate
at 20 mM, 60% inhibition
Nitrobacter hamburgensis
KM Value [mM]
KM Value [mM]
KM Value Maximum [mM]
Substrate
Commentary
Organism
Structure
5
-
2-oxoglutarate
reductive amination
Nitrobacter hamburgensis
9
-
NH4+
reductive amination
Nitrobacter hamburgensis
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight Maximum [Da]
Commentary
Organism
48000
-
alpha6, 6 * 48000, SDS-PAGE
Nitrobacter hamburgensis
310000
-
gel filtration
Nitrobacter hamburgensis
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Natural Substrates
Organism
Commentary (Nat. Sub.)
Natural Products
Commentary (Nat. Pro.)
Organism (Nat. Pro.)
Reversibility
L-glutamate + NADP+ + H2O
Nitrobacter hamburgensis
-
2-oxoglutarate + NADPH + NH3
-
-
r
L-glutamate + NADP+ + H2O
Nitrobacter hamburgensis X14
-
2-oxoglutarate + NADPH + NH3
-
-
r
Organism
Organism
Primary Accession No. (UniProt)
Commentary
Textmining
Nitrobacter hamburgensis
-
-
-
Nitrobacter hamburgensis X14
-
-
-
Purification (Commentary)
Commentary
Organism
-
Nitrobacter hamburgensis
Specific Activity [micromol/min/mg]
Specific Activity Minimum [Ámol/min/mg]
Specific Activity Maximum [Ámol/min/mg]
Commentary
Organism
9.2
-
reductive amination
Nitrobacter hamburgensis
Substrates and Products (Substrate)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
2-oxoglutarate + NH4+ + NADPH
-
391672
Nitrobacter hamburgensis
L-glutamate + NADP+
-
-
-
-
2-oxoglutarate + NH4+ + NADPH
-
391672
Nitrobacter hamburgensis X14
L-glutamate + NADP+
-
-
-
-
L-glutamate + NADP+ + H2O
-
391672
Nitrobacter hamburgensis
2-oxoglutarate + NADPH + NH3
-
-
-
r
L-glutamate + NADP+ + H2O
-
391672
Nitrobacter hamburgensis
2-oxoglutarate + NADPH + NH3
-
391672
Nitrobacter hamburgensis
r
L-glutamate + NADP+ + H2O
-
391672
Nitrobacter hamburgensis X14
2-oxoglutarate + NADPH + NH3
-
-
-
r
L-glutamate + NADP+ + H2O
-
391672
Nitrobacter hamburgensis X14
2-oxoglutarate + NADPH + NH3
-
391672
Nitrobacter hamburgensis X14
r
Subunits
Subunits
Commentary
Organism
homohexamer
alpha6, 6 * 48000, SDS-PAGE
Nitrobacter hamburgensis
pH Optimum
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
7.5
-
reductive amination
Nitrobacter hamburgensis
Cofactor
Cofactor
Commentary
Organism
Structure
NADP+
-
Nitrobacter hamburgensis
NADPH
-
Nitrobacter hamburgensis
Cofactor (protein specific)
Cofactor
Commentary
Organism
Structure
NADP+
-
Nitrobacter hamburgensis
NADPH
-
Nitrobacter hamburgensis
Inhibitors (protein specific)
Inhibitors
Commentary
Organism
Structure
fumarate
at 20 mM 30% inhibition
Nitrobacter hamburgensis
glyoxylate
at 20 mM, 30% inhibition
Nitrobacter hamburgensis
malate
at 20 mM, 30% inhibition
Nitrobacter hamburgensis
oxaloacetate
at 20 mM, 60% inhibition
Nitrobacter hamburgensis
KM Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM]
KM Value Maximum [mM]
Substrate
Commentary
Organism
Structure
5
-
2-oxoglutarate
reductive amination
Nitrobacter hamburgensis
9
-
NH4+
reductive amination
Nitrobacter hamburgensis
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight Maximum [Da]
Commentary
Organism
48000
-
alpha6, 6 * 48000, SDS-PAGE
Nitrobacter hamburgensis
310000
-
gel filtration
Nitrobacter hamburgensis
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Natural Substrates
Organism
Commentary (Nat. Sub.)
Natural Products
Commentary (Nat. Pro.)
Organism (Nat. Pro.)
Reversibility
L-glutamate + NADP+ + H2O
Nitrobacter hamburgensis
-
2-oxoglutarate + NADPH + NH3
-
-
r
L-glutamate + NADP+ + H2O
Nitrobacter hamburgensis X14
-
2-oxoglutarate + NADPH + NH3
-
-
r
Purification (Commentary) (protein specific)
Commentary
Organism
-
Nitrobacter hamburgensis
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Specific Activity Minimum [Ámol/min/mg]
Specific Activity Maximum [Ámol/min/mg]
Commentary
Organism
9.2
-
reductive amination
Nitrobacter hamburgensis
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
2-oxoglutarate + NH4+ + NADPH
-
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Nitrobacter hamburgensis
L-glutamate + NADP+
-
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-
2-oxoglutarate + NH4+ + NADPH
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Nitrobacter hamburgensis X14
L-glutamate + NADP+
-
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L-glutamate + NADP+ + H2O
-
391672
Nitrobacter hamburgensis
2-oxoglutarate + NADPH + NH3
-
-
-
r
L-glutamate + NADP+ + H2O
-
391672
Nitrobacter hamburgensis
2-oxoglutarate + NADPH + NH3
-
391672
Nitrobacter hamburgensis
r
L-glutamate + NADP+ + H2O
-
391672
Nitrobacter hamburgensis X14
2-oxoglutarate + NADPH + NH3
-
-
-
r
L-glutamate + NADP+ + H2O
-
391672
Nitrobacter hamburgensis X14
2-oxoglutarate + NADPH + NH3
-
391672
Nitrobacter hamburgensis X14
r
Subunits (protein specific)
Subunits
Commentary
Organism
homohexamer
alpha6, 6 * 48000, SDS-PAGE
Nitrobacter hamburgensis
pH Optimum (protein specific)
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
7.5
-
reductive amination
Nitrobacter hamburgensis
Other publictions for EC 1.4.1.4
No.
1st author
Pub Med
title
organims
journal
volume
pages
year
Activating Compound
Application
Cloned(Commentary)
Crystallization (Commentary)
Engineering
General Stability
Inhibitors
KM Value [mM]
Localization
Metals/Ions
Molecular Weight [Da]
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Organic Solvent Stability
Organism
Oxidation Stability
Posttranslational Modification
Purification (Commentary)
Reaction
Renatured (Commentary)
Source Tissue
Specific Activity [micromol/min/mg]
Storage Stability
Substrates and Products (Substrate)
Subunits
Temperature Optimum [░C]
Temperature Range [░C]
Temperature Stability [░C]
Turnover Number [1/s]
pH Optimum
pH Range
pH Stability
Cofactor
Ki Value [mM]
pI Value
IC50 Value
Activating Compound (protein specific)
Application (protein specific)
Cloned(Commentary) (protein specific)
Cofactor (protein specific)
Crystallization (Commentary) (protein specific)
Engineering (protein specific)
General Stability (protein specific)
IC50 Value (protein specific)
Inhibitors (protein specific)
Ki Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM] (protein specific)
Localization (protein specific)
Metals/Ions (protein specific)
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Organic Solvent Stability (protein specific)
Oxidation Stability (protein specific)
Posttranslational Modification (protein specific)
Purification (Commentary) (protein specific)
Renatured (Commentary) (protein specific)
Source Tissue (protein specific)
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Storage Stability (protein specific)
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Subunits (protein specific)
Temperature Optimum [░C] (protein specific)
Temperature Range [░C] (protein specific)
Temperature Stability [░C] (protein specific)
Turnover Number [1/s] (protein specific)
pH Optimum (protein specific)
pH Range (protein specific)
pH Stability (protein specific)
pI Value (protein specific)
Expression
General Information
General Information (protein specific)
Expression (protein specific)
KCat/KM [mM/s]
KCat/KM [mM/s] (protein specific)
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Zhu
Purification and characteriza ...
Geotrichum candidum, Geotrichum candidum S12
AMB Express
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Geng
Reengineering substrate speci ...
Escherichia coli
Biotechnol. Lett.
39
599-605
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Tian
Glutamate dehydrogenase (RocG ...
Bacillus licheniformis, Bacillus licheniformis WX-02
Enzyme Microb. Technol.
99
9-15
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Tomita
Crystal structure of the 2-im ...
Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium glutamicum ATCC 13869
FEBS Lett.
591
1611-1622
2017
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743256
Campero-Basaldua
Diversification of the kineti ...
Lachancea kluyveri, Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces cerevisiae CLA1
MicrobiologyOpen
6
e00419
2017
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743258
Campero-Basaldua
Diversification of the kineti ...
Kluyveromyces lactis
MicrobiologyOpen
6
doi: 10.1002/mbo3.419
2017
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741537
Oliveira
Crystal structure of a chimae ...
Escherichia coli
Acta Crystallogr. Sect. F
72
462-466
2016
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743532
Zhang
-
Introduction of a fungal NADP ...
Aspergillus niger
Plant Prod. Sci.
19
267-278
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Son
Structural insights into doma ...
Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium glutamicum ATCC 13032
Biochem. Biophys. Res. Commun.
459
387-392
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743232
Ballester-Tomas
Redox engineering by ectopic ...
Saccharomyces cerevisiae
Microb. Cell Fact.
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Prakash
Purification, crystallization ...
Aspergillus niger
Acta Crystallogr. Sect. F
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743643
Walvekar
Mixed disulfide formation at ...
Aspergillus niger
PLoS ONE
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Wakamatsu
Biochemical characterization o ...
Pyrobaculum calidifontis, Pyrobaculum calidifontis JCM 11548
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Escherichia coli
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Garcia-Galan
Stabilization of the hexameri ...
Escherichia coli
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742464
Wakamatsu
Biochemical characterization ...
Pyrobaculum calidifontis, Pyrobaculum calidifontis JCM 11548
Extremophiles
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2013
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Regulation of the NADP-glutam ...
Aspergillus nidulans, Aspergillus nidulans ATCC 38163
Microbiology
159
2467-2480
2013
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Involvement of GDH3-encoded NA ...
Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces cerevisiae BY4741
J. Biol. Chem.
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13C-metabolic enrichment of gl ...
Saccharomyces cerevisiae
Microbiol. Res.
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Glutamate dehydrogenase and gl ...
Mycolicibacterium smegmatis
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De Angelis
NADP-glutamate dehydrogenase a ...
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Vamsee-Krishna
Bypassing isophthalate inhibit ...
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Changes in nitrogen assimilati ...
Aspergillus niger
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Flocculation of dimorphic yeas ...
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Xanthophyllomyces dendrorhous
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A computational analysis of th ...
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NADP-dependent glutamate dehyd ...
Cenococcum geophilum, Cenococcum geophilum H5-3, Hebeloma bulbiferum, Hebeloma cylindrosporum, Laccaria amethystina, Laccaria bicolor, Laccaria bicolor S238N, no activity in Amanita citrina, no activity in Amanita muscaria, no activity in Amanita muscaria MAN, no activity in Boletus edulis, no activity in Boletus edulis Hub 0, no activity in Lactarius quietus, no activity in Lactarius subdulcis, no activity in Lactarius subdulcis BRI 2, no activity in Paxillus involutus, no activity in Pisolithus tinctorius, no activity in Pisolithus tinctorius 441, no activity in Rhizopogon luteolus, no activity in Rhizopogon luteolus SERRE, no activity in Scleroderma citrinum, no activity in Scleroderma citrinum Foug A, no activity in Suillus bovinus, no activity in Suillus bovinus LED 1, no activity in Thelephora terrestris, no activity in Thelephora terrestris CHA, no activity in Tricholoma populinum, no activity in Tricholoma populinum BLAE, no activity in Xerocomus chrysenteron, Tuber borchii
New Phytol.
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The discovery of four distinct ...
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The crystal structure of Plasm ...
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675825
Noor
Allosteric NADP-glutamate dehy ...
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Microbiology
151
1409-1419
2005
6
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654211
Amin
Morphology-associated expressi ...
Benjaminiella poitrasii
Antonie van Leeuwenhoek
85
327-334
2004
-
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655305
Alba-Lois
NADP-glutamate dehydrogenase a ...
Debaryomyces hansenii, Debaryomyces hansenii Y7426
Curr. Microbiol.
48
68-72
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656832
Pagliarulo
Regulation and differential ex ...
Neisseria meningitidis
Mol. Microbiol.
51
1757-1772
2004
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de Morais
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The NADP+-dependent glutamate ...
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34
334-338
2003
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656573
Ha
-
Thermostable glutamate dehydro ...
Symbiobacterium toebii
J. Mol. Catal. B
26
231-240
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657021
Lawit
Heterologous expression of cDN ...
Chlorella sorokiniana
Plant Mol. Biol.
52
605-616
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657101
Kisaka
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Transgenic tomato plant carryi ...
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164
35-42
2003
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66
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2002
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654633
Lebbink
Structural and thermodynamic s ...
Thermotoga maritima
Biochemistry
41
15524-15535
2002
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655253
Camardella
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131A
559-567
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656309
Kim
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J. Biosci. Bioeng.
93
584-588
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726570
Bhuiya
Crystallization and preliminar ...
Aeropyrum pernix, Aeropyrum pernix DSM 11879
Acta Crystallogr. Sect. D
58
1338-1339
2002
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727455
Lee
Extremely thermostable glutama ...
Thermococcus waiotapuensis
Extremophiles
6
151-159
2002
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391639
Robb
Glutamate dehydrogenases from ...
Thermococcus litoralis
Methods Enzymol.
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26-41
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Steen
Isocitrate dehydrogenase, mala ...
Archaeoglobus fulgidus
Methods Enzymol.
331
13-26
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DeLuna
NADP-glutamate dehydrogenase i ...
Saccharomyces cerevisiae
J. Biol. Chem.
276
43775-43783
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Helianti
Characterization of native glu ...
Aeropyrum pernix K1
Appl. Microbiol. Biotechnol.
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Sun
Mechanism of pressure-induced ...
Thermococcus litoralis, Thermococcus litoralis DSM 5473
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10
1750-1757
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Di Fraia
NADP+-dependent glutamate dehy ...
Escherichia coli, Escherichia coli DH5-alpha, Psychrobacter sp., Psychrobacter sp. TAD1
Eur. J. Biochem.
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Bhuiya
Glutamate dehydrogenase from t ...
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Extremophiles
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Lebbink
Engineering activity and stabi ...
Thermotoga maritima
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723731
Sun
Pressure-induced thermostabili ...
Pyrococcus furiosus
Protein Sci.
8
1056-1063
1999
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391646
Rahman
Ion pairs involved in maintain ...
Thermococcus kodakarensis
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248
920-926
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Park
Giardia intestinalis: characte ...
Giardia intestinalis
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728185
Ferrer
Fluorescence and quenching com ...
Bos taurus, Haloferax mediterranei
J. Photochem. Photobiol. B
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148-154
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391648
Aalen
Purification and properties of ...
Archaeoglobus fulgidus 7324, Archaeoglobus fulgidus
Arch. Microbiol.
168
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1997
2
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-
391649
Inokuchi
An NADP-glutamate dehydrogenas ...
Bryopsis maxima
Plant Cell Physiol.
38
327-335
1997
-
-
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-
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-
-
-
391650
Ferrer
NADP-glutamate dehydrogenase f ...
Haloferax mediterranei, Haloferax mediterranei DSM 1411
FEMS Microbiol. Lett.
141
59-63
1996
2
-
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2
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6
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391651
Koike
NADP-specific glutamate dehydr ...
Bacillus sp. (in: Bacteria), Bacillus sp. (in: Bacteria) KSM-635
Biosci. Biotechnol. Biochem.
60
1764-1767
1996
-
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-
-
391652
Bogati
NADP-specific glutamate dehydr ...
Penicillium chrysogenum, Penicillium chrysogenum NCAIM 00237
J. Basic Microbiol.
36
371-375
1996
-
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2
2
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391653
Krauth-Siegel
Glutathione reductase and glut ...
Plasmodium falciparum
Eur. J. Biochem.
235
345-350
1996
-
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-
726561
Sedelnikova
Crystallization of the glutama ...
Thermococcus litoralis, Thermococcus litoralis DSM 5473
Acta Crystallogr. Sect. D
52
1185-1187
1996
-
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-
1
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8
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391654
Kobayashi
Properties of glutamate dehydr ...
Thermococcus profundus
J. Biochem.
118
587-592
1995
-
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391655
Baars
Purification and characterizat ...
Agaricus bisporus
Curr. Microbiol.
30
211-217
1995
-
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-
391656
Lebbink
Exchange of domains of glutama ...
Clostridioides difficile, Pyrococcus furiosus
Protein Eng.
8
1287-1294
1995
-
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2
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-
286198
Ma
Purification and characterizat ...
Thermococcus litoralis
Appl. Environ. Microbiol.
60
562-568
1994
-
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5
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-
391657
Perysinakis
Biochemical and genetical stud ...
Schizosaccharomyces pombe
Curr. Genet.
26
315-320
1994
-
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-
-
679983
Benachenhou-Lahfa
PCR-mediated cloning and seque ...
Saccharolobus shibatae
Gene
140
17-24
1994
-
-
1
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391659
Korber
Crystallization of the NADP(+) ...
Escherichia coli
J. Mol. Biol.
234
1270-1273
1993
-
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391660
Ohshima
Purification and properties of ...
Pyrococcus furiosus, Pyrococcus woesei
Biosci. Biotechnol. Biochem.
57
945-951
1993
2
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-
391661
Hudson
Glutamate dehydrogenase from t ...
Thermococcus sp.
Biochim. Biophys. Acta
1202
244-250
1993
3
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391662
Lin
Purification and characterizat ...
Escherichia coli
Curr. Microbiol.
22
371-376
1991
-
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-
391663
Pamula
Purification and properties of ...
Dictyostelium discoideum
Mol. Cell. Biochem.
105
85-92
1991
2
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-
-
-
722160
Consalvi
Extremely thermostable glutama ...
Pyrococcus furiosus
Eur. J. Biochem.
202
1189-1196
1991
-
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-
391664
Bonete
Analysis of the kinetic mechan ...
Halobacterium salinarum, Halobacterium salinarum NRC 36014
Biochim. Biophys. Acta
1041
305-310
1990
-
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-
391665
Op den Camp
Purification and characterizat ...
Bacillus fastidiosus
Antonie van Leeuwenhoek
55
303-311
1989
-
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-
-
391666
Vancurova
Purification and properties of ...
Streptomyces fradiae
J. Gen. Microbiol.
135
3311-3318
1989
-
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4
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-
391667
Lilley
-
Purification, chemical modific ...
Escherichia coli, Escherichia coli K2
Biochem. Soc. Trans.
16
876-877
1988
-
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-
-
-
391668
Martinez-Bilbao
Induction, isolation, and some ...
Phormidium laminosum
J. Bacteriol.
170
4897-4902
1988
-
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-
-
391669
Turner
Trichomonas vaginalis: charact ...
Trichomonas vaginalis
Exp. Parasitol.
67
47-53
1988
2
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-
-
-
-
37509
Hatanaka
-
Distribution and some properti ...
Bifidobacterium adolescentis, Bifidobacterium bifidum, Bifidobacterium breve, Bifidobacterium longum, Bifidobacterium longum subsp. infantis, Bifidobacterium pseudolongum, Bifidobacterium thermophilum
Agric. Biol. Chem.
51
251-252
1987
-
-
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3
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12
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27
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1
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-
-
-
-
-
-
391671
Bascomb
Purification and partial kinet ...
Chlorella sorokiniana
Plant Physiol.
83
75-84
1987
-
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1
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-
-
391672
Weining
-
Purification and properties of ...
Nitrobacter hamburgensis, Nitrobacter hamburgensis X14
Phytochemistry
26
2151-2153
1987
-
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-
-
4
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Sakamoto
Glutamate dehydrogenase from E ...
Escherichia coli
J. Bacteriol.
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391687
Epstein
Purification and properties of ...
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1975
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Coulton
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Coulton
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Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium
Can. J. Microbiol.
19
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