BRENDA - Enzyme Database show
show all sequences of 1.18.1.2

Two functionally distinct NADP+-dependent ferredoxin oxidoreductases maintain the primary redox balance of Pyrococcus furiosus

Nguyen, D.M.N.; Schut, G.J.; Zadvornyy, O.A.; Tokmina-Lukaszewska, M.; Poudel, S.; Lipscomb, G.L.; Adams, L.A.; Dinsmore, J.T.; Nixon, W.J.; Boyd, E.S.; Bothner, B.; Peters, J.W.; Adams, M.W.W.; J. Biol. Chem. 292, 14603-14616 (2017)

Data extracted from this reference:

Crystallization (Commentary)
Crystallization
Organism
vapor diffusion method, using 0.22 M magnesium sulfate, 27% (w/v) polyethylene glycol 3350, and 0.4% (v/v) ethyl acetate in the presence of 1 mM sodium dithionite
Pyrococcus furiosus
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight Maximum [Da]
Commentary
Organism
88951
-
mass spectrometry
Pyrococcus furiosus
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Natural Substrates
Organism
Commentary (Nat. Sub.)
Natural Products
Commentary (Nat. Pro.)
Organism (Nat. Pro.)
Reversibility
reduced ferredoxin + NADP+ + H+
Pyrococcus furiosus
-
oxidized ferredoxin + NADPH
-
-
?
reduced ferredoxin + NADP+ + H+
Pyrococcus furiosus COM1
-
oxidized ferredoxin + NADPH
-
-
?
Organism
Organism
Primary Accession No. (UniProt)
Commentary
Textmining
Pyrococcus furiosus
I6TYZ3
-
-
Pyrococcus furiosus COM1
I6TYZ3
-
-
Purification (Commentary)
Commentary
Organism
His-Trap column chromatography, Ni-NTA column chromatography, and S100 gel filtration
Pyrococcus furiosus
Specific Activity [micromol/min/mg]
Specific Activity Minimum [µmol/min/mg]
Specific Activity Maximum [µmol/min/mg]
Commentary
Organism
17
-
after 1fold purification, at pH 7.5 and 80°C
Pyrococcus furiosus
275
-
after 15fold purification, at pH 7.5 and 80°C
Pyrococcus furiosus
Substrates and Products (Substrate)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
additional information
the enzyme does not perform NADH-dependent benzyl viologen reduction
745371
Pyrococcus furiosus
?
-
-
-
-
additional information
the enzyme does not perform NADH-dependent benzyl viologen reduction
745371
Pyrococcus furiosus COM1
?
-
-
-
-
reduced benzyl viologen + NADP+ + H+
-
745371
Pyrococcus furiosus
oxidized benzyl viologen + NADPH
-
-
-
?
reduced benzyl viologen + NADP+ + H+
-
745371
Pyrococcus furiosus COM1
oxidized benzyl viologen + NADPH
-
-
-
?
reduced ferredoxin + NADP+ + H+
-
745371
Pyrococcus furiosus
oxidized ferredoxin + NADPH
-
-
-
?
reduced ferredoxin + NADP+ + H+
-
745371
Pyrococcus furiosus COM1
oxidized ferredoxin + NADPH
-
-
-
?
Subunits
Subunits
Commentary
Organism
heterodimer
1 * 52498 + 1 * 34029, calculated from amino acid sequence
Pyrococcus furiosus
Cofactor
Cofactor
Commentary
Organism
Structure
FAD
-
Pyrococcus furiosus
NADP+
-
Pyrococcus furiosus
[2Fe-2S]-center
-
Pyrococcus furiosus
[4Fe-4S]-center
-
Pyrococcus furiosus
Cofactor (protein specific)
Cofactor
Commentary
Organism
Structure
FAD
-
Pyrococcus furiosus
NADP+
-
Pyrococcus furiosus
[2Fe-2S]-center
-
Pyrococcus furiosus
[4Fe-4S]-center
-
Pyrococcus furiosus
Crystallization (Commentary) (protein specific)
Crystallization
Organism
vapor diffusion method, using 0.22 M magnesium sulfate, 27% (w/v) polyethylene glycol 3350, and 0.4% (v/v) ethyl acetate in the presence of 1 mM sodium dithionite
Pyrococcus furiosus
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight Maximum [Da]
Commentary
Organism
88951
-
mass spectrometry
Pyrococcus furiosus
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Natural Substrates
Organism
Commentary (Nat. Sub.)
Natural Products
Commentary (Nat. Pro.)
Organism (Nat. Pro.)
Reversibility
reduced ferredoxin + NADP+ + H+
Pyrococcus furiosus
-
oxidized ferredoxin + NADPH
-
-
?
reduced ferredoxin + NADP+ + H+
Pyrococcus furiosus COM1
-
oxidized ferredoxin + NADPH
-
-
?
Purification (Commentary) (protein specific)
Commentary
Organism
His-Trap column chromatography, Ni-NTA column chromatography, and S100 gel filtration
Pyrococcus furiosus
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Specific Activity Minimum [µmol/min/mg]
Specific Activity Maximum [µmol/min/mg]
Commentary
Organism
17
-
after 1fold purification, at pH 7.5 and 80°C
Pyrococcus furiosus
275
-
after 15fold purification, at pH 7.5 and 80°C
Pyrococcus furiosus
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
additional information
the enzyme does not perform NADH-dependent benzyl viologen reduction
745371
Pyrococcus furiosus
?
-
-
-
-
additional information
the enzyme does not perform NADH-dependent benzyl viologen reduction
745371
Pyrococcus furiosus COM1
?
-
-
-
-
reduced benzyl viologen + NADP+ + H+
-
745371
Pyrococcus furiosus
oxidized benzyl viologen + NADPH
-
-
-
?
reduced benzyl viologen + NADP+ + H+
-
745371
Pyrococcus furiosus COM1
oxidized benzyl viologen + NADPH
-
-
-
?
reduced ferredoxin + NADP+ + H+
-
745371
Pyrococcus furiosus
oxidized ferredoxin + NADPH
-
-
-
?
reduced ferredoxin + NADP+ + H+
-
745371
Pyrococcus furiosus COM1
oxidized ferredoxin + NADPH
-
-
-
?
Subunits (protein specific)
Subunits
Commentary
Organism
heterodimer
1 * 52498 + 1 * 34029, calculated from amino acid sequence
Pyrococcus furiosus
General Information
General Information
Commentary
Organism
physiological function
the enzyme is important for growth in the presence of sulfur
Pyrococcus furiosus
General Information (protein specific)
General Information
Commentary
Organism
physiological function
the enzyme is important for growth in the presence of sulfur
Pyrococcus furiosus
Other publictions for EC 1.18.1.2
No.
1st author
Pub Med
title
organims
journal
volume
pages
year
Activating Compound
Application
Cloned(Commentary)
Crystallization (Commentary)
Engineering
General Stability
Inhibitors
KM Value [mM]
Localization
Metals/Ions
Molecular Weight [Da]
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Organic Solvent Stability
Organism
Oxidation Stability
Posttranslational Modification
Purification (Commentary)
Reaction
Renatured (Commentary)
Source Tissue
Specific Activity [micromol/min/mg]
Storage Stability
Substrates and Products (Substrate)
Subunits
Temperature Optimum [°C]
Temperature Range [°C]
Temperature Stability [°C]
Turnover Number [1/s]
pH Optimum
pH Range
pH Stability
Cofactor
Ki Value [mM]
pI Value
IC50 Value
Activating Compound (protein specific)
Application (protein specific)
Cloned(Commentary) (protein specific)
Cofactor (protein specific)
Crystallization (Commentary) (protein specific)
Engineering (protein specific)
General Stability (protein specific)
IC50 Value (protein specific)
Inhibitors (protein specific)
Ki Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM] (protein specific)
Localization (protein specific)
Metals/Ions (protein specific)
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Organic Solvent Stability (protein specific)
Oxidation Stability (protein specific)
Posttranslational Modification (protein specific)
Purification (Commentary) (protein specific)
Renatured (Commentary) (protein specific)
Source Tissue (protein specific)
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Storage Stability (protein specific)
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Subunits (protein specific)
Temperature Optimum [°C] (protein specific)
Temperature Range [°C] (protein specific)
Temperature Stability [°C] (protein specific)
Turnover Number [1/s] (protein specific)
pH Optimum (protein specific)
pH Range (protein specific)
pH Stability (protein specific)
pI Value (protein specific)
Expression
General Information
General Information (protein specific)
Expression (protein specific)
KCat/KM [mM/s]
KCat/KM [mM/s] (protein specific)
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Grzyb
Detailed characterization of ...
Synechocystis sp. PCC 6803
Biochim. Biophys. Acta
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Martinez-Julvez
Identification of inhibitors ...
Xanthomonas citri pv. citri
Molecules
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E19
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Seo
C-terminal residues of ferred ...
Chlorobaculum tepidum
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Koskela
Arabidopsis FNRL protein is a ...
Arabidopsis thaliana
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Structural basis for the isot ...
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Kinoshita
Energetic basis on interactio ...
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Vorphal
Molecular and functional char ...
Gracilaria chilensis
Biol. Res.
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Alcantara-Sanchez
Distribution of isoforms of f ...
Synechocystis sp. PCC 6803, Trichormus variabilis
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Nguyen
Two functionally distinct NAD ...
Pyrococcus furiosus, Pyrococcus furiosus COM1
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Mulo
Interaction and electron tran ...
Nostoc sp. PCC 7119, Zea mays
Photosyn. Res.
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745989
Mosebach
Association of ferredoxinNADP ...
Chlamydomonas reinhardtii, Chlamydomonas reinhardtii CC124
Photosyn. Res.
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Boonma
The FinR-regulated essential ...
Pseudomonas aeruginosa
PLoS ONE
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Seo
Kinetics of NADP+/NADPH reduc ...
Chlorobaculum tepidum, Chlorobaculum tepidum ATCC 49652
Photosyn. Res.
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Quaranta
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J. Photochem. Photobiol. B
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Arabidopsis root-type ferredo ...
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FerredoxinNADP(H) oxidoreduct ...
Arabidopsis thaliana
Plant Physiol.
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737758
Saen-Oon
A theoretical multiscale treat ...
Nostoc sp., Nostoc sp. ATCC 29151
Biochim. Biophys. Acta
1847
1530-1538
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Seo
Replacement of Tyr50 stacked o ...
Bacillus subtilis 168, Bacillus subtilis
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Demmer
Insights into flavin-based el ...
Thermotoga maritima
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Sulfurisphaera tokodaii, Sulfurisphaera tokodaii 7
Extremophiles
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Omairi-Nasser
A larger transcript is require ...
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Oryza sativa Japonica Group
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Catalano-Dupuy
A highly stable plastidic-type ...
Leptospira interrogans, Leptospira interrogans 56601
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e26736
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Xanthomonas axonopodis
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Yacoby
Photosynthetic electron partit ...
Chlamydomonas reinhardtii
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
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Singh
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Toxoplasma gondii
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Medina
Docking analysis of transient ...
Anabaena sp.
Proteins
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Tejero
Catalytic mechanism of hydride ...
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79-90
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Kimata-Ariga
Cloning and characterization o ...
Plasmodium falciparum
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421-428
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Cores and pH-dependent dynamic ...
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282
5959-5967
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Rodriguez
Transgenic tobacco plants over ...
Pisum sativum
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Wang
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Molecular characterization of ...
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Dark inactivation of ferredoxi ...
Helianthus annuus
Photosyn. Res.
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Nascimento
Crystallization and preliminar ...
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Acta Crystallogr. Sect. F
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Reduction of the pea ferredoxi ...
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13899-13909
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Pandini
Roles of the species-specific ...
Toxoplasma gondii
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25960-25972
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FAD semiquinone stability regu ...
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144-150
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Identification of the N- and C ...
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The ferredoxin-NADP(H) reducta ...
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Girardini
Schistosoma mansoni: ferredoxi ...
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Shukla
Guanidinium chloride- and urea ...
Mycobacterium tuberculosis
FEBS J.
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2216-2224
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Modulation of cooperativity in ...
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Perez-Dorado
Crystallization and preliminar ...
Rhodobacter capsulatus
Acta Crystallogr. Sect. D
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1696
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658209
Ceccarelli
Functional plasticity and cata ...
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2004
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659639
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Effect of cadmium on ferredoxi ...
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98
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2004
-
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Medina
Interaction of ferredoxin-NADP ...
Anabaena sp., Azotobacter vinelandii, Escherichia coli, Spinacia oleracea
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79
113-131
2004
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660066
Karplus
Structural aspects of plant fe ...
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81
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2004
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A single in vivo-selected poin ...
Toxoplasma gondii
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Gomez-Lojero
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42
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Carrillo
Open questions in ferredoxin-N ...
Anabaena sp., Azotobacter vinelandii, Capsicum annuum, Cyanobacteria, Escherichia coli, Pisum sativum, Rhodobacter capsulatus, Spinacia oleracea, Zea mays
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270
1900-1915
2003
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Teshima
A ferredoxin Arg-Glu pair impo ...
Equisetum arvense
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546
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658718
Bittel
The oxidant-responsive diaphor ...
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553
408-412
2003
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Tejero
Involvement of the pyrophospha ...
Anabaena sp.
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278
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Grzyb
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Effects of amino and thiol gro ...
Spinacia oleracea
Photosynthetica
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627-630
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660092
Bojko
Plastoquinones are effectively ...
Spinacia oleracea
Phytochemistry
64
1055-1060
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Role of positively charged res ...
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41
637-642
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Wan
Electron acceptor specificity ...
Escherichia coli
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406
116-126
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Fischer
Mycobacterium tuberculosis Fpr ...
Mycobacterium tuberculosis
Eur. J. Biochem.
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Faro
Probing the role of glutamic a ...
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Jarrett
Thermal inactivation of reduce ...
Escherichia coli
FEBS Lett.
529
237-242
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Hermoso
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319
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Nakajima
The complete purification and ...
Synechococcus elongatus
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484-493
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Krapp
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184
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276
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Aliverti
Biochemical and crystallograph ...
Spinacia oleracea, Zea mays
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14501-14508
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Mayoral
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Sagara Y.; Watanabe
cDNA cloning, overproduction a ...
Rattus norvegicus
Biochim. Biophys. Acta
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Martinez-Julvez
Role of Arg100 and Arg 264 fro ...
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The crystal structure of NADPH ...
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Structure-function relationshi ...
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285548
Martinez-Julvez
Overexpression in E. coli of t ...
Anabaena sp.
Biochim. Biophys. Acta
1297
200-206
1996
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285553
Bruns C.M.; Karplus P.A.
Refined crystal structure of s ...
Spinacia oleracea
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247
125-145
1995
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285554
Aliverti
Involvement of serine 96 in th ...
Spinacia oleracea
Biochemistry
34
8371-8379
1995
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738503
Bianchi
Interruption of the ferredoxin ...
Escherichia coli
J. Bacteriol.
177
4528-4531
1995
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285544
Bowsher
The purification and propertie ...
Pisum sativum
Protein Expr. Purif.
4
512-518
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285546
Serra
One step purification of plant ...
Pisum sativum
Protein Expr. Purif.
4
539-546
1993
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738149
Medina
Effects of chemical modificati ...
Nostoc sp., Nostoc sp. ATCC 29151
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210
577-583
1992
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Yamazaki
Crystallization and comparativ ...
Ovis aries
Comp. Biochem. Physiol. B
96
93-100
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285479
Aliverti
Expression in Escherichia coli ...
Spinacia oleracea
Eur. J. Biochem.
191
551-555
1990
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285501
Morigasaki
Purification and characterizat ...
Raphanus sativus
Plant Physiol.
93
896-901
1990
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285502
Hirasawa
Characterization of a ferredox ...
Phaseolus vulgaris
Arch. Biochem. Biophys.
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251-258
1990
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285530
Walker
Comparison of the kinetics of ...
Anabaena sp.
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281
76-83
1990
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285532
Gadda
Structure-function relationshi ...
Spinacia oleracea
J. Biol. Chem.
265
11955-11959
1990
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285535
Berzborn
The 'additional' CF0II of the ...
Spinacia oleracea
Z. Naturforsch. C
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772-784
1990
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285539
Shin
Proteolytic degradation of fer ...
Spinacia oleracea
Arch. Biochem. Biophys.
279
97-103
1990
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285534
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Preparation and properties of ...
Trichormus variabilis
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183
539-544
1989
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228-235
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285482
Möller-Zinkhan
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Membrane-bound NADPH dehydroge ...
Desulfobacter postgatei
Arch. Microbiol.
150
145-154
1988
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285503
Levy
Interaction of NADPH and triaz ...
Spinacia oleracea
Biochim. Biophys. Acta
955
236-242
1988
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285504
Zanetti
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Structural studies on the inte ...
Spinacia oleracea
Biochemistry
27
3753-3759
1988
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285506
Sancho
Purification and properties of ...
Trichormus variabilis
Arch. Biochem. Biophys.
260
200-207
1988
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285505
Spano
Purification, properties, and ...
Euglena gracilis
Biochim. Biophys. Acta
894
484-498
1987
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285483
Armstrong
Inhibition of ferredoxin: NADP ...
Spinacia oleracea
Biochem. Biophys. Res. Commun.
141
578-583
1986
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285484
Serrano
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285485
Matthijs
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Spinacia oleracea
J. Biol. Chem.
261
12154-12158
1986
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285507
Gnanaiah
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Sus scrofa
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285508
Serrano
Characterization of cyanobacte ...
Anabaena sp., Anabaena sp. 7119
Anal. Biochem.
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Batie
Association of ferredoxin-NADP ...
Spinacia oleracea
J. Biol. Chem.
261
11214-11223
1986
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Solubilization from spinach th ...
Spinacia oleracea
FEBS Lett.
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Zanetti
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Ferredoxin-NADP+ oxidoreductas ...
Spinacia oleracea
Methods Enzymol.
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285537
Yoon
Purification and properties of ...
Gallus gallus
Methods Enzymol.
67
430-440
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285474
Masaki
Isolation and characterization ...
Arthrospira platensis
J. Biochem.
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285493
Dutton
Multiple isoenzymes of ferredo ...
Pisum sativum
Biochem. Soc. Trans.
7
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285494
Bookjans
Algal ferredoxin-NADP+ reducta ...
Bumilleriopsis filiformis
Z. Naturforsch. C
34
637-640
1979
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