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show all sequences of 1.1.1.42

Cloning, expression and characterization of NADP-dependent isocitrate dehydrogenase from Staphylococcus aureus

Prasad, U.V.; Vasu, D.; Kumar, Y.N.; Kumar, P.S.; Yeswanth, S.; Swarupa, V.; Phaneendra, B.V.; Chaudhary, A.; Sarma, P.V.; Appl. Biochem. Biotechnol. 169, 862-869 (2013)

Data extracted from this reference:

Cloned(Commentary)
Commentary
Organism
gene idh, DNA and amino acid sequence determination and analysis, phylogenetic analysis, recombinant expression of His-tagged enzyme in Escherichia coli strain DH5alpha
Staphylococcus aureus
KM Value [mM]
KM Value [mM]
KM Value Maximum [mM]
Substrate
Commentary
Organism
Structure
0.0082
-
isocitrate
recombinant enzyme, pH 7.5, 30°C
Staphylococcus aureus
0.0675
-
NADP+
recombinant enzyme, pH 7.5, 30°C
Staphylococcus aureus
Localization
Localization
Commentary
Organism
GeneOntology No.
Textmining
cytosol
-
Staphylococcus aureus
5829
-
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight Maximum [Da]
Commentary
Organism
40000
-
x * 40000, SDS-PAGE
Staphylococcus aureus
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Natural Substrates
Organism
Commentary (Nat. Sub.)
Natural Products
Commentary (Nat. Pro.)
Organism (Nat. Pro.)
Reversibility
isocitrate + NADP+
Staphylococcus aureus
-
2-oxoglutarate + CO2 + NADPH + H+
-
-
?
isocitrate + NADP+
Staphylococcus aureus ATCC12600
-
2-oxoglutarate + CO2 + NADPH + H+
-
-
?
Organism
Organism
Primary Accession No. (UniProt)
Commentary
Textmining
Staphylococcus aureus
D7RIE8
-
-
Staphylococcus aureus ATCC12600
D7RIE8
-
-
Purification (Commentary)
Commentary
Organism
recombinant His-tagged enzyme from Escherichia coli strain DH5alpha by nickel affinity chromatography
Staphylococcus aureus
Substrates and Products (Substrate)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
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-
721312
Staphylococcus aureus
2-oxoglutarate + CO2 + NADPH + H+
-
-
-
?
isocitrate + NADP+
-
721312
Staphylococcus aureus ATCC12600
2-oxoglutarate + CO2 + NADPH + H+
-
-
-
?
Subunits
Subunits
Commentary
Organism
?
x * 40000, SDS-PAGE
Staphylococcus aureus
Temperature Optimum [°C]
Temperature Optimum [°C]
Temperature Optimum Maximum [°C]
Commentary
Organism
30
-
assay at
Staphylococcus aureus
pH Optimum
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
7.5
-
assay at
Staphylococcus aureus
Cofactor
Cofactor
Commentary
Organism
Structure
NADP+
dependent on
Staphylococcus aureus
Cloned(Commentary) (protein specific)
Commentary
Organism
gene idh, DNA and amino acid sequence determination and analysis, phylogenetic analysis, recombinant expression of His-tagged enzyme in Escherichia coli strain DH5alpha
Staphylococcus aureus
Cofactor (protein specific)
Cofactor
Commentary
Organism
Structure
NADP+
dependent on
Staphylococcus aureus
KM Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM]
KM Value Maximum [mM]
Substrate
Commentary
Organism
Structure
0.0082
-
isocitrate
recombinant enzyme, pH 7.5, 30°C
Staphylococcus aureus
0.0675
-
NADP+
recombinant enzyme, pH 7.5, 30°C
Staphylococcus aureus
Localization (protein specific)
Localization
Commentary
Organism
GeneOntology No.
Textmining
cytosol
-
Staphylococcus aureus
5829
-
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight Maximum [Da]
Commentary
Organism
40000
-
x * 40000, SDS-PAGE
Staphylococcus aureus
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Natural Substrates
Organism
Commentary (Nat. Sub.)
Natural Products
Commentary (Nat. Pro.)
Organism (Nat. Pro.)
Reversibility
isocitrate + NADP+
Staphylococcus aureus
-
2-oxoglutarate + CO2 + NADPH + H+
-
-
?
isocitrate + NADP+
Staphylococcus aureus ATCC12600
-
2-oxoglutarate + CO2 + NADPH + H+
-
-
?
Purification (Commentary) (protein specific)
Commentary
Organism
recombinant His-tagged enzyme from Escherichia coli strain DH5alpha by nickel affinity chromatography
Staphylococcus aureus
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
isocitrate + NADP+
-
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Staphylococcus aureus
2-oxoglutarate + CO2 + NADPH + H+
-
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?
isocitrate + NADP+
-
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Staphylococcus aureus ATCC12600
2-oxoglutarate + CO2 + NADPH + H+
-
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-
?
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Subunits
Commentary
Organism
?
x * 40000, SDS-PAGE
Staphylococcus aureus
Temperature Optimum [°C] (protein specific)
Temperature Optimum [°C]
Temperature Optimum Maximum [°C]
Commentary
Organism
30
-
assay at
Staphylococcus aureus
pH Optimum (protein specific)
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
7.5
-
assay at
Staphylococcus aureus
General Information
General Information
Commentary
Organism
physiological function
isocitrate dehydrogenase plays pivotal role in the growth and pathogenesis of the bacteria
Staphylococcus aureus
General Information (protein specific)
General Information
Commentary
Organism
physiological function
isocitrate dehydrogenase plays pivotal role in the growth and pathogenesis of the bacteria
Staphylococcus aureus
Other publictions for EC 1.1.1.42
No.
1st author
Pub Med
title
organims
journal
volume
pages
year
Activating Compound
Application
Cloned(Commentary)
Crystallization (Commentary)
Engineering
General Stability
Inhibitors
KM Value [mM]
Localization
Metals/Ions
Molecular Weight [Da]
Natural Substrates/ Products (Substrates)
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Organism
Oxidation Stability
Posttranslational Modification
Purification (Commentary)
Reaction
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Substrates and Products (Substrate)
Subunits
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pH Stability
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Crystallization (Commentary) (protein specific)
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Ki Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM] (protein specific)
Localization (protein specific)
Metals/Ions (protein specific)
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Organic Solvent Stability (protein specific)
Oxidation Stability (protein specific)
Posttranslational Modification (protein specific)
Purification (Commentary) (protein specific)
Renatured (Commentary) (protein specific)
Source Tissue (protein specific)
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Storage Stability (protein specific)
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Subunits (protein specific)
Temperature Optimum [°C] (protein specific)
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Temperature Stability [°C] (protein specific)
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pH Range (protein specific)
pH Stability (protein specific)
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Expression
General Information
General Information (protein specific)
Expression (protein specific)
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KCat/KM [mM/s] (protein specific)
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Prasad
Cloning, expression and charac ...
Staphylococcus aureus, Staphylococcus aureus ATCC12600
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Zhang
Expression and characterizatio ...
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Biochemical characterization o ...
Microcystis aeruginosa, Microcystis aeruginosa PCC 7806
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Deng
Molecular cloning, sequence ch ...
Capsicum annuum, Capsicum annuum CMS-9704A
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Zhang
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Stokke
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Jeong
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Aeropyrum pernix, Aeropyrum pernix DSM 11879
Proteins
55
1087-1089
2004
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2003
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Haraguchi
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Huang
Evaluation by mutagenesis of t ...
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Anderson
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Saccharomyces cerevisiae
Biochemistry
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Doyle
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Pardo
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Phormidium laminosum
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Audette
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Corynebacterium glutamicum
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55
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Corpas
Peroxisomal NADP-dependent iso ...
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Biochemical and phylogenetic c ...
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Ochiai
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Seelig
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Arch. Biochem. Biophys.
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The purification and propertie ...
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Isolation and characterization ...
Bombyx mori
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Macfarlane
Purification and molecular pro ...
Bos taurus
Biochem. Soc. Trans.
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Curry
Purification, properties, and ...
Azotobacter sp., Geobacillus stearothermophilus, Rhodobacter sphaeroides, Sus scrofa, Zea mays
Arch. Biochem. Biophys.
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501-509
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