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Characterization and purification of an aldose from the acidophilic and thermophilic red algae Galdiera sulphuraria

Gross, W.; Seipold, P.; Schnarrenberger, C.; Plant Physiol. 114, 231-236 (1997)

Data extracted from this reference:

KM Value [mM]
KM Value [mM]
KM Value Maximum [mM]
Substrate
Commentary
Organism
Structure
9.6
-
D-fructose
-
Galdieria sulphuraria
22
-
L-sorbose
-
Galdieria sulphuraria
24.8
-
D-tagatose
-
Galdieria sulphuraria
24.9
-
D-xylose-5-phosphate
-
Galdieria sulphuraria
27
-
D-xylose
-
Galdieria sulphuraria
29.1
-
D-ribose-5-phosphate
-
Galdieria sulphuraria
42.9
-
D-galactose
-
Galdieria sulphuraria
47.3
-
D-glucose
-
Galdieria sulphuraria
52.3
-
L-rhamnose
-
Galdieria sulphuraria
53.4
-
D-mannose
-
Galdieria sulphuraria
59.3
-
D-fucose
-
Galdieria sulphuraria
80.7
-
L-fucose
-
Galdieria sulphuraria
120.5
-
Hexanal
-
Galdieria sulphuraria
245
-
L-ribose
-
Galdieria sulphuraria
312.3
-
L-Lyxose
-
Galdieria sulphuraria
370.9
-
D-ribose
-
Galdieria sulphuraria
416.8
-
L-arabinose
-
Galdieria sulphuraria
446.7
-
D-arabinose
-
Galdieria sulphuraria
459.2
-
L-Xylose
-
Galdieria sulphuraria
479.2
-
D-Lyxose
-
Galdieria sulphuraria
730.2
-
DL-glyceraldehyde
-
Galdieria sulphuraria
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight Maximum [Da]
Commentary
Organism
40000
-
2 * 40000, SDS-PAGE
Galdieria sulphuraria
80000
-
gel filtration
Galdieria sulphuraria
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Natural Substrates
Organism
Commentary (Nat. Sub.)
Natural Products
Commentary (Nat. Pro.)
Organism (Nat. Pro.)
Reversibility
pentose + NADPH + H+
Galdieria sulphuraria
with hexoses and sugar phosphates as substrate the activity is 5-10% of that with pentoses
pentiol + NADP+
-
-
r
pentose + NADPH + H+
Galdieria sulphuraria
D-isoforms of pentoses show less than 10% activity compared to the L-isoforms
pentiol + NADP+
-
-
r
Organism
Organism
Primary Accession No. (UniProt)
Commentary
Textmining
Galdieria sulphuraria
-
-
-
Purification (Commentary)
Commentary
Organism
-
Galdieria sulphuraria
Specific Activity [micromol/min/mg]
Specific Activity Minimum [µmol/min/mg]
Specific Activity Maximum [µmol/min/mg]
Commentary
Organism
17.1
-
purified enzyme
Galdieria sulphuraria
Substrates and Products (Substrate)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
D-arabinose + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
arabitol + NADP+
-
-
-
r
D-fructose + NAD(P)H + H+
-
286255
Galdieria sulphuraria
D-arabino-hexitol + NAD(P)+
-
-
-
r
D-fucose + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
fucitol + NADP+
-
-
-
r
D-galactose + NAD(P)H
-
286255
Galdieria sulphuraria
dulcitol + NAD(P)+
-
-
-
r
D-glucose + NAD(P)H
-
286255
Galdieria sulphuraria
sorbitol + NAD(P)+
-
-
-
r
D-lyxose + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
arabitol + NADP+
-
-
-
r
D-mannose NAD(P)H
-
286255
Galdieria sulphuraria
mannitol + NAD(P)+
-
-
-
r
D-ribose + NAD(P)H
-
286255
Galdieria sulphuraria
ribitol + NAD(P)+
-
-
-
r
D-ribose + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
adonitol + NADP+
-
-
-
r
D-ribose 5-phosphate + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
D-ribitol 5-phosphate + NADP+
-
-
-
r
D-tagatose + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
?
-
-
-
r
D-xylose + NAD(P)H
-
286255
Galdieria sulphuraria
xylitol + NAD(P)+
-
-
-
r
D-xylose 5-phosphate + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
D-xylitol 5-phosphate + NADP+
-
-
-
r
DL-glyceraldehyde + NAD(P)H
-
286255
Galdieria sulphuraria
glycerol + NAD(P)+
-
-
-
r
hexanal + NADPH + H+
-
286255
Galdieria sulphuraria
hexanol + NADP+
-
-
-
r
L-arabinose + NAD(P)H
-
286255
Galdieria sulphuraria
L-arabitol + NAD(P)+
-
-
-
r
L-arabinose + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
arabitol + NADP+
-
-
-
r
L-fucose + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
fucitol + NADP+
-
-
-
r
L-lyxose + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
arabitol + NADP+
-
-
-
r
L-rhamnose + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
L-rhamnitol + NADP+
-
-
-
r
L-ribose + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
adonitol + NADP+
-
-
-
r
L-sorbose + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
L-sorbitol + NADP+
-
-
-
r
L-xylose + NAD(P)H
-
286255
Galdieria sulphuraria
L-xylitol + NAD(P)+
-
-
-
r
pentose + NADPH
with hexoses and sugar phosphates as substrate the activity was only 5-10% of that with pentoses
286255
Galdieria sulphuraria
pentitol + NADP+
-
-
-
r
pentose + NADPH + H+
with hexoses and sugar phosphates as substrate the activity is 5-10% of that with pentoses
286255
Galdieria sulphuraria
pentiol + NADP+
-
-
-
r
pentose + NADPH + H+
D-isoforms of pentoses show less than 10% activity compared to the L-isoforms
286255
Galdieria sulphuraria
pentiol + NADP+
-
-
-
r
xylitol + NAD(P)+
-
286255
Galdieria sulphuraria
D-xylose + NAD(P)H + H+
-
-
-
r
Subunits
Subunits
Commentary
Organism
dimer
2 * 40000, SDS-PAGE
Galdieria sulphuraria
pH Optimum
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
6.8
-
-
Galdieria sulphuraria
pH Range
pH Minimum
pH Maximum
Commentary
Organism
5.8
7.6
59% activity at both threshold values
Galdieria sulphuraria
Cofactor
Cofactor
Commentary
Organism
Structure
NADP+
NADP(H) dependent, no activity with NAD(H) in either directions
Galdieria sulphuraria
Cofactor (protein specific)
Cofactor
Commentary
Organism
Structure
NADP+
NADP(H) dependent, no activity with NAD(H) in either directions
Galdieria sulphuraria
KM Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM]
KM Value Maximum [mM]
Substrate
Commentary
Organism
Structure
9.6
-
D-fructose
-
Galdieria sulphuraria
22
-
L-sorbose
-
Galdieria sulphuraria
24.8
-
D-tagatose
-
Galdieria sulphuraria
24.9
-
D-xylose-5-phosphate
-
Galdieria sulphuraria
27
-
D-xylose
-
Galdieria sulphuraria
29.1
-
D-ribose-5-phosphate
-
Galdieria sulphuraria
42.9
-
D-galactose
-
Galdieria sulphuraria
47.3
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D-glucose
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Galdieria sulphuraria
52.3
-
L-rhamnose
-
Galdieria sulphuraria
53.4
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D-mannose
-
Galdieria sulphuraria
59.3
-
D-fucose
-
Galdieria sulphuraria
80.7
-
L-fucose
-
Galdieria sulphuraria
120.5
-
Hexanal
-
Galdieria sulphuraria
245
-
L-ribose
-
Galdieria sulphuraria
312.3
-
L-Lyxose
-
Galdieria sulphuraria
370.9
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D-ribose
-
Galdieria sulphuraria
416.8
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L-arabinose
-
Galdieria sulphuraria
446.7
-
D-arabinose
-
Galdieria sulphuraria
459.2
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L-Xylose
-
Galdieria sulphuraria
479.2
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D-Lyxose
-
Galdieria sulphuraria
730.2
-
DL-glyceraldehyde
-
Galdieria sulphuraria
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Molecular Weight [Da]
Molecular Weight Maximum [Da]
Commentary
Organism
40000
-
2 * 40000, SDS-PAGE
Galdieria sulphuraria
80000
-
gel filtration
Galdieria sulphuraria
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Natural Substrates
Organism
Commentary (Nat. Sub.)
Natural Products
Commentary (Nat. Pro.)
Organism (Nat. Pro.)
Reversibility
pentose + NADPH + H+
Galdieria sulphuraria
with hexoses and sugar phosphates as substrate the activity is 5-10% of that with pentoses
pentiol + NADP+
-
-
r
pentose + NADPH + H+
Galdieria sulphuraria
D-isoforms of pentoses show less than 10% activity compared to the L-isoforms
pentiol + NADP+
-
-
r
Purification (Commentary) (protein specific)
Commentary
Organism
-
Galdieria sulphuraria
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Specific Activity Minimum [µmol/min/mg]
Specific Activity Maximum [µmol/min/mg]
Commentary
Organism
17.1
-
purified enzyme
Galdieria sulphuraria
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Substrates
Commentary Substrates
Literature (Substrates)
Organism
Products
Commentary (Products)
Literature (Products)
Organism (Products)
Reversibility
D-arabinose + NADPH
-
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Galdieria sulphuraria
arabitol + NADP+
-
-
-
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D-fructose + NAD(P)H + H+
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Galdieria sulphuraria
D-arabino-hexitol + NAD(P)+
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286255
Galdieria sulphuraria
fucitol + NADP+
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-
-
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D-galactose + NAD(P)H
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286255
Galdieria sulphuraria
dulcitol + NAD(P)+
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r
D-glucose + NAD(P)H
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286255
Galdieria sulphuraria
sorbitol + NAD(P)+
-
-
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r
D-lyxose + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
arabitol + NADP+
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r
D-mannose NAD(P)H
-
286255
Galdieria sulphuraria
mannitol + NAD(P)+
-
-
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r
D-ribose + NAD(P)H
-
286255
Galdieria sulphuraria
ribitol + NAD(P)+
-
-
-
r
D-ribose + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
adonitol + NADP+
-
-
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r
D-ribose 5-phosphate + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
D-ribitol 5-phosphate + NADP+
-
-
-
r
D-tagatose + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
?
-
-
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r
D-xylose + NAD(P)H
-
286255
Galdieria sulphuraria
xylitol + NAD(P)+
-
-
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r
D-xylose 5-phosphate + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
D-xylitol 5-phosphate + NADP+
-
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r
DL-glyceraldehyde + NAD(P)H
-
286255
Galdieria sulphuraria
glycerol + NAD(P)+
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r
hexanal + NADPH + H+
-
286255
Galdieria sulphuraria
hexanol + NADP+
-
-
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r
L-arabinose + NAD(P)H
-
286255
Galdieria sulphuraria
L-arabitol + NAD(P)+
-
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L-arabinose + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
arabitol + NADP+
-
-
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r
L-fucose + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
fucitol + NADP+
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L-lyxose + NADPH
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Galdieria sulphuraria
arabitol + NADP+
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L-rhamnose + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
L-rhamnitol + NADP+
-
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L-ribose + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
adonitol + NADP+
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L-sorbose + NADPH
-
286255
Galdieria sulphuraria
L-sorbitol + NADP+
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L-xylose + NAD(P)H
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286255
Galdieria sulphuraria
L-xylitol + NAD(P)+
-
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with hexoses and sugar phosphates as substrate the activity was only 5-10% of that with pentoses
286255
Galdieria sulphuraria
pentitol + NADP+
-
-
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r
pentose + NADPH + H+
with hexoses and sugar phosphates as substrate the activity is 5-10% of that with pentoses
286255
Galdieria sulphuraria
pentiol + NADP+
-
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pentose + NADPH + H+
D-isoforms of pentoses show less than 10% activity compared to the L-isoforms
286255
Galdieria sulphuraria
pentiol + NADP+
-
-
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xylitol + NAD(P)+
-
286255
Galdieria sulphuraria
D-xylose + NAD(P)H + H+
-
-
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Subunits (protein specific)
Subunits
Commentary
Organism
dimer
2 * 40000, SDS-PAGE
Galdieria sulphuraria
pH Optimum (protein specific)
pH Optimum Minimum
pH Optimum Maximum
Commentary
Organism
6.8
-
-
Galdieria sulphuraria
pH Range (protein specific)
pH Minimum
pH Maximum
Commentary
Organism
5.8
7.6
59% activity at both threshold values
Galdieria sulphuraria
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No.
1st author
Pub Med
title
organims
journal
volume
pages
year
Activating Compound
Application
Cloned(Commentary)
Crystallization (Commentary)
Engineering
General Stability
Inhibitors
KM Value [mM]
Localization
Metals/Ions
Molecular Weight [Da]
Natural Substrates/ Products (Substrates)
Organic Solvent Stability
Organism
Oxidation Stability
Posttranslational Modification
Purification (Commentary)
Reaction
Renatured (Commentary)
Source Tissue
Specific Activity [micromol/min/mg]
Storage Stability
Substrates and Products (Substrate)
Subunits
Temperature Optimum [°C]
Temperature Range [°C]
Temperature Stability [°C]
Turnover Number [1/s]
pH Optimum
pH Range
pH Stability
Cofactor
Ki Value [mM]
pI Value
IC50 Value
Activating Compound (protein specific)
Application (protein specific)
Cloned(Commentary) (protein specific)
Cofactor (protein specific)
Crystallization (Commentary) (protein specific)
Engineering (protein specific)
General Stability (protein specific)
IC50 Value (protein specific)
Inhibitors (protein specific)
Ki Value [mM] (protein specific)
KM Value [mM] (protein specific)
Localization (protein specific)
Metals/Ions (protein specific)
Molecular Weight [Da] (protein specific)
Natural Substrates/ Products (Substrates) (protein specific)
Organic Solvent Stability (protein specific)
Oxidation Stability (protein specific)
Posttranslational Modification (protein specific)
Purification (Commentary) (protein specific)
Renatured (Commentary) (protein specific)
Source Tissue (protein specific)
Specific Activity [micromol/min/mg] (protein specific)
Storage Stability (protein specific)
Substrates and Products (Substrate) (protein specific)
Subunits (protein specific)
Temperature Optimum [°C] (protein specific)
Temperature Range [°C] (protein specific)
Temperature Stability [°C] (protein specific)
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pH Optimum (protein specific)
pH Range (protein specific)
pH Stability (protein specific)
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Expression
General Information
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Expression (protein specific)
KCat/KM [mM/s]
KCat/KM [mM/s] (protein specific)
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Zheng
Both adhE and a separate NADPH ...
Thermoanaerobacterium saccharolyticum, Thermoanaerobacterium saccharolyticum LL1049
J. Bacteriol.
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Pterin-7-carboxamides as a new ...
Homo sapiens
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Design and synthesis of chiral ...
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Bos taurus, Homo sapiens
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Kim
Inhibition of aldose reductase ...
Rattus norvegicus
Biol. Pharm. Bull.
33
1605-1609
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711356
Lee
Aldose reductase inhibitory co ...
Homo sapiens, Rattus norvegicus
Biol. Pharm. Bull.
33
917-921
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Kato
6,7-Dihydroxy-4-phenylcoumarin ...
Rattus norvegicus
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Pegklidou
Design and synthesis of novel ...
Rattus norvegicus
Bioorg. Med. Chem.
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Maccari
Identification of new non-carb ...
Bos taurus
Bioorg. Med. Chem.
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4049-4055
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Aldose reductase regulates vas ...
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Carbone
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Homo sapiens
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Evaluation of the aldose reduc ...
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Crystallization and preliminar ...
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Acta Crystallogr. Sect. F
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de Sousa
Structural and kinetic charact ...
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Aldose reductase protects agai ...
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Hyperglycemia regulates RUNX2 ...
Homo sapiens
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Application of newly available ...
Saccharomyces cerevisiae
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The activity of xylose reducta ...
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656836
Chang
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Mol. Pharmacol.
61
1184-1191
2002
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286258
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Structural and functional prop ...
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Chem. Biol. Interact.
130-132
583-595
2001
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Mayr
D-Xylose metabolism by Candida ...
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Gross
Characterization and purificat ...
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Neuhauser
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326
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413-420
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Bohren
Tyrosine-48 is the proton dono ...
Homo sapiens
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Inazu
Purification and properties of ...
Rattus norvegicus
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Aldose reductase catalysis and ...
Homo sapiens
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Negm
Purification and properties of ...
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Purification and properties of ...
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Aldose and aldehyde reductases ...
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